ИОГен РАН | Публикации

Ру En

Публикации

Главная

ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ

Публикации

Динамика публикационной активности

Показатели публикационной активности ИОГен РАН

Показатели публикационной активности ИОГен РАН по данным Elibrary

Перейти на Elibrary

С 2017 по 2021 год

развернуть

Название показателя	2017	2018	2019	2020	2021
Число публикаций на портале elibrary.ru	235	291	332	203	241
Число публикаций в РИНЦ	232	281	318	198	219
Число публикаций, входящих в ядро РИНЦ	168	217	182	155	182
Число статей в журналах	179	220	196	170	195
Число статей в журналах, входящих в Web of Science или Scopus	150	157	164	136	150
Число статей в журналах, входящих в RSCI	90	124	77	65	70
Число статей в журналах, входящих в перечень ВАК	108	146	103	85	104
Число монографий	0	0	1	0	0
Число патентов	0	0	0	0	0
Число публикаций с участием зарубежных авторов	55	44	49	48	55
Число цитирований на elibrary.ru	5767	5501	5594	6123	5839
Число цитирований в РИНЦ	5338	5434	5560	6040	5766
Число цитирований в ядре РИНЦ	4508	4688	4796	5320	5079
Число цитирований из ядра РИНЦ	4583	4785	4866	5379	5170
Число цитирований статей за последние 5 лет	2135	2384	2470	2293	2142
Средневзвешенный импакт-фактор журналов, в которых были опубликованы статьи	2,628	1,98	2,37	2,723	2,808
Число авторов публикаций на elibrary.ru	244	263	251	203	193
Число авторов публикаций в РИНЦ	242	260	249	201	188
Число авторов публикаций, входящих в ядро РИНЦ	202	239	213	183	173
Число авторов статей в журналах	212	242	216	188	178
Число авторов статей в журналах Web of Science или Scopus	192	205	210	174	168
Число авторов статей в RSCI	145	171	126	115	109
Число авторов статей в журналах ВАК	172	197	144	131	118
Число авторов монографий	0	0	1	0	0
Число авторов публикаций с участием зарубежных организаций	82	76	75	69	79
Число авторов, зарегистрированных в Science Index	106	109	122	130	134
Число публикаций, загруженных в РИНЦ	3408	3858	4235	4550	4859
Число просмотров публикаций за год	34512	33819	30310	44290	45502
Число загрузок публикаций за год	5226	6832	5817	8803	7111

с 2012 по 2016 год

развернуть

Название показателя	2012	2013	2014	2015	2016
Общее число публикаций за год	184	207	206	178	191
Число статей в журналах	149	175	188	157	172
Число статей в журналах, входящих в Web of Science или Scopus	105	122	123	118	127
Число статей в журналах, входящих в RSCI	41	57	66	55	61
Число статей в журналах, входящих в ядро РИНЦ	123	146	164	139	154
Число статей в журналах, входящих в перечень ВАК	97	127	131	103	109
Число монографий	9	1	5	3	2
Число патентов	5	0	0	0	0
Число публикаций с участием зарубежных авторов	35	29	40	34	43
Число цитирований всех публикаций за год	3530	3604	3602	3931	2837
Число цитирований статей за последние 5 лет	1976	1663	997	1395	1102
Средневзвешенный импакт-фактор журналов, в которых были опубликованы статьи	1,595	1,095	1,956	2,150	2,086
Число авторов всех публикаций	143	135	162	135	92
Число авторов статей в журналах	137	132	155	123	74
Число авторов статей в журналах Web of Science или Scopus	104	111	108	113	55
Число авторов статей в RSCI	79	98	102	68	52
Число авторов статей, входящих в ядро РИНЦ	117	122	139	117	69
Число авторов статей в журналах ВАК	114	114	127	84	55
Число авторов монографий	12	1	8	3	1
Число авторов публикаций с участием зарубежных организаций	33	34	34	36	13
Число авторов, зарегистрированных в Science Index	20	40	84	91	101
Число публикаций, загруженных в РИНЦ	2169	2431	2648	2955	3187
Число публикаций, загруженных через Science Index	0	5	25	78	155
Число просмотров публикаций за год	5879	10724	8336	8701	23518
Число загрузок публикаций за год	590	1510	1813	1856	2317

С 2007 по 2011 год

развернуть

Название показателя	2007	2008	2009	2010	2011
Общее число публикаций за год	165	188	203	227	213
Число статей в журналах	135	145	180	187	181
Число статей в журналах, входящих в Web of Science или Scopus	109	119	132	142	128
Число статей в журналах, входящих в RSCI	46	56	77	80	77
Число статей в журналах, входящих в ядро РИНЦ	154	132	164	171	159
Число статей в журналах, входящих в перечень ВАК	95	105	138	144	146
Число монографий	3	4	1	3	6
Число патентов	0	0	0	2	1
Число публикаций с участием зарубежных авторов	28	32	34	35	27
Число цитирований всех публикаций за год	1277	1654	2424	3026	3359
Число цитирований статей за последние 5 лет	723	920	1499	1909	2065
Средневзвешенный импакт-фактор журналов, в которых были опубликованы статьи	1,965	1,752	1,437	1,315	1,154
Число авторов всех публикаций	116	136	134	141	147
Число авторов статей в журналах	110	134	133	138	141
Число авторов статей в журналах Web of Science или Scopus	104	125	118	126	115
Число авторов статей в RSCI	77	91	103	110	109
Число авторов статей, входящих в ядро РИНЦ	105	129	126	133	132
Число авторов статей в журналах ВАК	91	113	120	121	131
Число авторов монографий	6	4	0	2	10
Число авторов публикаций с участием зарубежных организаций	29	35	28	38	37
Число авторов, зарегистрированных в Science Index	0	0	0	0	7
Число публикаций, загруженных в РИНЦ	229	288	377	1565	1860
Число публикаций, загруженных через Science Index	0	0	0	0	0
Число просмотров публикаций за год	228	248	4485	8117	6126
Число загрузок публикаций за год	25	40	250	445	431

Публикации

Доступ к полным текстам статей в журналах РАН

Список публикаций Института в РИНЦ

Список публикаций Института в Google Scholar

Научно-популярные издания

Публикации в журналах Science и Nature

Science. 2022; 376(6588):44-53. doi: 10.1126/science.abj6987 The complete sequence of a human genome. Nurk S, Koren S, Rhie A, Rautiainen M, Bzikadze AV, Mikheenko A, Vollger MR, Altemose N, Uralsky L, Gershman A, Aganezov S, Hoyt SJ, Diekhans M, Logsdon GA, Alonge M, Antonarakis SE, Borchers M, Bouffard GG, Brooks SY, Caldas GV, Chen NC, Cheng H, Chin CS, Chow W, de Lima LG, Dishuck PC, Durbin R, Dvorkina T, Fiddes IT, Formenti G, Fulton RS, Fungtammasan A, Garrison E, Grady PGS, Graves-Lindsay TA, Hall IM, Hansen NF, Hartley GA, Haukness M, Howe K, Hunkapiller MW, Jain C, Jain M, Jarvis ED, Kerpedjiev P, Kirsche M, Kolmogorov M, Korlach J, Kremitzki M, Li H, Maduro VV, Marschall T, McCartney AM, McDaniel J, Miller DE, Mullikin JC, Myers EW, Olson ND, Paten B, Peluso P, Pevzner PA, Porubsky D, Potapova T, Rogaev EI, Rosenfeld JA, Salzberg SL, Schneider VA, Sedlazeck FJ, Shafin K, Shew CJ, Shumate A, Sims Y, Smit AFA, Soto DC, Sović I, Storer JM, Streets A, Sullivan BA, Thibaud-Nissen F, Torrance J, Wagner J, Walenz BP, Wenger A, Wood JMD, Xiao C, Yan SM, Young AC, Zarate S, Surti U, McCoy RC, Dennis MY, Alexandrov IA, Gerton JL, O'Neill RJ, Timp W, Zook JM, Schatz MC, Eichler EE, Miga KH, Phillippy AM.
Science. 2022; 376(6588):eabl4178. doi: 10.1126/science.abl4178. Complete genomic and epigenetic maps of human centromeres. Altemose N, Logsdon GA, Bzikadze AV, Sidhwani P, Langley SA, Caldas GV, Hoyt SJ, Uralsky L, Ryabov FD, Shew CJ, Sauria MEG, Borchers M, Gershman A, Mikheenko A, Shepelev VA, Dvorkina T, Kunyavskaya O, Vollger MR, Rhie A, McCartney AM, Asri M, Lorig-Roach R, Shafin K, Lucas JK, Aganezov S, Olson D, de Lima LG, Potapova T, Hartley GA, Haukness M, Kerpedjiev P, Gusev F, Tigyi K, Brooks S, Young A, Nurk S, Koren S, Salama SR, Paten B, Rogaev EI, Streets A, Karpen GH, Dernburg AF, Sullivan BA, Straight AF, Wheeler TJ, Gerton JL, Eichler EE, Phillippy AM, Timp W, Dennis MY, O'Neill RJ, Zook JM, Schatz MC, Pevzner PA, Diekhans M, Langley CH, Alexandrov IA, Miga KH.
Science. 2021 Oct 8;374(6564):182-188. doi: 10.1126/science.abi5658. Ten millennia of hepatitis B virus evolution. Kocher A, Papac L, Barquera R, Key FM, Spyrou MA, Hübler R, Rohrlach AB, Aron F, Stahl R, Wissgott A, van Bömmel F, Pfefferkorn M, Mittnik A, Villalba-Mouco V, Neumann GU, Rivollat M, van de Loosdrecht MS, Majander K, Tukhbatova RI, Musralina L, Ghalichi A, Penske S, Sabin S, Michel M, Gretzinger J, Nelson EA, Ferraz T, Nägele K, Parker C, Keller M, Guevara EK, Feldman M, Eisenmann S, Skourtanioti E, Giffin K, Gnecchi-Ruscone GA, Friederich S, Schimmenti V, Khartanovich V, Karapetian MK, Chaplygin MS, Kufterin VV, Khokhlov AA, Chizhevsky AA, Stashenkov DA, Kochkina AF, Tejedor-Rodríguez C, de Lagrán ÍG, Arcusa-Magallón H, Garrido-Pena R, Royo-Guillén JI, Nováček J, Rottier S, Kacki S, Saintot S, Kaverzneva E, Belinskiy AB, Velemínský P, Limburský P, Kostka M, Loe L, Popescu E, Clarke R, Lyons A, Mortimer R, Sajantila A, de Armas YC, Hernandez Godoy ST, Hernández-Zaragoza DI, Pearson J, Binder D, Lefranc P, Kantorovich AR, Maslov VE, Lai L, Zoledziewska M, Beckett JF, Langová M, Danielisová A, Ingman T, Atiénzar GG, de Miguel Ibáñez MP, Romero A, Sperduti A, Beckett S, Salter SJ, Zilivinskaya ED, Vasil'ev DV, von Heyking K, Burger RL, Salazar LC, Amkreutz L, Navruzbekov M, Rosenstock E, Alonso-Fernández C, Slavchev V, Kalmykov AA, Atabiev BC, Batieva E, Calmet MA, Llamas B, Schultz M, Krauß R, Jiménez-Echevarría J, Francken M, Shnaider S, de Knijff P, Altena E, Van de Vijver K, Fehren-Schmitz L, Tung TA, Lösch S, Dobrovolskaya M, Makarov N, Read C, Van Twest M, Sagona C, Ramsl PC, Akar M, Yener KA, Ballestero EC, Cucca F, Mazzarello V, Utrilla P, Rademaker K, Fernández-Domínguez E, Baird D, Semal P, Márquez-Morfín L, Roksandic M, Steiner H, Salazar-García DC, Shishlina N, Erdal YS, Hallgren F, Boyadzhiev Y, Boyadzhiev K, Küßner M, Sayer D, Onkamo P, Skeates R, Rojo-Guerra M, Buzhilova A, Khussainova E, Djansugurova LB, Beisenov AZ, Samashev Z, Massy K, Mannino M, Moiseyev V, Mannermaa K, Balanovsky O, Deguilloux MF, Reinhold S, Hansen S, Kitov EP, Dobeš M, Ernée M, Meller H, Alt KW, Prüfer K, Warinner C, Schiffels S, Stockhammer PW, Bos K, Posth C, Herbig A, Haak W, Krause J, Kühnert D.
Nature. 2016; 538(7624):201-206. The Simons Genome Diversity Project: 300 genomes from 142 diverse populations. Mallick S, Li H, Lipson M, Mathieson I, Gymrek M, Racimo F, Zhao M, Chennagiri N, Nordenfelt S, Tandon A, Skoglund P, Lazaridis I, Sankararaman S, Fu Q, Rohland N, Renaud G, Erlich Y, Willems T, Gallo C, Spence JP, Song YS, Poletti G, Balloux F, van Driem G, de Knijff P, Romero IG, Jha AR, Behar DM, Bravi CM, Capelli C, Hervig T, Moreno-Estrada A, Posukh OL, Balanovska E, Balanovsky O, Karachanak-Yankova S, Sahakyan H, Toncheva D, Yepiskoposyan L, Tyler-Smith C, Xue Y, Abdullah MS, Ruiz-Linares A, Beall CM, Di Rienzo A, Jeong C, Starikovskaya EB, Metspalu E, Parik J, Villems R, Henn BM, Hodoglugil U, Mahley R, Sajantila A, Stamatoyannopoulos G, Wee JT, Khusainova R, Khusnutdinova E, Litvinov S, Ayodo G, Comas D, Hammer MF, Kivisild T, Klitz W, Winkler CA, Labuda D, Bamshad M, Jorde LB, Tishkoff SA, Watkins WS, Metspalu M, Dryomov S, Sukernik R, Singh L, Thangaraj K, Pääbo S, Kelso J, Patterson N, Reich D. - IF 38.138
Nature. 2016; 538(7624):238-242. Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia. Pagani L, Lawson DJ, Jagoda E, Mörseburg A, Eriksson A, Mitt M, Clemente F, Hudjashov G, DeGiorgio M, Saag L, Wall JD, Cardona A, Mägi R, Sayres MA, Kaewert S, Inchley C, Scheib CL, Järve M, Karmin M, Jacobs GS, Antao T, Iliescu FM, Kushniarevich A, Ayub Q, Tyler-Smith C, Xue Y, Yunusbayev B, Tambets K, Mallick CB, Saag L, Pocheshkhova E, Andriadze G, Muller C, Westaway MC, Lambert DM, Zoraqi G, Turdikulova S, Dalimova D, Sabitov Z, Sultana GN, Lachance J, Tishkoff S, Momynaliev K, Isakova J, Damba LD, Gubina M, Nymadawa P, Evseeva I, Atramentova L, Utevska O, Ricaut FX, Brucato N, Sudoyo H, Letellier T, Cox MP, Barashkov NA, Škaro V, Mulahasanovic L, Primorac D, Sahakyan H, Mormina M, Eichstaedt CA, Lichman DV, Abdullah S, Chaubey G, Wee JT, Mihailov E, Karunas A, Litvinov S, Khusainova R, Ekomasova N, Akhmetova V, Khidiyatova I, Marjanović D, Yepiskoposyan L, Behar DM, Balanovska E, Metspalu A, Derenko M, Malyarchuk B, Voevoda M, Fedorova SA, Osipova LP, Lahr MM, Gerbault P, Leavesley M, Migliano AB, Petraglia M, Balanovsky O, Khusnutdinova EK, Metspalu E, Thomas MG, Manica A, Nielsen R, Villems R, Willerslev E, Kivisild T, Metspalu M. - IF 38.138
Science. 2015 Aug 21;349(6250):aab3884. Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans.Raghavan M, Steinrücken M, Harris K, Schiffels S, Rasmussen S, DeGiorgio M, Albrechtsen A, Valdiosera C, Ávila-Arcos MC, Malaspinas AS, Eriksson A, Moltke I, Metspalu M, Homburger JR, Wall J, Cornejo OE, Moreno-Mayar JV, Korneliussen TS, Pierre T, Rasmussen M, Campos PF, Damgaard Pde B, Allentoft ME, Lindo J, Metspalu E, Rodríguez-Varela R, Mansilla J, Henrickson C, Seguin-Orlando A, Malmström H, Stafford T Jr, Shringarpure SS, Moreno-Estrada A, Karmin M, Tambets K, Bergström A, Xue Y, Warmuth V, Friend AD, Singarayer J, Valdes P, Balloux F, Leboreiro I, Vera JL, Rangel-Villalobos H, Pettener D, Luiselli D, Davis LG, Heyer E, Zollikofer CP, Ponce de León MS, Smith CI, Grimes V, Pike KA, Deal M, Fuller BT, Arriaza B, Standen V, Luz MF, Ricaut F, Guidon N, Osipova L, Voevoda MI, Posukh OL, Balanovsky O, Lavryashina M, Bogunov Y, Khusnutdinova E, Gubina M, Balanovska E, Fedorova S, Litvinov S, Malyarchuk B, Derenko M, Mosher MJ, Archer D, Cybulski J, Petzelt B, Mitchell J, Worl R, Norman PJ, Parham P, Kemp BM, Kivisild T, Tyler-Smith C, Sandhu MS, Crawford M, Villems R, Smith DG, Waters MR, Goebel T, Johnson JR, Malhi RS, Jakobsson M, Meltzer DJ, Manica A, Durbin R, Bustamante CD, Song YS, Nielsen R, Willerslev E. - IF 34.661
Science. 2015. 349(6250). POPULATION GENETICS. Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans. Raghavan M., Steinrücken M., Harris K., Schiffels S., Rasmussen S., DeGiorgio M., Albrechtsen A., Valdiosera C., Ávila-Arcos M.C., Malaspinas A.S., Eriksson A., Moltke I., Metspalu M., Homburger J.R., Wall J., Cornejo O.E., Moreno-Mayar J.V., Korneliussen T.S., Pierre T., Rasmussen M., Campos P.F., Damgaard P.B., Allentoft M.E., Lindo J., Metspalu E., Rodríguez-Varela R., Mansilla J., Henrickson C., Seguin-Orlando A., Malmström H., Stafford T.Jr., Shringarpure S., Moreno-Estrada A., Karmin M., Tambets K., Bergström A., Xue Y., Warmuth V., Friend A.D., Singarayer J., Valdes P., Balloux F., Leboreiro I., Vera J.L., Rangel-Villalobos H., Pettener D., Luiselli D., Davis L.G., Heyer E., Zollikofer C.P., Ponce de León M.S., Smith C.I., Grimes V., Pike K.A., Deal M., Fuller B.T., Arriaza B., Standen V., Luz M.F., Ricaut F., Guidon N., Osipova L., Voevoda M.I., Posukh O.L., Balanovsky O., Lavryashina M., Bogunov Y., Khusnutdinova E., Gubina M., Balanovska E., Fedorova S., Litvinov S., Malyarchuk B., Derenko M., Mosher M.J., Archer D., Cybulski J., Petzelt B., Mitchell J., Worl R., Norman P.J., Parham P., Kemp B.M., Kivisild T., Tyler-Smith C., Sandhu M.S., Crawford M., Villems R., Smith D.G., Waters M.R., Goebel T., Johnson J.R., Malhi R.S., Jakobsson M., Meltzer D.J., Manica A., Durbin R., Bustamante C.D., Song Y.S., Nielsen R., Willerslev E. - IF 34.661
Nature. 2014; 513(7518):409-13. – IF F 42.351 Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. Lazaridis I, Patterson N, Mittnik A, Renaud G, Mallick S, Kirsanow K, Sudmant PH, Schraiber JG, Castellano S, Lipson M, Berger B, Economou C, Bollongino R, Fu Q, Bos KI, Nordenfelt S, Li H, de Filippo C, Prüfer K, Sawyer S, Posth C, Haak W, Hallgren F, Fornander E, Rohland N, Delsate D, Francken M, Guinet JM, Wahl J, Ayodo G, Babiker HA, Bailliet G, Balanovska E, Balanovsky O, Barrantes R, Bedoya G, Ben-Ami H, Bene J, Berrada F, Bravi CM, Brisighelli F, Busby GB, Cali F, Churnosov M, Cole DE, Corach D, Damba L, van Driem G, Dryomov S, Dugoujon JM, Fedorova SA, Gallego Romero I, Gubina M, Hammer M, Henn BM, Hervig T, Hodoglugil U, Jha AR, Karachanak-Yankova S, Khusainova R, Khusnutdinova E, Kittles R, Kivisild T, Klitz W, Kučinskas V, Kushniarevich A, Laredj L, Litvinov S, Loukidis T, Mahley RW, Melegh B, Metspalu E, Molina J, Mountain J, Näkkäläjärvi K, Nesheva D, Nyambo T, Osipova L, Parik J, Platonov F, Posukh O, Romano V, Rothhammer F, Rudan I, Ruizbakiev R, Sahakyan H, Sajantila A, Salas A, Starikovskaya EB, Tarekegn A, Toncheva D, Turdikulova S, Uktveryte I, Utevska O, Vasquez R, Villena M, Voevoda M, Winkler CA, Yepiskoposyan L, Zalloua P, Zemunik T, Cooper A, Capelli C, Thomas MG, Ruiz-Linares A, Tishkoff SA, Singh L, Thangaraj K, Villems R, Comas D, Sukernik R, Metspalu M, Meyer M, Eichler EE, Burger J, Slatkin M, Pääbo S, Kelso J, Reich D, Krause J.
Nature. 2014;505(7481):87-91. Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans. Raghavan M, Skoglund P, Graf KE, Metspalu M, Albrechtsen A, Moltke I, Rasmussen S, Stafford TW Jr, Orlando L, Metspalu E, Karmin M, Tambets K, Rootsi S, Mägi R, Campos PF, Balanovska E, Balanovsky O, Khusnutdinova E, Litvinov S, Osipova LP, Fedorova SA, Voevoda MI, DeGiorgio M, Sicheritz-Ponten T, Brunak S, Demeshchenko S, Kivisild T, Villems R, Nielsen R, Jakobsson M, Willerslev E.
Nature. 2014; 510(7503):109-14. The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems. Moroz LL, Kocot KM, Citarella MR, Dosung S, Norekian TP, Povolotskaya IS, Grigorenko AP, Dailey C, Berezikov E, Buckley KM, Ptitsyn A, Reshetov D, Mukherjee K, Moroz TP, Bobkova Y, Yu F, Kapitonov VV, Jurka J, Bobkov YV, Swore JJ, Girardo DO, Fodor A, Gusev F, Sanford R, Bruders R, Kittler E, Mills CE, Rast JP, Derelle R, Solovyev VV, Kondrashov FA, Swalla BJ, Sweedler JV, Rogaev EI, Halanych KM, Kohn AB. – IF 42.351
Nature. 2014 Mar 27;507(7493):462-70. A promoter-level mammalian expression atlas. The FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT), в том числе сотрудники ИОГен Иван Кулаковский, Юлия Медведева, Александр Фаворов, Артем Касьянов, Илья Воронцов и Всеволод Макеев, Forrest AR, Kawaji H, Rehli M, Baillie JK, de Hoon MJ, Lassmann T, Itoh M, Summers KM, Suzuki H, Daub CO, Kawai J, Heutink P, Hide W, Freeman TC, Lenhard B, Bajic VB, Taylor MS, Makeev VJ, Sandelin A, Hume DA, Carninci P, Hayashizaki Y. – IF 42.351

Избранные публикации

2021

развернуть

Matveevsky S, Grishaeva T. Heterogeneity in conservation of multifunctional partner enzymes with meiotic importance, CDK2 kinase and BRCA1 ubiquitin ligase // Peer J. 2021. 9:e12231 doi: 10.7717/peerj.12231. PMID: 3469225
Mazheika I.S., Semenova M.A., Voronko O.V., Psurtseva N.V., Kolomiets O.L, Kamzolkina O.V.Evaluation of the carbonylation of filamentous fungi proteins by dry immune dot blotting // Fungal Biol. Fungal Biol 2021 Nov;125(11):923-933. doi: 10.1016/j.funbio.2021.06.006. PMID: 34649679
Nezametdinova V.Z., Yunes R.A., Dukhinova M.S., Alekseeva M.G., Danilenko V.N. The Role of the PFNA Operon of Bifidobacteria in the Recognition of Host’s Immune Signals: Prospects for the Use of the FN3 Protein in the Treatment of COVID-19 // Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(17), 9219; https://doi.org/10.3390/ijms22179219
Habib N. A., M. Müller, O. Gailing, A. Patzelt, G. Al Issai, K. V. Krutovsky, M. Wiehle 2021 Genetic diversity and differentiation of Olea europaea subsp. cuspidata (Wall. & G. Don) Cif.in the Hajar Mountains of Oman. Genetic Resources and Crop Evolution 68(3): 865–883 https://doi.org/10.1007/s10722-020-01030-2 (IF = 1.071; Q3)
Cuervo-Alarcon L., M. Arend, M. Müller, C. Sperisen, R. Finkeldey, K. V. Krutovsky 2021 A candidate gene association analysis identifies SNPs potentially involved in drought tolerance in European beech (Fagus sylvatica L.). Scientific Report 11: 2386. https://doi.org/10.1038/s41598-021-81594-w (IF = 4.122; Q1)
Tarieiev A. S., O. Gailing, K. V. Krutovsky 2021 ITS secondary structure reconstruction to resolve taxonomy and phylogeny of the Betula L. genus. PeerJ 9:e10889 https://doi.org/10.7717/peerj.10889 (IF = 2.380; Q1)
Perfileva A. I., O. A. Nozhkina, T. V. Ganenko, I. A. Graskova, B. G. Sukhov, A. V. Artem’ev, B. A. Trofimov, K. V. Krutovsky 2021 Selenium nanocomposites in natural matrices as potato recovery agent. International Journal of Molecular Sciences 22(9), 4576; https://doi.org/10.3390/ijms22094576 (IF = 4.556; Q1)
Nieves-Orduña, H. E., M. Müller, K. V. Krutovsky, O. Gailing. 2021 Geographic patterns of genetic variation among cacao (Theobroma cacao L.) populations based on chloroplast markers. Diversity 2021, 13(6): 249 https://www.mdpi.com/1424-2818/13/6/249/ htm https://doi.org/10.3390/d13060249 (IF = 1.402; Q3)
Abramov S, Boytsov A, Bykova D, Penzar DD, Yevshin I, Kolmykov SK, Fridman MV, Favorov AV, Vorontsov IE, Baulin E, Kolpakov F, Makeev VJ, Kulakovskiy IV. Landscape of allele-specific transcription factor binding in the human genome. //Nat Commun. 2021 May 12;12(1):2751. doi: 10.1038/s41467-021-23007-0
Zolotareva K.I., Bannikova A.A., Belokon M.M., Belokon Y.S., Politov D.V., Rutovskaya M.V., Hlyap L.A., Starykov V.P., Lebedev V.S. Genetic diversity and structure of the hedgehogs Erinaceus europaeus and Erinaceus roumanicus: evidence for ongoing hybridization in Eastern Europe // Biological Journal of the Linnean Society. 2021;132(1):174-195. https://doi.org/10.1093/biolinnean/blaa135
Stepchenkova EI, Zhuk AS, Cui J, Tarakhovskaya ER, Barbari SR, Shcherbakova PV, Polev DE, Fedorov R, Poliakov E, Rogozin IB, Lada AG, Pavlov YI Compensation for the absence of the catalytically active half of DNA polymerase ε in yeast by positively selected mutations in CDC28. // . Genetics. 2021 Apr 12:iyab060. doi: 10.1093/genetics/iyab060
Chromosome-scale genome assembly provides insights into rye biology, evolution and agronomic potential. Rabanus-Wallace MT, Hackauf B, Mascher M, Lux T, Wicker T, Gundlach H, Baez M, Houben A, Mayer KFX, Guo L, Poland J, Pozniak CJ, Walkowiak S, Melonek J, Praz CR, Schreiber M, Budak H, Heuberger M, Steuernagel B, Wulff B, Börner A, Byrns B, Čížková J, Fowler DB, Fritz A, Himmelbach A, Kaithakottil G, Keilwagen J, Keller B, Konkin D, Larsen J, Li Q, Myśków B, Padmarasu S, Rawat N, Sesiz U, Biyiklioglu-Kaya S, Sharpe A, Šimková H, Small I, Swarbreck D, Toegelová H, Tsvetkova N, Voylokov AV, Vrána J, Bauer E, Bolibok-Bragoszewska H, Doležel J, Hall A, Jia J, Korzun V, Laroche A, Ma XF, Ordon F, Özkan H, Rakoczy-Trojanowska M, Scholz U, Schulman AH, Siekmann D, Stojałowski S, Tiwari VK, Spannagl M, Stein N. Nat Genet. 2021 Apr;53(4):564-573. doi: 10.1038/s41588-021-00807-0. Epub 2021 Mar 18
Complete Genome Sequence of Rhodococcus sp. Strain M8, a Platform Strain for Acrylic Monomer Production. Novikov AD, Lavrov KV, Kasianov AS, Topchiy MA, Gerasimova TV, Yanenko AS. Microbiol Resour Announc. 2021 Mar 11;10(10):e01314-20. doi: 10.1128/MRA.01314-20
Gil-Fernández A, Matveevsky S, Martín-Ruiz M, Ribagorda M, Parra MT, Viera A, Rufas JS, Kolomiets O, Bakloushinskaya I, Page J. Sex differences in the meiotic behavior of an XX sex chromosome pair in males and females of the mole vole Ellobius tancrei: turning an X into a Y chromosome?// Chromosoma. 2021 Apr 6. doi: 10.1007/s00412-021-00755-y
Danilova L, Wrangle J, Herman JG, Cope L. DNA-methylation for the detection and distinction of 19 human malignancies.// Epigenetics. 2021 Mar 5:1-11. doi: 10.1080/15592294.2021.1890885.
Konorov EA, Kurbakov KA, Minaev MY. Genome Sequencing of Kocuria varians Strain 80, Isolated from Starter Culture for Dry Sausage.// Microbiol Resour Announc. 2021 Feb 25;10(8):e00086-21. doi: 10.1128/MRA.00086-21.
Matveevsky S, Chassovnikarova T, Grishaeva T, Atsaeva M, Malygin V, Bakloushinskaya I, Kolomiets O. Kinase CDK2 in Mammalian Meiotic Prophase I: Screening for Hetero- and Homomorphic Sex Chromosomes.// Int J Mol Sci. 2021 Feb 17;22(4):1969. doi: 10.3390/ijms22041969.
Kolmykov S, Yevshin I, Kulyashov M, Sharipov R, Kondrakhin Y, Makeev VJ, Kulakovskiy IV, Kel A, Kolpakov F. GTRD: an integrated view of transcription regulation // Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D104-D111. doi: 10.1093/nar/gkaa1057.
Vorontsov IE, Egorov AA, Anisimova AS, Eliseeva IA, Makeev VJ, Gladyshev VN, Dmitriev SE, Kulakovskiy IV. Assessing Ribosome Distribution Along Transcripts with Polarity Scores and Regression Slope Estimates.// Methods Mol Biol. 2021;2252:269-294. doi: 10.1007/978-1-0716-1150-0_13.
Kim K, Wang X, Ragonnaud E, Bodogai M, Illouz T, DeLuca M, McDevitt RA, Gusev F, Okun E, Rogaev E, Biragyn A. Therapeutic B-cell depletion reverses progression of Alzheimer's disease. // Nat Commun. 2021 Apr 12;12(1):2185. doi: 10.1038/s41467-021-22479-4.
Spangenberg V, Arakelyan M, Galoyan E, Martirosyan I, Bogomazova A, Martynova E, de Bello Cioffi M, Liehr T, Al-Rikabi A, Osipov F, Petrosyan V, Kolomiets O. Meiotic synapsis of homeologous chromosomes and mismatch repair protein detection in the parthenogenetic rock lizard Darevskia unisexualis. // Mol Reprod Dev. 2021 Feb;88(2):119-127. doi: 10.1002/mrd.23450.
Manakhov AD, Mintseva MY, Andreeva TV, Filimonov PA, Onokhov AA, Chernova IЕ, Kashtanov SN, Rogaev EI. Genome Analysis of Sable Fur Color Links a Lightened Pigmentation Phenotype to a Frameshift Variant in the Tyrosinase-Related Protein 1 Gene. // Genes (Basel). 2021; 12(2):157. doi: 10.3390/genes12020157.
Afsari B, Kuo A, Zhang Y, Li L, Lahouel K, Danilova L, Favorov A, Rosenquist TA, Grollman AP, Kinzler KW, Cope L, Vogelstein B, Tomasetti C. Supervised mutational signatures for obesity and other tissue-specific etiological factors in cancer.// Elife. 2021 Jan 25;10:e61082. doi: 10.7554/eLife.61082.
Novikov AD, Lavrov KV, Kasianov AS, Korzhenkov AA, Gubanova TA, Yanenko AS. Draft Genome Sequence of Rhodococcus erythropolis HX7, a Psychrotolerant Soil-Derived Oil Degrader.//Microbiol Resour Announc. 2021 Jan 21;10(3):e01353-20. doi: 10.1128/MRA.01353-20.
Vorontsov IE, Egorov AA, Anisimova AS, Eliseeva IA, Makeev VJ, Gladyshev VN, Dmitriev SE, Kulakovskiy IV. Assessing Ribosome Distribution Along Transcripts with Polarity Scores and Regression Slope Estimates. // Methods Mol Biol. 2021;2252:269-294. doi: 10.1007/978-1-0716-1150-0_13.
Kolmykov S, Yevshin I, Kulyashov M, Sharipov R, Kondrakhin Y, Makeev VJ, Kulakovskiy IV, Kel A, Kolpakov F. GTRD: an integrated view of transcription regulation. // Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8;49(D1):D104-D111. doi: 10.1093/nar/gkaa1057
Humtsoe JO, Kim HS, Leonard B, Ling S, Keam B, Marchionni L, Afsari B, Considine M, Favorov AV, Fertig EJ, Kang H, Ha PK. Newly Identified Members of FGFR1 Splice Variants Engage in Cross-talk with AXL/AKT Axis in Salivary Adenoid Cystic Carcinoma.// Cancer Res. 2021 Feb 15;81(4):1001-1013. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-1780.
Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)¹ . Klionsky DJ, Abdel-Aziz AK, Abdelfatah S... Kiselev SL... // Autophagy. 2021 Jan;17(1):1-382. doi: 10.1080/15548627.2020.1797280. Epub 2021 Feb 8. PMID: 33634751
Galkin AP. Hypothesis: AA amyloidosis is a factor causing systemic complications after coronavirus disease. // Prion. 2021 Dec;15(1):53-55. doi: 10.1080/19336896.2021.1910468.

2020

развернуть

Spangenberg V., Arakelyan M., Cioffi M., Liehr T., Al-Rikabi A., Martynova E., Stepanyan I., Danielyan F., Galoyan E., Kolomiets O. Cytogenetic mechanisms of unisexuality in rock lizards // Sci Rep. 2020 May 26;10(1):8697.doi: 10.1038/s41598-020-65686-7. PMID: 32457493
Frolova SG, Klimina KM, Kumar R, Vatlin AA, Salunke DB, Kendrekar P, Danilenko VN, Maslov DA. Identification of Mutations Conferring Tryptanthrin Resistance to Mycobacterium smegmatis.// Antibiotics (Basel). 2020 Dec 23;10(1):6. doi: 10.3390/antibiotics10010006
Averina OV, Zorkina YA, Yunes RA, Kovtun AS, Ushakova VM, Morozova AY, Kostyuk GP, Danilenko VN, Chekhonin VP. Bacterial Metabolites of Human Gut Microbiota Correlating with Depression.// Int J Mol Sci. 2020 Dec 3;21(23):9234. doi: 10.3390/ijms21239234.
Abdyyev V.K., Kiseleva E.V., Spangenberg V.E., Kolomiets O.L., Andrade N.S., Sant D.W., Dashinimaev E.B., Vorotelyak E.A., Vasiliev A.V. In vitro derived female hPGCLCs are unable to complete meiosis in embryoid bodies // Experimental Cell Research 2020. Volume 397. Issue 2, 15 December 2020. 112358 https://doi.org/10.1016/j.yexcr.2020.112358 PMID: 33160998
Galoyan, E., Moskalenko, V., Gabelaia, M., Tarkhnishvili, D., Spangenberg, V., Chamkina, A., Arakelyan, M. Syntopy of two species of rock lizards (Darevskia raddei and Darevskia portschinskii) may not lead to hybridization between the . Zoologischer Anzeiger, 2020.288, 43-52. https://doi.org/10.1016/j.jcz.2020.06.007 .
Matveevsky S., Kolomiets O., Bogdanov A., Alpeeva E., Bakloushinskaya I. Meiotic chromosome contacts as a plausible prelude for Robertsonian translocations. Genes. 2020; 11(4):386. doi: https://doi.org/10.3390/genes11040386 (Q2, IF 3,822).
Matveevsky S., Tretiakov A., Kashintsova A., Bakloushinskaya I., Kolomiets O. Meiotic nuclear architecture in distinct mole vole hybrids with Robertsonian translocations: chromosome chains, stretched centromeres, and distorted recombination // International Journal of Molecular Sciences. 2020; 21(20):7630. doi: https://doi.org/10.3390/ijms21207630 PMID: 33076404
Mazheika I., Voronko O., Kamzolkina O. Early endocytosis as a key to understanding mechanisms of plasma membrane tension regulation in filamentous fungi. // Biology of the Cell. 2020. Biol Cell. 2020 Dec;112(12):409-426. doi: https://doi.org/10.1111/boc.202000066 Epub 2020 Sep 9.PMID: 32860722 PMID: 32860722
Mazheika I., Voronko O., Kudryavtseva O., Novoselova D., Pozdnyakov L., Mukhin V., Kolomiets O., Kamzolkina O. Nitrogen-obtaining and -conserving strategies in xylotrophic basidiomycetes // Mycologia. 2020. 112(3):455-473. DOI: https://doi.org/10.1080/00275514.2020.1716567 PMID: 32238121
Mazheika I.S . Kamzolkina O.V. Does macrovesicular endocytosis occur in fungal hyphae? // Fungal Biology Reviews, 2021, V. 38, P. 1- 8 https://doi.org/10.1016/j.fbr.2021.07.001
Spangenberg V., Kolomiets O., Stepanyan I.,Galoyan E., Cioffi M, Martynova E., Martirosyan I., Grishaeva T., Danielyan F., Al-Rikabi A.,Liehr T., Arakelyan M. Evolution of the parthenogenetic rock lizard hybrid karyotype: Robertsonian translocation between two maternal chromosomes in Darevskia rostombekowi // Chromosoma. 2020. doi: https://doi.org/10.1007/s00412-020-00744-7 PMID: 3312381
Sethi S, Vorontsov IE, Kulakovskiy IV, Greenaway S, Williams J, Makeev VJ, Brown SDM, Simon MM, Mallon AM. A holistic view of mouse enhancer architectures reveals analogous pleiotropic effects and correlation with human disease. // BMC Genomics. 2020 Nov 2;21(1):754. doi: 10.1186/s12864-020-07109-5.
Morozova I, Kasianov A, Bruskin S, Neukamm J, Molak M, Batieva E, Pudło A, Rühli FJ, Schuenemann VJ. New ancient Eastern European Yersinia pestis genomes illuminate the dispersal of plague in Europe.// Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2020 Nov 23;375(1812):20190569. doi: 10.1098/rstb.2019.0569. Epub 2020 Oct 5.
Svishcheva G., Babayan O., Lkhasaranov B., Tsendsuren A., Abdurasulov A., Stolpovsky Yu. Microsatellite Diversity and Phylogenetic Relationships among Eurasian Bos Taurus Breeds with an Emphasis on Rare and Ancient Local Cattle // Animals. 2020. T.10. № 9. P. 1493-1516. doi.org/10.3390/ani10091493 (IF 2.323, Q1 )
A Multi-strain Potential Probiotic Formulation of GABA-Producing Lactobacillus plantarum 90sk and Bifidobacterium adolescentis 150 with Antidepressant Effects. Yunes RA, Poluektova EU, Vasileva EV, Odorskaya MV, Marsova MV, Kovalev GI, Danilenko VN. Probiotics Antimicrob Proteins. 2020 Sep;12(3):973-979. doi: 10.1007/s12602-019-09601-1.
FN3 protein fragment containing two type III fibronectin domains from B. longum GT15 binds to human tumor necrosis factor alpha in vitro. Dyakov IN, Mavletova DA, Chernyshova IN, Snegireva NA, Gavrilova MV, Bushkova KK, Dyachkova MS, Alekseeva MG, Danilenko VN. Anaerobe. 2020 Oct;65:102247. doi: 10.1016/j.anaerobe.2020.102247. Epub 2020 Aug 6.
Toxin-Antitoxin Systems: A Tool for Taxonomic Analysis of Human Intestinal Microbiota. Klimina KM, Voroshilova VN, Poluektova EU, Veselovsky VA, Yunes RA, Kovtun AS, Kudryavtseva AV, Kasianov AS, Danilenko VN. Toxins (Basel). 2020 Jun 12;12(6):388. doi: 10.3390/toxins12060388.
Transcriptomic dataset of Mycolicibacterium smegmatis exposed to an imidazo[1,2-b][1,2,4,5]tetrazine. Vatlin AA, Klimina KM, Frolova SG, Danilenko VN, Maslov DA. Data Brief. 2020 Jun 2;31:105805. doi: 10.1016/j.dib.2020.105805. eCollection
The bacterial neurometabolic signature of the gut microbiota of young children with autism spectrum disorders. Averina OV, Kovtun AS, Polyakova SI, Savilova AM, Rebrikov DV, Danilenko VN. J Med Microbiol. 2020 Apr;69(4):558-571. doi: 10.1099/jmm.0.001178.
MmpS5-MmpL5 Transporters Provide Mycobacterium smegmatis Resistance to imidazo[1,2-b][1,2,4,5]tetrazines. Maslov DA, Shur KV, Vatlin AA, Danilenko VN. Pathogens. 2020 Feb 28;9(3):166. doi:10.3390/pathogens9030166.
Bioinformatics analysis of genes of Streptomyces xinghaiensis (fradiae) ATCC 19609 with a focus on mutations conferring resistance to oligomycin A and its derivatives. Vatlin AA, Bekker OB, Lysenkova LN, Shchekotikhin AE, Danilenko VN. J Glob Antimicrob Resist. 2020 Sep;22:47-53. doi: 10.1016/j.jgar.2020.01.026.
Antibiotic Resistance Genes in the Gut Microbiota of Children with Autistic Spectrum Disorder as Possible Predictors of the Disease. Kovtun AS, Averina OV, Alekseeva MG, Danilenko VN. Microb Drug Resist. 2020 Nov;26(11):1307-1320. doi: 10.1089/mdr.2019.0325.
Generation of an induced pluripotent stem cell line MNDINSi001-A from a patient with neonatal diabetes caused by a heterozygous INS mutation. Panova AV, Klementieva NV, Sycheva AV, Goliusova DV, Khokhlov NV, Zubkova NA, Tiulpakov AN, Kiselev SL. Stem Cell Res. 2020 Jul 25;47:101929. doi:10.1016/j.scr.2020.101929.
Locally Delivered Umbilical Cord Mesenchymal Stromal Cells Reduce Chronic Inflammation in Long-Term Nonhealing Wounds: A Randomized Study. Suzdaltseva Y, Zhidkih S, Kiselev SL, Stupin V. Stem Cells Int. 2020 Feb 14;2020:5308609. doi: 10.1155/2020/5308609. eCollection 2020.
Genome analysis of American minks reveals link of mutations in Ras-related protein-38 gene to Moyle brown coat phenotype. Manakhov AD, Mintseva MY, Andreev IA, Uralsky LI, Andreeva TV, Trapezov OV, Rogaev EI. Sci Rep. 2020 Sep 28;10(1):15876. doi: 10.1038/s41598-020-72239-5.
The curly coat phenotype of the Ural Rex feline breed is associated with a mutation in the lipase H gene. Manakhov AD, Andreeva TV, Rogaev EI. Anim Genet. 2020 Aug;51(4):584-589. doi: 10.1111/age.12958.
Genetic Association Between Alzheimer's Disease Risk Variant of the PICALM Gene and EEG Functional Connectivity in Non-demented Adults. Ponomareva N, Andreeva T, Protasova M, Konovalov R, Krotenkova M, Malina D, Mitrofanov A, Fokin V, Illarioshkin S, Rogaev E. Front Neurosci. 2020 Apr 16;14:324. doi: 10.3389/fnins.2020.00324. eCollection 2020.
Dissection of the Human T-Cell Receptor γ Gene Repertoire in the Brain and Peripheral Blood Identifies Age- and Alzheimer's Disease-Associated Clonotype Profiles. Aliseychik M, Patrikeev A, Gusev F, Grigorenko A, Andreeva T, Biragyn A, Rogaev E. Front Immunol. 2020 Jan 29;11:12. doi: 10.3389/fimmu.2020.00012. eCollection 2020.
Pettenkofer T., R. Finkeldey, M. Müller, K. V. Krutovsky, B. Vornam, L. Leinemann, O. Gailing 2020 Genetic variation of introduced red oak (Quercus rubra) stands in Germany compared to North American populations. European Journal of Forest Research 139(2): 321–331 2020 https://doi.org/10.1007/s10342-019-01256-5 (IF = 2.451; Q1)
Lebedev V. G., N. M. Subbotina, O. P. Maluchenko, T. N. Lebedeva, K. V. Krutovsky, K. A. Shestibratov (2020) Transferability and polymorphism of SSR markers located in flavonoid pathway genesin Fragaria and Rubus species. Genes 11(1): 11 https://doi.org/10.3390/genes11010011 (IF = 3.759; Q2)
Caré O., O. Gailing, M. Müller, K. V. Krutovsky, L. Leinemann 2020 Crown morphology in Norway spruce (Picea abies [Karst.] L.) as adaptation to mountainous environments is associated with single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genes regulating seasonal growth rhythm. Tree Genetics & Genomes 16(1): 4 https://doi.org/10.1007/s11295-019-1394-x (IF = 1.862; Q1)
Caré O., O. Gailing, M. Müller, K. V. Krutovsky, L. Leinemann (2020) Assoziation zwischen Kandidatengenen und der Kronenform der Fichte (Picea abies (L.) H. Karst.) zeigt die Klimaadaption autochthoner Hochlagenbestände. In Proceedings Liesebach M (ed) Forstpflanzenzüchtung für die Praxis: 6. Tagung der Sekti on Forstgenetik/Forstpflanzenzüchtung vom 16. Bis 18. September 2019 in Dresden: Tagungsband. Braunschweig: Johann Heinrich von Thünen-Institut, 296 p, Thünen Rep 76, doi:10.3220/rep1584625360000, pp. 73-80 (https://www.thuenen.de/media/publikationen/thuenen-report/Thuenen_Report_76.pdf)
Breidenbach N., H. Wildhagen, C. Bandurski, L. Engelhardt, M. Büttner, O. Gailing, K. V. Krutovsky (2020) Phänotypische und genetische Reaktionen von Sequoia sempervirens Herkünften auf Frosttemperaturen. In Proceedings Liesebach M (ed) Forstpflanzenzüchtung für die Praxis: 6. Tagung der Sekti on Forstgenetik/Forstpflanzenzüchtung vom 16. Bis 18. September 2019 in Dresden: Tagungsband. Braunschweig: Johann Heinrich von Thünen-Institut, 296 p, Thünen Rep 76, doi:10.3220/rep1584625360000, pp. 200-210 (https://www.thuenen.de/media/publikationen/thuenen-report/Thuenen_Report_76.pdf)
Vidyagina E. O., N. M. Subbotina, V. A. Belyi, V. G. Lebedev, K. V. Krutovsky, K. A. Shestibratov (2020) Various effects of the expression of the xyloglucanase gene from Penicillium canescens in transgenic aspen under semi-natural conditions. BMC Plant Biol 20, 251 https://doi.org/10.1186/s12870-020-02469-2 (IF = 3.497; Q1)
Caré O., O. Gailing, M. Müller, K. V. Krutovsky, L. Leinemann. 2020 Mating system in a native Norway spruce (Picea abies [L.] Karst.) stand - Relatedness and effective pollen population size show an association with the germination percentage of single tree progenies. Diversity 12(7): 266 https://doi.org/10.3390/d12070266 (IF = 1.402; Q3)
Breidenbach N., V. V. Sharov, O. Gailing, K. V. Krutovsky (2020) De novo transcriptome assembly of cold stressed clones of the hexaploid Sequoia sempervirens (D. Don) Endl. Scientific Data 7, 239 https://doi.org/10.1038/s41597-020-00576-1 (IF = 5.541; Q1)
Pettenkofer T.A., R. Finkeldey, M. Müller, K. V. Krutovsky, B. Vornam, L. Leinemann, O. Gailing Development of novel Quercus rubra chloroplast genome CAPS markers for haplotype identification. Silvae Genetica 2020; 69(1): 78-85 https://content.sciendo.com/view/journals/sg/69/1/article-p78.xml https://doi.org/10.2478/sg-2020-0011 (IF = 1.111; Q3)
Akulova V.S., V.V. Sharov, A.I. Aksyonova, Yu.A. Putintseva, N.V. Oreshkova, S.I. Feranchuk, D.A. Kuzmin, I.N. Pavlov, Y. A. Litovka, K.V. Krutovsky 2020 De novo sequencing, assembly and functional annotation of Armillaria borealis genome. BMC Genomics 21(Suppl 7): 534. https://doi.org/10.1186/s12864-020-06964-6 IF = 3.594; Q2)
Götz J., Konstantin V. Krutovsky, Ludger Leinemann, Markus Müller, Om P. Rajora, Oliver Gailing 2020 Chloroplast haplotypes of northern red oak (Quercus rubra L.) stands in Germany suggest their origin from northeastern Canada // Forests 11(9): 1025; https://doi.org/10.3390/f11091025 (IF = 2.221; Q1)
Putintseva Yu.A., E.I. Bondar, E.P. Simonov, V.V. Sharov, N.V. Oreshkova, D.A. Kuzmin, Yu.M. Konstantinov, V.N. Shmakov, V.I. Belkov, M.S. Sadovsky, O. Keech, K.V. Krutovsky 2020 Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) mitochondrial genome assembled using both short and long nucleotide sequence reads is currently the largest known mitogenome. BMC Genomics 21: 654 https://doi.org/10.1186/s12864-020-07061-4 (IF = 3.594; Q2)
Kuchma O., D. Janz, L. Leinemann, A. Polle, K. V. Krutovsky, O. Gailing 2020 Hybrid and environmental effects on gene expression in poplar clones in pure and mixed with black locust stands. Forests 11(10): 1075 https://doi.org/10.3390/f11101075 (IF = 2.221; Q1)
Breidenbach N., O. Gailing, K. V. Krutovsky 2020 Genetic structure of coast redwood (Sequoia sempervirens [D. Don] Endl.) populations in and outside of the natural distribution range based on 2019nuclear and chloroplast microsatellite markers. PLoS One 15(12): e0243556. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0243556 (IF = 2.740; Q2)
A holistic view of mouse enhancer architectures reveals analogous pleiotropic effects and correlation with human disease. Sethi S, Vorontsov IE, Kulakovskiy IV, Greenaway S, Williams J, Makeev VJ, Brown SDM, Simon MM, Mallon AM. BMC Genomics. 2020 Nov 2;21(1):754. doi: 10.1186/s12864-020-07109-5.
Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping. Ramilowski JA, Yip CW, Agrawal S, Chang JC, Ciani Y, Kulakovskiy IV, Mendez M, Ooi JLC, Ouyang JF, Parkinson N, Petri A, Roos L, Severin J, Yasuzawa K, Abugessaisa I, Akalin A, Antonov IV, Arner E, Bonetti A, Bono H, Borsari B, Brombacher F, Cameron CJ, Cannistraci CV, Cardenas R, Cardon M, Chang H, Dostie J, Ducoli L, Favorov A, Fort A, Garrido D, Gil N, Gimenez J, Guler R, Handoko L, Harshbarger J, Hasegawa A, Hasegawa Y, Hashimoto K, Hayatsu N, Heutink P, Hirose T, Imada EL, Itoh M, Kaczkowski B, Kanhere A, Kawabata E, Kawaji H, Kawashima T, Kelly ST, Kojima M, Kondo N, Koseki H, Kouno T, Kratz A, Kurowska-Stolarska M, Kwon ATJ, Leek J, Lennartsson A, Lizio M, López-Redondo F, Luginbühl J, Maeda S, Makeev VJ, Marchionni L, Medvedeva YA, Minoda A, Müller F, Muñoz-Aguirre M, Murata M, Nishiyori H, Nitta KR, Noguchi S, Noro Y, Nurtdinov R, Okazaki Y, Orlando V, Paquette D, Parr CJC, Rackham OJL, Rizzu P, Sánchez Martinez DF, Sandelin A, Sanjana P, Semple CAM, Shibayama Y, Sivaraman DM, Suzuki T, Szumowski SC, Tagami M, Taylor MS, Terao C, Thodberg M, Thongjuea S, Tripathi V, Ulitsky I, Verardo R, Vorontsov IE, Yamamoto C, Young RS, Baillie JK, Forrest ARR, Guigó R, Hoffman MM, Hon CC, Kasukawa T, Kauppinen S, Kere J, Lenhard B, Schneider C, Suzuki H, Yagi K, de Hoon MJL, Shin JW, Carninci P. Genome Res. 2020 Jul;30(7):1060-1072. doi: 10.1101/gr.254219.119.
Insights gained from a comprehensive all-against-all transcription factor binding motif benchmarking study. Ambrosini G, Vorontsov I, Penzar D, Groux R, Fornes O, Nikolaeva DD, Ballester B, Grau J, Grosse I, Makeev V, Kulakovskiy I, Bucher P. Genome Biol. 2020 May 11;21(1):114. doi: 10.1186/s13059-020-01996-3.
Signaling Pathways Potentially Responsible for Foam Cell Formation: Cholesterol Accumulation or Inflammatory Response-What is First? Orekhov AN, Sukhorukov VN, Nikiforov NG, Kubekina MV, Sobenin IA, Foxx KK, Pintus S, Stegmaier P, Stelmashenko D, Kel A, Poznyak AV, Wu WK, Kasianov AS, Makeev VY, Manabe I, Oishi Y. Int J Mol Sci. 2020 Apr 14;21(8):2716. doi: 10.3390/ijms21082716.

2019

развернуть

Chromatin profiling of cortical neurons identifies individual epigenetic signatures in schizophrenia. Gusev FE, Reshetov DA, Mitchell AC, Andreeva TV, Dincer A, Grigorenko AP, Fedonin G, Halene T, Aliseychik M, Filippova E, Weng Z, Akbarian S, Rogaev EI. Transl Psychiatry. 2019 Oct 17;9(1):256. doi: 10.1038/s41398-019-0596-1.
Galoyan E., Bolshakova A., Abrahamyan M., Petrosyan R., Komarova V.1, Spangenberg V., Arakelyan M. Natural history of Valentin's rock lizard (Darevskia valentini) in Armenia // Zoological Research. 2019 Jul 18;40(4):277-292. DOI: https://doi.org/10.24272/j.issn.2095-8137.2019.036 PMID: 31310063
Shaikevich E., Bogacheva A., Rakova V., Ganushkina L., Ilinsky Yu., 2019. Wolbachia symbionts in mosquitoes: Intra- and intersupergroup recombinations, horizontal transmission and evolution. // Molecular Phylogenetics and Evolution. 134: 24-34, https://doi.org/10.1016/j.ympev.2019.01.020. (IF 3,5 Q1)
Shaikevich E, Bogacheva A., Ganushkina L. 2019. Dirofilaria and Wolbachia in mosquitoes (Diptera: Culicidae) in central European Russia and on the Black Sea coast. Parasite 26, 2. https://doi.org/10.1051/parasite/2019002 (IF 2,5 Q1)
Pneumonia: host susceptibility and shared genetics with pulmonary function and other traits. Khadzhieva MB, Kuzovlev AN, Salnikova LE. // Clin Exp Immunol. 2019 Sep 5. doi: 10.1111/cei.13367
Chromatin profiling of cortical neurons identifies individual epigenetic signatures in schizophrenia. Gusev FE, Reshetov DA, Mitchell AC, Andreeva TV, Dincer A, Grigorenko AP, Fedonin G, Halene T, Aliseychik M, Filippova E, Weng Z, Akbarian S, Rogaev EI. // Transl Psychiatry. 2019 Oct 17;9(1):256. doi: 10.1038/s41398-019-0596-1.
Tumor-derived Thymic stromal lymphopoietin expands bone marrow B-cell precursors in circulation to support metastasis.Ragonnaud E, Moritoh K, Bodogai M, Gusev F, Garaud S, Chen C, Wang X, Baljinnyam T, Becker KG, Maul RW, Willard-Gallo K, Rogaev E, Biragyn A. // Cancer Res. 2019 Oct 1. pii: canres.1058.2019. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-19-1058. [Epub ahead of print]
Classification and monomer-by-monomer annotation dataset of suprachromosomal family 1 alpha satellite higher-order repeats in hg38 human genome assembly.Uralsky LI, Shepelev VA, Alexandrov AA, Yurov YB, Rogaev EI, Alexandrov IA. // Data Brief. 2019 Mar 8;24:103708. doi: 10.1016/j.dib.2019.103708. eCollection 2019 Jun.
Epigenetic-genetic chromatin footprinting identifies novel and subject-specific genes active in prefrontal cortex neurons.Gusev FE, Reshetov DA, Mitchell AC, Andreeva TV, Dincer A, Grigorenko AP, Fedonin G, Halene T, Aliseychik M, Goltsov AY, Solovyev V, Brizgalov L, Filippova E, Weng Z, Akbarian S, Rogaev EI. // FASEB J. 2019 Jul;33(7):8161-8173. doi: 10.1096/fj.201802646R.
Genome analysis identifies the mutant genes for common industrial Silverblue and Hedlund white coat colours in American mink.Manakhov AD, Andreeva TV, Trapezov OV, Kolchanov NA, Rogaev EI. // Sci Rep. 2019 Mar 14;9(1):4581. doi: 10.1038/s41598-019-40918-7.
Differentially Methylated Super-Enhancers Regulate Target Gene Expression in Human Cancer. Flam EL, Danilova L, Kelley DZ, Stavrovskaya E, Guo T, Considine M, Qian J, Califano JA, Favorov A, Fertig EJ, Gaykalova DA.// Sci Rep. 2019 Oct 21;9(1):15034. doi: 10.1038/s41598-019-51018-x.
Allele-specific nonstationarity in evolution of influenza A virus surface proteins. Popova AV, Safina KR, Ptushenko VV, Stolyarova AV, Favorov AV, Neverov AD, Bazykin GA. // Proc Natl Acad Sci U S A. 2019 Oct 15;116(42):21104-21112. doi: 10.1073/pnas.1904246116.
Differential Variation Analysis Enables Detection of Tumor Heterogeneity Using Single-Cell RNA-Sequencing Data. Davis-Marcisak EF, Sherman TD, Orugunta P, Stein-O'Brien GL, Puram SV, Roussos Torres ET, Hopkins AC, Jaffee EM, Favorov AV, Afsari B, Goff LA, Fertig EJ. // Cancer Res. 2019 Oct 1;79(19):5102-5112. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-18-3882.
Publisher Correction: Chromatin dysregulation and DNA methylation at transcription start sites associated with transcriptional repression in cancers. Ando M, Saito Y, Xu G, Bui NQ, Medetgul-Ernar K, Pu M, Fisch K, Ren S, Sakai A, Fukusumi T, Liu C, Haft S, Pang J, Mark A, Gaykalova DA, Guo T, Favorov AV, Yegnasubramanian S, Fertig EJ, Ha P, Tamayo P, Yamasoba T, Ideker T, Messer K, Califano JA. // Nat Commun. 2019 May 29;10(1):2415. doi: 10.1038/s41467-019-10557-7.
Chromatin dysregulation and DNA methylation at transcription start sites associated with transcriptional repression in cancers. Ando M, Saito Y, Xu G, Bui NQ, Medetgul-Ernar K, Pu M, Fisch K, Ren S, Sakai A, Fukusumi T, Liu C, Haft S, Pang J, Mark A, Gaykalova DA, Guo T, Favorov AV, Yegnasubramanian S, Fertig EJ, Ha P, Tamayo P, Yamasoba T, Ideker T, Messer K, Califano JA. // Nat Commun. 2019 May 16;10(1):2188. doi: 10.1038/s41467-019-09937-w.
Breidenbach N., O. Gailing, K. V. Krutovsky 2019 Development of novel polymorphic nuclear and chloroplast microsatellite markers in coast redwood (Sequoia sempervirens). Plant Genetic Resources 17(3): 293–297 doi:10.1017/S147926211800045X https://doi.org/10.1017/S147926211800045X Published online: 04 December 2018 (IF = 0.869/0.813; Q4/Q2)
Kryvokhyzha M. V., K. V. Krutovsky, N. M. Rashydova 2019 Expression of flowering genes in Arabidopsis thaliana under acute and chronic irradiation. International Journal of Radiation Biology 95(5): 626–634 doi: 10.1080/09553002.2019.1562251 Published online: 3 January 2019 https://www.tandfonline.com/doi/pdf/10.1080/09553002.2019.1562251 (IF = 2.368/2.100; Q2/Q1)
Moler R. V. E., A. Abakir, M. Eleftheriou, J. S. Johnson, K. V. Krutovsky, L. C. Lewis, A. Ruzov, A. V. Whipple, O. P. Rajora, (2019) Population Epigenomics: Advancing Understanding of Phenotypic Plasticity, Acclimation, Adaptation and Diseases. Chapter in Population Genomics: Concepts, Approaches and Applications (Edited by Om Rajora), Springer, Cham, pp. 179-260. doi: 10.1007/13836_2018_59 (https://doi.org/10.1007/13836_2018_59)
Balkenhol N., Dudaniec R. Y., Krutovsky K. V., Johnson J. S., Cairns D. M., Segelbacher G., Selkoe K. A., von der Heyden S., Wang I. J., Selmoni O., Joost S. (2019) Landscape Genomics: Understanding Relationships Between Environmental Heterogeneity and Genomic Characteristics of Populations. Chapter in Population Genomics: Concepts, Approaches and Applications (Edited by Om Rajora), Springer, Cham, pp. 261-322. doi: 10.1007/13836_2017_2 (https://link.springer.com/chapter/10.1007/13836_2017_2)
Johnson, J. S., K. V. Krutovsky, O. P. Rajora, K. D. Gaddis, D. M. Cairns (2019) Advancing Biogeography through Population Genomics. Chapter in Population Genomics: Concepts, Approaches and Applications (Edited by Om Rajora), Springer, Cham, pp. 539-585. doi: 10.1007/13836_2018_39 (https://link.springer.com/chapter/10.1007/13836_2018_39)
Bondar E. I., Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2019 Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) chloroplast genome and development of polymorphic chloroplast markers. BMC Bioinformatics 20(Suppl. 1): 38 doi: 10.1186/s12859-018-2571-x https://doi.org/10.1186/s12859-018-2571-x Published: 5 February 2019 (IF = 3.242/3.213; Q1)
Kuzmin, D. A., S. I. Feranchuk, V. V. Sharov, A. N. Cybin, S. V. Makolov, Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2019 Stepwise large genome assembly approach: A case of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.). BMC Bioinformatics 20(Suppl. 1): 37 doi: 10.1186/s12859-018-2570-y https://doi.org/10.1186/s12859-018-2570-y Published: 5 February 2019 (IF = 3.242/3.213; Q1)
Semizer-Cuming D., K. V. Krutovsky, Y. N. Baranchikov, E. D. Kjӕr, C. G. Williams 2019 Saving the world’s ash forests calls for international cooperation now. Nature Ecology and Evolution 3(2): 141–144 https://doi.org/10.1038/s41559-018-0761-6 Published online: 10 December 2018 (IF = 12.543/12.561; Q1)
Pettenkofer T.A., K. Burkardt, C. Ammer, T. Vor, R. Finkeldey, M. Müller, K. Krutovsky, B. Vornam, L. Leinemann, O. Gailing 2019 Genetic diversity and differentiation of introduced red oak (Quercus rubra) in Germany in comparison with reference native North American populations. European Journal of Forest Research 138(2): 275–285 Published online: 06 February 2019 https://doi.org/10.1007/s10342-019-01167-5 (IF = 2.451/2.581; Q1)
Semerikov V. L., S. A. Semerikova, Y. A. Putintseva, N. V. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2019 Mitochondrial DNA in Siberian conifers indicates multiple postglacial colonization centers. Canadian Journal of Forest Research. 49(8): 875–883 Published on the web 04 March 2019 https://doi.org/10.1139/cjfr-2018-0498 (IF = 1.812/2.162; Q2/Q1)
Mosca E., F. Cruz, J. Gómez Garrido, L. Bianco, C. Rellstab, S. Brodbeck, K. Csilléry, B. Fady, M. Fladung, B. Fussi, D. Gömöry, S. C. González-Martínez, D. Grivet, M. Gut, O. K. Hansen, K. Heer, Z. Kaya, K. V. Krutovsky, B. Kersten, S. Liepelt, L. Opgenoorth, C. Sperisen, K. K. Ullrich, G. G. Vendramin, M. Westergren, B. Ziegenhagen, T. Alioto, F. Gugerli, B. Heinze, M. Höhn, M. Troggio, D. B. Neale, 2019. A reference genome sequence for the European silver fir (Abies alba Mill.): a community-generated genomic resource. G3: Genes Genomes Genetics 9(7): 2039-2049 https://doi.org/10.1534/g3.119.400083 (IF = ‎2.781/3.026; Q3/Q1)
Kolesnikova A. I., Y. A. Putintseva, E. P. Simonov, V. V. Biriukov, N. V. Oreshkova, I. N. Pavlov, V. V. Sharov, D. A. Kuzmin, J. Anderson, K. V. Krutovsky 2019 Mobile genetic elements explain size variation in the mitochondrial genomes of four closely-related Armillaria species. BMC Genomics 20:351 https://doi.org/10.1186/s12864-019-5732-z doi: 10.1186/s12864-019-5732-z (IF = 3.594/4.093; Q2/Q1)
Lu M., C. A. Loopstra, K. V. Krutovsky 2019 Detecting the genetic basis of local adaptation in loblolly pine (Pinus taeda L.) using whole exome-wide genotyping and an integrative landscape genomics analysis approach. Ecology and Evolution 9(12): 6798-6809 https://doi.org/10.1002/ece3.5225 (IF = 2.392/2.749; Q2/Q1)
Lebedev V. G., Krutovsky K. V., Shestibratov K. A. 2019 …Fell Upas Sits, the Hydra-Tree of Death, or the Phytotoxicity of Trees. Molecules 24(8): 1636; https://doi.org/10.3390/molecules24081636 (IF = 3.267/3.589; Q2/Q1)
Tarieiev A. S., I. Olshanskyi, O. Gailing, K. V. Krutovsky 2019 Taxonomy of dark- and white-barked birches related to Betula pendula Roth and B. pubescens Ehrh. (Betulaceae) in Ukraine based on both morphological traits and DNA markers. Botanical Journal of the Linnean Society 191(1): 142–154 https://doi.org/10.1093/botlinnean/boz031 (IF = 2.076/2.557; Q2/Q1)
Lebedev V. G., N. M. Subbotina, O. P. Maluchenko, K. V. Krutovsky, K. A. Shestibratov (2019) Assessment of genetic diversity in differently colored raspberry cultivars using SSR markers located in flavonoid biosynthesis genes. Agronomy 9(9): 518; https://doi.org/10.3390/agronomy9090518 IF = 2.259; Q1)
Chiveu J.C., M. Mueller, K. V. Krutovsky, K. Kehlenbeck, E. Pawelzik, M. Naumann 2019 Genetic diversity of common guava in Kenya: an underutilized naturalized fruit species. Fruits 74(5): 236–248 https://doi.org/10.17660/th2019/74.5.4 (IF = 0.579/1.054; Q4/Q3)
de Melo Moura C. C.,Brambach F., Bado K. J. H., Krutovsky K. V., Kreft H., Tjitrosoedirdjo S. S., Siregar I. Z., Gailing O. (2019) Integrating DNA barcoding and traditional taxonomy for the identification of dipterocarps in remnant lowland forests of Sumatra. Plants 8(11), 461; https://doi.org/10.3390/plants8110461 (IF = 2.762; Q1)
Lu M., K. V. Krutovsky, C. A. Loopstra 2019 Predicting adaptive genetic variation of loblolly pine (Pinus taeda L.) populations under projected future climates based on multivariate models. Journal of Heredity 110(7): 857–865 https://doi.org/10.1093/jhered/esz065 (IF = 2.809/2.791; Q2/Q1)
Babushkina E. A., Zhirnova D. F., Belokopytova L. V., Tychkov I. I., Vaganov E. A., Krutovsky K. V. 2019 Response of four tree species to changing climate in a moisture-limited area of South Siberia. Forests 10(11): 999 https://doi.org/10.3390/f10110999 (IF = 2.221/2.484; Q1)
Lebedev V. G., Krutovsky K. V., Shestibratov K. A. 2019 Effect of phosphinothricin on transgenic downy birch (Betula pubescens Ehrh.) containing bar or GS1 genes. Forests 10(12): 1067; https://doi.org/10.3390/f10121067 (IF = 2.221/2.484; Q1)
Yakovlev I. A., D. Gackowski, A. Abakir, M. Viejo, A. Ruzov, R. Oliński, C. G. Fossdal, K. V. Krutovsky 2019 Mass spectrometry reveals the presence of specific set of epigenetic DNA modifications in the Norway spruce genome. Scientific Report 9: 19314 https://www.nature.com/articles/s41598-019-55826-z 10.1038/s41598-019-55826-z (IF = 3.998/4.576; Q1)
RNA-aptamers-As targeted inhibitors of protein functions in plants. Abdeeva IA, Maloshenok LG, Pogorelko GV, Mokrykova MV, Bruskin SA. // J Plant Physiol. 2019 Jan;232:127-129. doi: 10.1016/j.jplph.2018.10.026.
Sequencing and Analysis of Three Mycobacterium tuberculosis Genomes of the B0/N-90 Sublineage. Zakharevich NV, Zaychikova MV, Shur KV, Bekker OB, Maslov DA, Danilenko VN. // Microbiol Resour Announc. 2019 Sep 26;8(39). pii: e00796-19. doi: 10.1128/MRA.00796-19.
The effects of desynchronosis on the gut microbiota composition and physiological parameters of rats. Klimina KM, Batotsyrenova EG, Yunes RA, Gilyaeva EH, Poluektova EU, Kostrova TA, Kudryavtseva AV, Odorskaya MV, Kashuro VA, Kasianov AS, Ivanov MB, Danilenko VN. // BMC Microbiol. 2019 Jul 12;19(1):160. doi: 10.1186/s12866-019-1535-2.
Identification, functional and structural characterization of novel aminoglycoside phosphotransferase APH(3″)-Id from Streptomyces rimosus subsp. rimosus ATCC 10970. Alekseeva MG, Boyko KM, Nikolaeva AY, Mavletova DA, Rudakova NN, Zakharevich NV, Korzhenevskiy DA, Ziganshin RH, Popov VO, Danilenko VN. // Arch Biochem Biophys. 2019 Aug 15;671:111-122. doi: 10.1016/j.abb.2019.06.008.
Synthesis and antimycobacterial activity of imidazo[1,2-b][1,2,4,5]tetrazines. Maslov DA, Korotina AV, Shur KV, Vatlin AA, Bekker OB, Tolshchina SG, Ishmetova RI, Ignatenko NK, Rusinov GL, Charushin VN, Danilenko VN. // Eur J Med Chem. 2019 Sep 15;178:39-47. doi: 10.1016/j.ejmech.2019.05.081.
Synthesis, antimicrobial and antiproliferative properties of epi-oligomycin A, the (33S)-diastereomer of oligomycin A. Lysenkova LN, Saveljev OY, Omelchuk OA, Zatonsky GV, Korolev AM, Grammatikova NE, Bekker OB, Danilenko VN, Dezhenkova LG, Mavletova DA, Scherbakov AM, Shchekotikhin AE. // Nat Prod Res. 2019 May 10:1-9. doi: 10.1080/14786419.2019.1608540. [Epub ahead of print]
Draft Genome Sequences of 12 Mycolicibacterium smegmatis Strains Resistant to Imidazo[1,2-b][1,2,4,5]Tetrazines. Vatlin AA, Shur KV, Danilenko VN, Maslov DA. // Microbiol Resour Announc. 2019 Apr 18;8(16). pii: e00263-19. doi: 10.1128/MRA.00263-19.
Mutations in Efflux Pump Rv1258c (Tap) Cause Resistance to Pyrazinamide, Isoniazid, and Streptomycin in M. tuberculosis. Liu J, Shi W, Zhang S, Hao X, Maslov DA, Shur KV, Bekker OB, Danilenko VN, Zhang Y. // Front Microbiol. 2019 Feb 19;10:216. doi: 10.3389/fmicb.2019.00216. eCollection 2019.
Neuropeptides in the microbiota-brain axis and feeding behavior in autism spectrum disorder. Fetissov SO, Averina OV, Danilenko VN. // Nutrition. 2019 May;61:43-48. doi: 10.1016/j.nut.2018.10.030.
Draft Genome Sequence of Streptomyces xinghaiensis (fradiae) OlgR, a Strain Resistant to Oligomycin A. Bekker OB, Vatlin AA, Zakharevich NV, Lysenkova LN, Shchekotikhin AE, Danilenko VN. // Microbiol Resour Announc. 2019 Jan 10;8(2). pii: e01531-18. doi: 10.1128/MRA.01531-18. eCollection 2019 Jan.
Lysenkoism Against Genetics: The Meeting of the Lenin All-Union Academy of Agricultural Sciences of August 1948, Its Background, Causes, and Aftermath. Borinskaya SA, Ermolaev AI, Kolchinsky EI.// Genetics. 2019 May;212(1):1-12. doi: 10.1534/genetics.118.301413.
Changes in Biological Pathways During 6,000 Years of Civilization in Europe. Chekalin E, Rubanovich A, Tatarinova TV, Kasianov A, Bender N, Chekalina M, Staub K, Koepke N, Rühli F, Bruskin S, Morozova I. // Mol Biol Evol. 2019 Jan 1;36(1):127-140. doi: 10.1093/molbev/msy201
Heteroplasmic Variants of Mitochondrial DNA in Atherosclerotic Lesions of Human Aortic Intima. Sobenin IA, Zhelankin AV, Khasanova ZB, Sinyov VV, Medvedeva LV, Sagaidak MO, Makeev VJ, Kolmychkova KI, Smirnova AS, Sukhorukov VN, Postnov AY, Grechko AV, Orekhov AN. // Biomolecules. 2019 Sep 6;9(9). pii: E455. doi: 10.3390/biom9090455.
Employing toxin-antitoxin genome markers for identification of Bifidobacterium and Lactobacillus strains in human metagenomes. Klimina KM, Kasianov AS, Poluektova EU, Emelyanov KV, Voroshilova VN, Zakharevich NV, Kudryavtseva AV, Makeev VJ, Danilenko VN.// PeerJ. 2019 Mar 4;7:e6554. doi: 10.7717/peerj.6554. eCollection 2019.
Defensin-like peptides in wheat analyzed by whole-transcriptome sequencing: a focus on structural diversity and role in induced resistance. Odintsova TI, Slezina MP, Istomina EA, Korostyleva TV, Kasianov AS, Kovtun AS, Makeev VJ, Shcherbakova LA, Kudryavtsev AM.// PeerJ. 2019 Jan 8;7:e6125. doi: 10.7717/peerj.6125. eCollection 2019.
The genetic history of admixture across inner Eurasia. Jeong C, Balanovsky O, Lukianova E, Kahbatkyzy N, Flegontov P, Zaporozhchenko V, Immel A, Wang CC, Ixan O, Khussainova E, Bekmanov B, Zaibert V, Lavryashina M, Pocheshkhova E, Yusupov Y, Agdzhoyan A, Koshel S, Bukin A, Nymadawa P, Turdikulova S, Dalimova D, Churnosov M, Skhalyakho R, Daragan D, Bogunov Y, Bogunova A, Shtrunov A, Dubova N, Zhabagin M, Yepiskoposyan L, Churakov V, Pislegin N, Damba L, Saroyants L, Dibirova K, Atramentova L, Utevska O, Idrisov E, Kamenshchikova E, Evseeva I, Metspalu M, Outram AK, Robbeets M, Djansugurova L, Balanovska E, Schiffels S, Haak W, Reich D, Krause J. // Nat Ecol Evol. 2019 Jun;3(6):966-976. doi: 10.1038/s41559-019-0878-2.
Genome-wide sequence analyses of ethnic populations across Russia. Zhernakova DV, Brukhin V, Malov S, Oleksyk TK, Koepfli KP, Zhuk A, Dobrynin P, Kliver S, Cherkasov N, Tamazian G, Rotkevich M, Krasheninnikova K, Evsyukov I, Sidorov S, Gorbunova A, Chernyaeva E, Shevchenko A, Kolchanova S, Komissarov A, Simonov S, Antonik A, Logachev A, Polev DE, Pavlova OA, Glotov AS, Ulantsev V, Noskova E, Davydova TK, Sivtseva TM, Limborska S, Balanovsky O, Osakovsky V, Novozhilov A, Puzyrev V, O'Brien SJ. // Genomics. 2019 Mar 19. pii: S0888-7543(18)30741-9. doi: 10.1016/j.ygeno.2019.03.007.
Ancient human genome-wide data from a 3000-year interval in the Caucasus corresponds with eco-geographic regions. Wang CC, Reinhold S, Kalmykov A, Wissgott A, Brandt G, Jeong C, Cheronet O, Ferry M, Harney E, Keating D, Mallick S, Rohland N, Stewardson K, Kantorovich AR, Maslov VE, Petrenko VG, Erlikh VR, Atabiev BC, Magomedov RG, Kohl PL, Alt KW, Pichler SL, Gerling C, Meller H, Vardanyan B, Yeganyan L, Rezepkin AD, Mariaschk D, Berezina N, Gresky J, Fuchs K, Knipper C, Schiffels S, Balanovska E, Balanovsky O, Mathieson I, Higham T, Berezin YB, Buzhilova A, Trifonov V, Pinhasi R, Belinskij AB, Reich D, Hansen S, Krause J, Haak W.// Nat Commun. 2019 Feb 4;10(1):590. doi: 10.1038/s41467-018-08220-8.
Extraordinary centromeres: differences in the meiotic chromosomes of two rock lizards species Darevskia portschinskii and Darevskia raddei. Spangenberg V, Arakelyan M, Galoyan E, Pankin M, Petrosyan R, Stepanyan I, Grishaeva T, Danielyan F, Kolomiets O. // PeerJ. 2019 Jan 30;7:e6360. doi: 10.7717/peerj.6360. eCollection 2019.
Effects of early social deprivation on epigenetic statuses and adaptive behavior of young children: A study based on a cohort of institutionalized infants and toddlers. Naumova OY, Rychkov SY, Kornilov SA, Odintsova VV, Anikina VО, Solodunova MY, Arintcina IA, Zhukova MA, Ovchinnikova IV, Burenkova OV, Zhukova OV, Muhamedrahimov RJ, Grigorenko EL. // PLoS One. 2019 Mar 26;14(3):e0214285. doi: 10.1371/journal.pone.0214285.

2018

развернуть

Kramina T.E., Meschersky I.G., Degtjareva G.V., Samigullin T.H., Belokon Y.S., Schanzer I.A. Genetic variation in the Lotus corniculatus complex (Fabaceae) in northern Eurasia as inferred from nuclear microsatellites and plastid trnL-trnF sequences // Botanical Journal of the Linnean Society. 2018;188(1):87-116. https://doi.org/10.1093/botlinnean/boy042 https://academic.oup.com/botlinnean/article/188/1/87/5073290
Ali, H. B. M., A. Abubakari, M. Wiehle, K. V. Krutovsky, 2018 Gene-specific sex-linked genetic markers in date palm (Phoenix dactylifera L.). Genetic Resources and Crop Evolution 65(1): 1-10 https://doi.org/10.1007/s10722-017-0564-7 (IF = 1.294; Q1/2)
Pavlov, I. N., Y. A Litovka, T. V. Ryazanova, N. A. Chuprova, E. A. Litvinova, Y. A. Putintseva, U. Kües, K. V. Krutovsky, 2018 Phylogenetic relationships, pathogenic traits, and wood-destroying properties of Porodaedalea niemelaei M. Fischer isolated in the northern forest limit of Larix gmelinii open woodlands in the permafrost area. Journal of Siberian Federal University. Biology 11(1): 30-48 DOI: 10.17516/1997-1389-0039 http://elib.sfu-kras.ru/bitstream/2311/70290/8/03_Pavlov_15_05.pdf (IF = 0.316; Q4)
Kornienko I.V., Faleeva T.G., Oreshkova N.V., Grigoriev S.E., Grigoreva L.V., Simonov E.P., Kolesnikova A.I., Putintseva Yu.A., Krutovsky K.V. 2018 Complete mitochondrial genome of a woolly mammoth (Mammuthus primigenius) from Maly Lyakhovsky Island (New Siberian Islands, Russia) and its phylogenetic assessment. Mitochondrial DNA Part B. Resources 3(2): 596-598 http://dx.doi.org/10.1080/23802359.2018.1473721 (IF = 0.490; Q4)
Liu, C. L. C., O. Kuchma, K. V. Krutovsky 2018 Mixed-species versus monocultures in plantation forestry: Development, benefits, ecosystem services and perspectives for the future. Global Ecology and Conservation 15: e00419. doi: 10.1016/j.gecco.2018.e00419. https://doi.org/10.1016/j.gecco.2018.e00419 (IF = 1.81; Q2)
Müller M., L. Cuervo-Alarcon, O. Gailing, Rajendra K.C., M. S. Chhetri, S. Seifert, M. Arend, K. V. Krutovsky, R. Finkeldey 2018 Genetic Variation of European Beech Populations and Their Progeny from Northeast Germany to Southwest Switzerland. Forests 9(8): 469. doi:10.3390/f9080469. https://doi.org/10.3390/f9080469 Published: 1 August 2018 (IF = 2.221; Q1)
Nawaz M. A., K. V. Krutovsky, M. Müller, O. Gailing, A. A. Khan, A. Buerkert, M. Wiehle 2018 Morphological and Genetic Diversity of Sea Buckthorn (Hippophae rhamnoides L.) in the Karakoram Mountains of Northern Pakistan. Diversity 10(3): 76; https://doi.org/10.3390/d10030076 Published: 30 July 2018 (IF = 2.047; Q1)
Semerikov, V.L., S.A. Semerikova, Y.A. Putintseva, V. V. Tarakanov, I. V. Tikhonova, A. I. Vidyakin, N.V. Oreshkova, and K.V. Krutovsky, 2018 Colonization history of Scots pine in Eastern Europe and North Asia based on mitochondrial DNA variation. Tree Genetics & Genomes 14:8 https://doi.org/10.1007/s11295-017-1222-0 Published: 8 Jan 2018 (IF = 1.862 Q1)
Cuervo-Alarcon L., M. Arend, M. Müller, C. Sperisen, R. Finkeldey, K. V. Krutovsky 2018 Genetic variation and signatures of natural selection in populations of European beech (Fagus sylvatica L.) along precipitation gradients. Tree Genetics & Genomes 14:84 https://doi.org/10.1007/s11295-018-1297-2 First Online: 30 October 2018 (IF = 1.862 Q1)
Lu M., C. M. Seeve, C. A. Loopstra, K. V. Krutovsky 2018 Exploring the genetic basis of gene transcript abundance and metabolite level in loblolly pine (Pinus taeda L.) using association mapping and network construction. BMC Genetics 19:100 https://doi.org/10.1186/s12863-018-0687-7 Published: 6 November 2018 (IF = 2.469; Q1)
Shestibratov K. A., O. Yu. Baranov, N. M. Subbotina, V. G. Lebedev, S. V. Panteleev, K. V. Krutovsky, V. E. Padutov 2018 Early detection and identification of the main fungal pathogens for resistance evaluation of new genotypes of forest trees. Forests 9(12): 732; https://doi.org/10.3390/f9120732 Published: 23 November 2018 (IF = 2.221; Q1)
Caré O., M. Müller, B. Vornam, A. M. Höltken, K. Kahlert, K. V. Krutovsky, O. Gailing, L. Leinemann 2018 Hight morphological differentiation in crown architecture is weakly reflected in the population genetic structure of German Norway spruce stands. Forests 9(12): 752 doi: 10.3390/f9120752 https://www.mdpi.com/1999-4907/9/12/752/htm Published: Dec 4, 2018 (IF = 2.221; Q1)
Simonov E., A. Lisachov, N. Oreshkova, K. V. Krutovsky 2018 The mitogenome of Elaphe bimaculata (Reptilia: Colubridae) has never been published: a case with the complete mitochondrial genome of E. dione. Acta Herpetologica 13(2): 185-189, Published: Dec 1, 2018 https://doi.org/10.13128/Acta_Herpetol-23394 doi: 10.13128/Acta_Herpetol-23394 (IF = 0.729; Q3)
Tambets K, Yunusbayev B, Hudjashov G, Ilumäe AM, Rootsi S, Honkola T, Vesakoski O, Atkinson Q, Skoglund P, Kushniarevich A, Litvinov S, Reidla M, Metspalu E, Saag L, Rantanen T, Karmin M, Parik J, Zhadanov SI, Gubina M, Damba LD, Bermisheva M, Reisberg T, Dibirova K, Evseeva I, Nelis M, Klovins J, Metspalu A, Esko T, Balanovsky O, Balanovska E, Khusnutdinova EK, Osipova LP, Voevoda M, Villems R, Kivisild T, Metspalu M. Genes reveal traces of common recent demographic history for most of the Uralic-speaking populations. // Genome Biol. 2018 Sep 21;19(1):139. doi: 10.1186/s13059-018-1522-1.
Zolotarenko A, Chekalin E, Piruzian E, Bruskin S. FRA1 mediates the activation of keratinocytes: Implications for the development of psoriatic plaques. // Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis. 2018 Sep 14;1864(12):3726-3734. doi: 10.1016/j.bbadis.2018.09.016.
Abdeeva IA, Pogorelko GV, Maloshenok LG, Mokrykova MV, Fursova OV, Bruskin SA. Search for Partner Proteins of A. thaliana Immunophilins Involved in the Control of Plant Immunity. // Molecules. 2018 Apr 19;23(4). pii: E953. doi: 10.3390/molecules23040953.
Khalilipour N, Baranova A, Jebelli A, Heravi-Moussavi A, Bruskin S, Abbaszadegan MR. Familial Esophageal Squamous Cell Carcinoma with damaging rare/germline mutations in KCNJ12/KCNJ18 and GPRIN2 genes. // Cancer Genet. 2018 Feb;221:46-52. doi: 10.1016/j.cancergen.2017.11.011
Vorontsov IE, Fedorova AD, Yevshin IS, Sharipov RN, Kolpakov FA, Makeev VJ, Kulakovskiy IV. Genome-wide map of human and mouse transcription factor binding sites aggregated from ChIP-Seq data. // BMC Res Notes. 2018 Oct 23;11(1):756. doi: 10.1186/s13104-018-3856-x.
Orekhov AN, Oishi Y, Nikiforov NG, Zhelankin AV, Dubrovsky L, Sobenin IA, Kel A, Stelmashenko D, Makeev VJ, Foxx K, Jin X, Kruth HS, Bukrinsky M. Modified Ldl Particles Activate Inflammatory Pathways In Monocyte-Derived Macrophages: Transcriptome Analysis. // Curr Pharm Des. 2018 Sep 11. doi: 10.2174/1381612824666180911120039.
Orekhov AN, Pushkarsky T, Oishi Y, Nikiforov NG, Zhelankin AV, Dubrovsky L, Makeev VJ, Foxx K, Jin X, Kruth HS, Sobenin IA, Sukhorukov VN, Zakiev ER, Kontush A, Le Goff W, Bukrinsky M. HDL activates expression of genes stimulating cholesterol efflux in human monocyte-derived macrophages. // Exp Mol Pathol. 2018 Oct;105(2):202-207. doi: 10.1016/j.yexmp.2018.08.003.
Babenko VN, Afonnikov DA, Ignatieva EV, Klimov AV, Gusev FE, Rogaev EI. Haplotype analysis of APOE intragenic SNPs. // BMC Neurosci. 2018 Apr 19;19(Suppl 1):16. doi: 10.1186/s12868-018-0413-4
Pilsner JR, Shershebnev A, Medvedeva YA, Suvorov A, Wu H, Goltsov A, Loukianov E, Andreeva T, Gusev F, Manakhov A, Smigulina L, Logacheva M, Shtratnikova V, Kuznetsova I, Speranskiy-Podobed P, Burns JS, Williams PL, Korrick S, Lee MM, Rogaev E, Hauser R, Sergeyev O Peripubertal serum dioxin concentrations and subsequent sperm methylome profiles of young Russian adults. // Reprod Toxicol. 2018 Jun;78:40-49. doi: 10.1016/j.reprotox.2018.03.007
Saik OV, Demenkov PS, Ivanisenko TV, Bragina EY, Freidin MB, Goncharova IA, Dosenko VE, Zolotareva OI, Hofestaedt R, Lavrik IN, Rogaev EI, Ivanisenko VA. Novel candidate genes important for asthma and hypertension comorbidity revealed from associative gene networks. // BMC Med Genomics. 2018 Feb 13;11(Suppl 1):15. doi: 10.1186/s12920-018-0331-4.
Gunbin KV, Ponomarenko MP, Suslov VV, Gusev F, Fedonin GG, Rogaev EI. Evolution of Brain Active Gene Promoters in Human Lineage Towards the Increased Plasticity of Gene Regulation. // Mol Neurobiol. 2018 Mar;55(3):1871-1904. doi: 10.1007/s12035-017-0427-4
Kozlov EN, Martynova EU, Popenko VI, Schal C, Mukha DV. Intracellular Localization of Blattella germanica Densovirus (BgDV1) Capsid Proteins. // Viruses. 2018 Jul 14;10(7). pii: E370. doi: 10.3390/v10070370.
Miteva AS, Gaydukov AE, Shestopalov VI, Balezina OP. Mechanism of P2X7 receptor-dependent enhancement of neuromuscular transmission in pannexin 1 knockout mice. // Purinergic Signal. 2018 Oct 25. doi: 10.1007/s11302-018-9630-7.
Stepchenkova EI, Shiriaeva AA, Pavlov YI. Deletion of the DEF1 gene does not confer UV-immutability but frequently leads to self-diploidization in yeast Saccharomyces cerevisiae. // DNA Repair (Amst). 2018 Oct;70:49-54. doi: 10.1016/j.dnarep.2018.08.026
Zubritskiy A, Medvedeva YA. DNA sequence features in the establishing of H3K27ac. // Version 2. F1000Res. 2018 Feb 8 [revised 2018 Jan 1];7:165. doi:10.12688/f1000research.13441.2. eCollection 2018
Matveevsky S., Ivanitskaya E., Spangenberg V., Bakloushinskaya I., Kolomiets O. Reorganization of the Y Chromosomes Enhances Divergence in Israeli Mole Rats Nannospalax ehrenbergi (Spalacidae, Rodentia): Comparative Analysis of Meiotic and Mitotic Chromosomes. Genes 2018, 9, 272. doi:10.3390/genes9060272. http://www.mdpi.com/2073-4425/9/6/272

2017

развернуть

Matveevsky S, Kolomiets O, Bogdanov A, Hakhverdyan M, Bakloushinskaya I. Chromosomal Evolution in Mole Voles Ellobius (Cricetidae, Rodentia): Bizarre Sex Chromosomes, Variable Autosomes and Meiosis. // Genes (Basel). 2017. 8(11): E306. IF=3,6
Matveevsky SN, Pavlova SV, Atsaeva MM, Searle JB, Kolomiets OL. Dual mechanism of chromatin remodeling in the common shrew sex trivalent (XY1Y2). // Comp Cytogenet. 2017. 11(4):727-745. IF - 1,151
Blagodatskikh KA, Kramarov VM, Barsova EV, Garkovenko AV, Shcherbo DS, Shelenkov AA, Ustinova VV, Tokarenko MR, Baker SC, Kramarova TV, Ignatov KB. Improved DOP-PCR (iDOP-PCR): A robust and simple WGA method for efficient amplification of low copy number genomic DNA. // PLoS One. 2017 Sep 11;12(9):e0184507. doi: 10.1371/journal.pone.0184507 Импакт фактор - 2.806
Bondar N, Bryzgalov L, Ershov N, Gusev F, Reshetnikov V, Avgustinovich D, Tenditnik M, Rogaev E, Merkulova T. Molecular Adaptations to Social Defeat Stress and Induced Depression in Mice. // Mol Neurobiol. 2017 May 12. doi: 10.1007/s12035-017-0586-3.
Lukiw WJ, Rogaev EI. Genetics of Aggression in Alzheimer's Disease (AD). // Front Aging Neurosci. 2017 Apr 10;9:87. doi: 10.3389/fnagi.2017.00087.
Zolotarenko A, Chekalin E, Mehta R, Baranova A, Tatarinova TV, Bruskin S. Identification of Transcriptional Regulators of Psoriasis from RNA-Seq Experiments. // Methods Mol Biol. 2017;1613:355-370. doi: 10.1007/978-1-4939-7027-8_14.
Zhabagin M, Balanovska E, Sabitov Z, Kuznetsova M, Agdzhoyan A, Balaganskaya O, Chukhryaeva M, Markina N, Romanov A, Skhalyakho R, Zaporozhchenko V, Saroyants L, Dalimova D, Davletchurin D, Turdikulova S, Yusupov Y, Tazhigulova I, Akilzhanova A, Tyler-Smith C, Balanovsky O. The Connection of the Genetic, Cultural and Geographic Landscapes of Transoxiana. // Sci Rep. 2017 Jun 8;7(1):3085. doi: 10.1038/s41598-017-03176-z.
Khadzhieva MB, Kolobkov DS, Kamoeva SV, Salnikova LE. Expression changes in pelvic organ prolapse: a systematic review and in silico study. // Sci Rep. 2017 Aug 9;7(1):7668. doi: 10.1038/s41598-017-08185-6.
de Rie D, Abugessaisa I, Alam T, Arner E, Arner P, Ashoor H, Åström G, Babina M, Bertin N, Burroughs AM, Carlisle AJ, Daub CO, Detmar M, Deviatiiarov R, Fort A, Gebhard C, Goldowitz D, Guhl S, Ha TJ, Harshbarger J, Hasegawa A, Hashimoto K, Herlyn M, Heutink P, Hitchens KJ, Hon CC, Huang E, Ishizu Y, Kai C, Kasukawa T, Klinken P, Lassmann T, Lecellier CH, Lee W, Lizio M, Makeev V, Mathelier A, Medvedeva YA, Mejhert N, Mungall CJ, Noma S, Ohshima M, Okada-Hatakeyama M, Persson H, Rizzu P, Roudnicky F, Sætrom P, Sato H, Severin J, Shin JW, Swoboda RK, Tarui H, Toyoda H, Vitting-Seerup K, Winteringham L, Yamaguchi Y, Yasuzawa K, Yoneda M, Yumoto N, Zabierowski S, Zhang PG, Wells CA, Summers KM, Kawaji H, Sandelin A, Rehli M; FANTOM Consortium, Hayashizaki Y, Carninci P, Forrest ARR, de Hoon MJL. An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse. // Nat Biotechnol. 2017 Sep;35(9):872-878. doi: 10.1038/nbt.3947
Lu, M., Krutovsky K. V. , Nelson C.D., West J. B., Reilly N. A., Loopstra C. A. Association genetics of growth and adaptive traits in loblolly pine (Pinus taeda L.) using whole exome-discovered polymorphisms. // Tree Genetics and Genomes, 2017, 13(3): 57 IF = 2.132 http://link.springer.com/article/10.1007/s11295-017-1140-1
Johnson J.S., Gaddis K. D., Cairns D. M., Krutovsky K. V. Seed dispersal at alpine treeline: an assessment of seed movement within the alpine treeline ecotone. // Ecosphere, 2017, 8(1):e01649. IF = 2.860 10.1002/ecs2.1649
Spangenberg, V., Arakelyan, M., Galoyan, E., Matveevsky, S., Petrosyan, R., Bogdanov, Y., Danielyan F., Kolomiets, O. Reticulate Evolution of the Rock Lizards: Meiotic Chromosome Dynamics and Spermatogenesis in Diploid and Triploid Males of the Genus Darevskia. Genes, 2017, 8(6), 149. doi:10.3390/genes8060149 , Impact Factor 3.24

2016

развернуть

Hypermethylation of gene promoters in peripheral blood leukocytes in humans long term after radiation exposure. Kuzmina NS, Lapteva NSh, Rubanovich AV.Environ Res. 2016 Apr;146:10-7. IF 4.400
Whole exome sequencing links dental tumor to an autosomal-dominant mutation in ANO5 gene associated with gnathodiaphyseal dysplasia and muscle dystrophies. Andreeva TV, Tyazhelova TV, Rykalina VN, Gusev FE, Goltsov AY, Zolotareva OI, Aliseichik MP, Borodina TA, Grigorenko AP, Reshetov DA, Ginter EK, Amelina SS, Zinchenko RA, Rogaev EI. Sci Rep. 2016 May 24;6:26440. IF 5.578
microRNA-34a-Mediated Down-Regulation of the Microglial-Enriched Triggering Receptor and Phagocytosis-Sensor TREM2 in Age-Related Macular Degeneration. Bhattacharjee S, Zhao Y, Dua P, Rogaev EI, Lukiw WJ. PLoS One. 2016 Mar 7;11(3):e0150211 IF 3.234
Synthesis and antimycobacterial activity of N-(2-aminopurin-6-yl) and N-(purin-6-yl) amino acids and dipeptides. Krasnov VP, Vigorov AY, Musiyak VV, Nizova IA, Gruzdev DA, Matveeva TV, Levit GL, Kravchenko MA, Skornyakov SN, Bekker OB, Danilenko VN, Charushin VN. Bioorg Med Chem Lett. 2016 Jun 1;26(11):2645-8. IF 2.420
Helen E. Roy, Peter M. J. Brown, Tim Adriaens, Nick Berkvens, Isabel Borges, Susana Clusella-Trullas, Richard F. Comont, Patrick De Clercq, Rene Eschen , Arnaud Estoup, Edward W. Evans, Benoit Facon, Mary M. Gardiner, Artur Gil, Audrey A. Grez, Thomas Guillemaud, Danny Haelewaters, Annette Herz, Alois Honek, Andy G. Howe, Cang Hui, William D. Hutchison, Marc Kenis, Robert L. Koch, Jan Kulfan, Lori Lawson Handley, Eric Lombaert, Antoon Loomans, John Losey, Alexander O. Lukashuk, Dirk Maes, Alexandra Magro, Katie M. Murray, Gilles San Martin, Zdenka Martinkova, Ingrid A. Minnaar, Oldřich Nedved, Marina J. Orlova-Bienkowskaja, Naoya Osawa, Wolfgang Rabitsch, Hans Peter Ravn, Gabriele Rondoni, Steph L. Rorke, Sergey K. Ryndevich, May-Guri Saethre, John J. Sloggett, Antonio Onofre Soares, Riaan Stals, Matthew C. Tinsley, Axel Vandereycken, Paul van Wielink, Sandra Viglášová, Peter Zach, Ilya A. Zakharov, Tania Zaviezo, Zihua Zhao. The harlequin ladybird, Harmonia axyridis: global perspectives on invasion history and ecology. Biol Invasions (2016) 18:997–1044. Impact Factor; 2.586.

2015

развернуть

The evolution of Homo sapiens denisova and Homo sapiens neanderthalensis miRNA targeting genes in the prenatal and postnatal brain. Gunbin KV, Afonnikov DA, Kolchanov NA, Derevianko AP, Rogaev EI. BMC Genomics. 2015;16 Suppl 13:S4. IF 3.986
Genomic evidence for the Pleistocene and recent population history of Native Americans. Raghavan M, Steinrücken M, Harris K, Schiffels S, Rasmussen S, DeGiorgio M, Albrechtsen A, Valdiosera C, Ávila-Arcos MC, Malaspinas AS, Eriksson A, Moltke I, Metspalu M, Homburger JR, Wall J, Cornejo OE, Moreno-Mayar JV, Korneliussen TS, Pierre T, Rasmussen M, Campos PF, Damgaard Pde B, Allentoft ME, Lindo J, Metspalu E, Rodríguez-Varela R, Mansilla J, Henrickson C, Seguin-Orlando A, Malmström H, Stafford T Jr, Shringarpure SS, Moreno-Estrada A, Karmin M, Tambets K, Bergström A, Xue Y, Warmuth V, Friend AD, Singarayer J, Valdes P, Balloux F, Leboreiro I, Vera JL, Rangel-Villalobos H, Pettener D, Luiselli D, Davis LG, Heyer E, Zollikofer CP, Ponce de León MS, Smith CI, Grimes V, Pike KA, Deal M, Fuller BT, Arriaza B, Standen V, Luz MF, Ricaut F, Guidon N, Osipova L, Voevoda MI, Posukh OL, Balanovsky O, Lavryashina M, Bogunov Y, Khusnutdinova E, Gubina M, Balanovska E, Fedorova S, Litvinov S, Malyarchuk B, Derenko M, Mosher MJ, Archer D, Cybulski J, Petzelt B, Mitchell J, Worl R, Norman PJ, Parham P, Kemp BM, Kivisild T, Tyler-Smith C, Sandhu MS, Crawford M, Villems R, Smith DG, Waters MR, Goebel T, Johnson JR, Malhi RS, Jakobsson M, Meltzer DJ, Manica A, Durbin R, Bustamante CD, Song YS, Nielsen R, Willerslev E. // Science. 2015 Aug 21;349(6250):aab3884.
Genetic Heritage of the Balto-Slavic Speaking Populations: A Synthesis of Autosomal, Mitochondrial and Y-Chromosomal Data. Kushniarevich A, Utevska O, Chuhryaeva M, Agdzhoyan A, Dibirova K, Uktveryte I, Möls M, Mulahasanovic L, Pshenichnov A, Frolova S, Shanko A, Metspalu E, Reidla M, Tambets K, Tamm E, Koshel S, Zaporozhchenko V, Atramentova L, Kučinskas V, Davydenko O, Goncharova O, Evseeva I, Churnosov M, Pocheshchova E, Yunusbayev B, Khusnutdinova E, Marjanović D, Rudan P, Rootsi S, Yankovsky N, Endicott P, Kassian A, Dybo A; Genographic Consortium, Tyler-Smith C, Balanovska E, Metspalu M, Kivisild T, Villems R, Balanovsky O. // PLoS One. 2015 Sep 2;10(9):e0135820
Genome-wide signatures of male-mediated migration shaping the Indian gene pool. ArunKumar G, Tatarinova TV, Duty J, Rollo D, Syama A, Arun VS, Kavitha VJ, Triska P, Greenspan B, Wells RS, Pitchappan R; Genographic Consortium. // J Hum Genet. 2015 May 21. doi: 10.1038/jhg.2015.51.
The genetic legacy of the expansion of Turkic-speaking nomads across Eurasia. Yunusbayev B, Metspalu M, Metspalu E, Valeev A, Litvinov S, Valiev R, Akhmetova V, Balanovska E, Balanovsky O, Turdikulova S, Dalimova D, Nymadawa P, Bahmanimehr A, Sahakyan H, Tambets K, Fedorova S, Barashkov N, Khidiyatova I, Mihailov E, Khusainova R, Damba L, Derenko M, Malyarchuk B, Osipova L, Voevoda M, Yepiskoposyan L, Kivisild T, Khusnutdinova E, Villems R. // PLoS Genet. 2015 Apr 21;11(4):e1005068. doi: 10.1371/journal.pgen.1005068. eCollection 2015 Apr.
Deep phylogenetic analysis of haplogroup G1 provides estimates of SNP and STR mutation rates on the human Y-chromosome and reveals migrations of Iranic speakers. Balanovsky O, Zhabagin M, Agdzhoyan A, Chukhryaeva M, Zaporozhchenko V, Utevska O, Highnam G, Sabitov Z, Greenspan E, Dibirova K, Skhalyakho R, Kuznetsova M, Koshel S, Yusupov Y, Nymadawa P, Zhumadilov Z, Pocheshkhova E, Haber M, A Zalloua P, Yepiskoposyan L, Dybo A, Tyler-Smith C, Balanovska E. // PLoS One. 2015 Apr 7;10(4):e0122968.
A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture. Karmin M, Saag L, Vicente M, Wilson Sayres MA, Järve M, Talas UG, Rootsi S, Ilumäe AM, Mägi R, Mitt M, Pagani L, Puurand T, Faltyskova Z, Clemente F, Cardona A, Metspalu E, Sahakyan H, Yunusbayev B, Hudjashov G, DeGiorgio M, Loogväli EL, Eichstaedt C, Eelmets M, Chaubey G, Tambets K, Litvinov S, Mormina M, Xue Y, Ayub Q, Zoraqi G, Korneliussen TS, Akhatova F, Lachance J, Tishkoff S, Momynaliev K, Ricaut FX, Kusuma P, Razafindrazaka H, Pierron D, Cox MP, Sultana GN, Willerslev R, Muller C, Westaway M, Lambert D, Skaro V, Kovačevic L, Turdikulova S, Dalimova D, Khusainova R, Trofimova N, Akhmetova V, Khidiyatova I, Lichman DV, Isakova J, Pocheshkhova E, Sabitov Z, Barashkov NA, Nymadawa P, Mihailov E, Seng JW, Evseeva I, Migliano AB, Abdullah S, Andriadze G, Primorac D, Atramentova L, Utevska O, Yepiskoposyan L, Marjanovic D, Kushniarevich A, Behar DM, Gilissen C, Vissers L, Veltman JA, Balanovska E, Derenko M, Malyarchuk B, Metspalu A, Fedorova S, Eriksson A, Manica A, Mendez FL, Karafet TM, Veeramah KR, Bradman N, Hammer MF, Osipova LP, Balanovsky O, Khusnutdinova EK, Johnsen K, Remm M, Thomas MG, Tyler-Smith C, Underhill PA, Willerslev E, Nielsen R, Metspalu M, Villems R, Kivisild T. // Genome Res. 2015 Apr;25(4):459-66.
Diacylglyceryltrimethylhomoserine content and gene expression changes triggered by phosphate deprivation in the mycelium of the basidiomycete Flammulina velutipes. Senik SV, Maloshenok LG, Kotlova ER, Shavarda AL, Moiseenko KV, Bruskin SA, Koroleva OV, Psurtseva NV. // Phytochemistry. 2015 Sep;117:34-42.
Single-Cell Analyses of ESCs Reveal Alternative Pluripotent Cell States and Molecular Mechanisms that Control Self-Renewal. Papatsenko D, Darr H, Kulakovskiy IV, Waghray A, Makeev VJ, MacArthur BD, Lemischka IR. // Stem Cell Reports. 2015 Aug 11;5(2):207-20.
Phenomenon of individual difference in human monocyte activation. Orekhov AN, Nikiforov NG, Elizova NV, Ivanova EA, Makeev VJ. // Exp Mol Pathol. 2015 Aug;99(1):151-4.
Protasova MS, Grigorenko AP, Tyazhelova TV, Andreeva TV, Reshetov DA, Gusev FE, Laptenko AE, Kuznetsova IL, Goltsov AY, Klyushnikov SA, Illarioshkin SN, Rogaev EI. Whole-genome sequencing identifies a novel ABCB7 gene mutation for X-linked congenital cerebellar ataxia in a large family of Mongolian ancestry. // Eur J Hum Genet. 2015 Aug 5. doi: 10.1038/ejhg.2015.139.
Shepelev VA, Uralsky LI, Alexandrov AA, Yurov YB, Rogaev EI, Alexandrov IA. Annotation of suprachromosomal families reveals uncommon types of alpha satellite organization in pericentromeric regions of hg38 human genome assembly. // Genom Data. 2015 Sep 1;5:139-146.
Bai G, Cheung I, Shulha HP, Coelho JE, Li P, Dong X, Jakovcevski M, Wang Y, Grigorenko A, Jiang Y, Hoss A, Patel K, Zheng M, Rogaev E, Myers RH, Weng Z, Akbarian S, Chen JF. Epigenetic dysregulation of hairy and enhancer of split 4 (HES4) is associated with striatal degeneration in postmortem Huntington brains. // Hum Mol Genet. 2015 Mar 1;24(5):1441-56.
Complete Genome Sequence of Bifidobacterium longum GT15: Identification and Characterization of Unique and Global Regulatory Genes. Zakharevich NV, Averina OV, Klimina KM, Kudryavtseva AV, Kasianov AS, Makeev VJ, Danilenko VN. Microb Ecol. 2015 Apr 17. [Epub ahead of print]
Discovery of molecular markers to discriminate corneal endothelial cells in the human body. Yoshihara M, Ohmiya H, Hara S, Kawasaki S; FANTOM consortium (Makeev V et al.), Hayashizaki Y, Itoh M, Kawaji H, Tsujikawa M, Nishida K. PLoS One. 2015 Mar 25;10(3):e0117581.
The statistical geometry of transcriptome divergence in cell-type evolution and cancer. Liang C; FANTOM Consortium (Makeev V et al.) , Forrest AR, Wagner GP. // Nat Commun. 2015 Jan 14;6:6066.
Effects of genetic drift in a small population of Atlantic cod (Gadus morhua kildinensis Derjugin) landlocked in a meromictic lake: genetic variation and conservation measures. Zhivotovsky, L. A., Teterina, A. A., Mukhina, N. V., Stroganov, A. N., Rubtsova, G. A., & Afanasiev, K. I. // Conservation Genetics, 1-10. DOI: 10.1007/s10592-015-0774-5
Efficiency of the inbreeding coefficient f and other estimators in detecting null alleles, as revealed by empirical data of locus oke3 across 65 populations of chum salmon Oncorhynchus keta. Zhivotovsky LA, Kordicheva SY, Shaikhaev EG, Rubtsova GA, Afanasiev KI, Shitova MV, Fuller SA, Shaikhaev GO, Gharrett AJ.// J Fish Biol. 2015 Jan;86(1):402-8
Functional analysis of the type II toxin-antitoxin systems of the MazEF and RelBE families in Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697. Averina O, Alekseeva M, Shkoporov A, Danilenko V. // Anaerobe. 2015 Jul 23;35(Pt B):59-67.
Draft Genome Sequences of Two Pyrazinamide-Resistant Clinical Isolates, Mycobacterium tuberculosis 13-4152 and 13-2459. Maslov DA, Shur KV, Bekker OB, Zakharevich NV, Zaichikova MV, Klimina KM, Smirnova TG, Zhang Y, Chernousova LN, Danilenko VN. // Genome Announc. 2015 Jul 2;3(4). pii: e00758-15.
Draft Genome Sequences of Bifidobacterium angulatum GT102 and Bifidobacterium adolescentis 150: Focusing on the Genes Potentially Involved in the Gut-Brain Axis. Dyachkova MS, Klimina KM, Kovtun AS, Zakharevich NV, Nezametdinova VZ, Averina OV, Danilenko VN. // Genome Announc. 2015 Jul 2;3(4). pii: e00709-15.
Resistance to pyrazinamide in Russian Mycobacterium tuberculosis isolates: pncA sequencing versus Bactec MGIT 960. Maslov DA, Zaĭchikova MV, Chernousova LN, Shur KV, Bekker OB, Smirnova TG, Larionova EE, Andreevskaya SN, Zhang Y, Danilenko VN. // Tuberculosis (Edinb). 2015 Sep;95(5):608-12.
Draft Genome Sequence of Mycobacterium tuberculosis Strain E186hv of Beijing B0/W Lineage with Reduced Virulence. Shur KV, Klimina KM, Zakharevich NV, Maslov DA, Bekker OB, Zaychikova MV, Kamaev EY, Kravchenko MA, Skornyakov SN, Zhang Y, Danilenko VN. // Genome Announc. 2015 May 7;3(3). pii: e00403-15.
Draft Genome Sequences of Lactobacillus plantarum Strain 90sk and Lactobacillus brevis Strain 15f: Focusing on Neurotransmitter Genes. Yunes RA, Klimina KM, Emelyanov KV, Zakharevich NV, Poluektova EU, Danilenko VN. // Genome Announc. 2015 Apr 16;3(2). pii: e00261-15.
Expression of the toxin-antitoxin genes yefMLrh , yoeBLrh in human Lactobacillus rhamnosus isolates. Krügel H, Klimina KM, Mrotzek G, Tretyakov A, Schöfl G, Saluz HP, Brantl S, Poluektova EU, Danilenko VN. // J Basic Microbiol. 2015 Aug;55(8):982-91.
FoF1-ATP synthase of Streptomyces fradiae ATCC 19609: structural, biochemical, and functional characterization. Alekseeva MG, Mironcheva TA, Mavletova DA, Elizarov SM, Zakharevich NV, Danilenko VN. // Biochemistry (Mosc). 2015 Mar;80(3):296-309
The association of PLA2G2A single nucleotide polymorphisms with type IIa secretory phospholipase A2 level but not its activity in patients with stable coronary heart disease. Shuvalova YA, Khasanova ZB, Kaminnaya VI, Samoilova EV, Korotaeva AA, Rubanovich AV, Kaminnyi AI. // Gene. 2015 Jun 10;564(1):29-34. IF 2.082
Verification of the Chromosome Region 9q21 Association with Pelvic Organ Prolapse Using RegulomeDB Annotations. Khadzhieva MB, Kolobkov DS, Kamoeva SV, Ivanova AV, Abilev SK, Salnikova LE. // Biomed Res Int. 2015;2015:837904.
Germline and somatic genetic predictors of pathological response in neoadjuvant settings of rectal and esophageal cancers: systematic review and meta-analysis. Salnikova LE, Kolobkov DS.// Pharmacogenomics J. 2015 Jun 30.
Association of the apolipoprotein E 2 allele with concurrent occurrence of endometrial hyperplasia and endometrial carcinoma. Ivanova TI, Krikunova LI, Ryabchenko NI, Mkrtchyan LS, Khorokhorina VA, Salnikova LE. // Oxid Med Cell Longev. 2015;2015:593658.
Clinical associations of host genetic variations in the genes of cytokines in critically ill patients. Belopolskaya OB, Smelaya TV, Moroz VV, Golubev AM, Salnikova LE. // Clin Exp Immunol. 2015 Jun;180(3):531-41.
Poliakov, E., Cooper, D. N., Stepchenkova, E. I., & Rogozin, I. B. (2015). Genetics in Genomic Era. Genetics research international. dx.doi.org/10.1155/2015/364960
Badaeva, E. D., Keilwagen, J., Knüpffer, H., Waßermann, L., Dedkova, O. S., Mitrofanova, O. P., ... & Kilian, B. (2015). Chromosomal Passports Provide New Insights into Diffusion of Emmer Wheat. PloS one, 10(5), e0128556.
Prepubertal Serum Concentrations of Organochlorine Pesticides and Age at Sexual Maturity in Russian Boys. Lam T, Williams PL, Lee MM, Korrick SA, Birnbaum LS, Burns JS, Sergeyev O, Revich B, Altshul LM, Patterson DG Jr, Hauser R. // Environ Health Perspect. 2015 May 22
Zhivotovsky L.A. Relationships Between Wright’s FST and FISStatistics in a Context of Wahlund Effect // J. Hered. 2015 (published online 17/04/2015) - IF 1.969
Dorokhov Yu. L. , Shindyapina A.V., Sheshukova E.V., Komarova T.V. Metabolic Methanol: Molecular Pathways and Physiological Roles // Physiological Reviews Published 1 April 2015 Vol. 95 no. 2, 603-644 - IF 35.456
Dasgupta M.G., Dharanishanthi V., Agarwal I., Krutovsky K.V.Development of genetic markers in Eucalyptus species by target enrichment and exome sequencing // PLoS One. 2015.10(1): e0116528. doi:10.1371/journal.pone.011652 (http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0116528&representation=PDF)
Bogomazova AN, Vassina EM, Goryachkovskaya TN, Popik VM, Sokolov AS, Kolchanov NA, Lagarkova MA, Kiselev SL, Peltek SE. No DNA damage response and negligible genome-wide transcriptional changes in human embryonic stem cells exposed to terahertz radiation. Sci Rep. 2015 Jan 13;5:7749. doi: 10.1038/srep07749

2014

развернуть

Rykalina VN, Shadrin AA, Amstislavskiy VS, Rogaev EI, Lehrach H, Borodina TA. Exome sequencing from nanogram amounts of starting DNA: comparing three approaches. // vPLoS One. 2014 Jul 3;9(7):e101154.
Bogomazova AN, Lagarkova MA, Panova AV, Nekrasov ED, Kiselev SL. Reactivation of Х chromosome upon reprogramming leads to changes in the replication pattern and 5hmC accumulation. Chromosoma. 2014 Mar;123(1-2):117-28
Rykalina VN, Shadrin AA, Amstislavskiy VS, Rogaev EI, Lehrach H, Borodina TA. Exome sequencing from nanogram amounts of starting DNA: comparing three approaches. PLoS One. 2014 Jul 3;9(7):e101154
Bai G, Cheung I, Shulha HP, Coelho JE, Li P, Dong X, Jakovcevski M, Wang Y, Grigorenko A, Jiang Y, Hoss A, Patel K, Zheng M, Rogaev E, Myers RH, Weng Z, Akbarian S, Chen JF. Epigenetic dysregulation of hairy and enhancer of split 4 (HES4) is associated with striatal degeneration in postmortem Huntington brains. Hum Mol Genet. 2014 Dec 5. pii: ddu561.
Veytsman B, Wang L, Cui T, Bruskin S, Baranova A. Distance-based classifiers as potential diagnostic and prediction tools for human diseases. BMC Genomics. 2014 Dec 19;15 Suppl 12:S10.
Pogorelko GV, Mokryakova M, Fursova OV, Abdeeva I, Piruzian ES, Bruskin SA. Characterization of three Arabidopsis thaliana immunophilin genes involved in the plant defense response against Pseudomonas syringae. Gene. 2014 Mar 15;538(1):12-22.
Mezentsev A, Nikolaev A, Bruskin S. Matrix metalloproteinases and their role in psoriasis. Gene. 2014 Apr 25;540(1):1-10.
Khadzhieva MB, Kamoeva SV, Chumachenko AG, Ivanova AV, Volodin IV, Vladimirov IS, Abilev SK, Salnikova LE. Fibulin-5 (FBLN5) gene polymorphism is associated with pelvic organ prolapse. Maturitas. 2014 Aug;78(4):287-92
Zakharevich NV, Averina OV, Klimina KM, Kudryavtseva AV, Kasianov AS, Makeev VJ, Danilenko VN. Complete Genome Sequence of Bifidobacterium longum GT15: Unique Genes for Russian Strains. Genome Announc. 2014 Dec 18;2(6).
Bekker OB, Klimina KM, Vatlin AA, Zakharevich NV, Kasianov AS, Danilenko VN. Draft Genome Sequence of Streptomyces fradiae ATCC 19609, a Strain Highly Sensitive to Antibiotics. Genome Announc. 2014 Dec 4;2(6).
Lysenkova LN, Turchin KF, Korolev AM, Danilenko VN, Bekker OB, Dezhenkova LG, Shtil AA, Preobrazhenskaya MN. Study on retroaldol degradation products of antibiotic oligomycin A. J Antibiot (Tokyo). 2014 Feb;67(2):153-8
Knappskog S, Gansmo LB, Dibirova K, Metspalu A, Cybulski C, Peterlongo P, Aaltonen L, Vatten L, Romundstad P, Hveem K, Devilee P, Evans GD, Lin D, Van Camp G, Manolopoulos VG, Osorio A, Milani L, Ozcelik T, Zalloua P, Mouzaya F, Bliznetz E, Balanovska E, Pocheshkova E, Kučinskas V, Atramentova L, Nymadawa P, Titov K, Lavryashina M, Yusupov Y, Bogdanova N, Koshel S, Zamora J, Wedge DC, Charlesworth D, Dörk T, Balanovsky O, Lønning PE. Population distribution and ancestry of the cancer protective MDM2 SNP285 (rs117039649). Oncotarget. 2014 Sep 30;5(18):8223-34.
Krutovsky K.V., Tretyakova I.N., Oreshkova N.V., Pak M.E., Kvitko O.V., Vaganov E.A. Somaclonal variation of haploid in vitro tissue culture obtained from Siberian larch (Larix sibiricaLedeb.) megagametophytes for whole genome de novosequencing // In Vitro Cellular and Developmental Biology – Plant. 2014. V. 50. № 5. P. 655-664.
Koralewski, T.E., Brooks, J.E. and K.V. Krutovsky. Molecular evolution of drought tolerance and wood strength related candidate genes in loblolly pine (Pinus taeda L.) // Silvae Genetica. 2014. V. 63. № 1-2. P. 59-66.
Zhivotovsky L.A., S.Yu. Kordicheva, E.G. Shaikhaev, G.A. Rubtsova, K.I. Afanasiev, M.V. Shitova, S.A. Fuller, G.O. Shaikhaev, A.J. Gharrett. 2014. Efficiency of the inbreeding coefficient f and other estimators in detecting null alleles, as revealed by empirical data of locus Oke3 across 65 populations of chum salmon, Oncorhynchus keta. Journal of Fish Biology (doi: 10.1111/jfb.12568) - IF 1.734
Zhivotovsky L.A., A.A. Yurchenko, V.D. Nikitin, S.N. Safronov, M.V. Shitova, S.F. Zolotukhin, S.S. Makeev, S. Weiss, P.S. Rand, A.Yu. Semenchenko. 2014. Eco-geographic units, population hierarchy, and a two-level conservation strategy with reference to a critically endangered salmonid, Sakhalin taimen Parahucho perryi. Conservation Genetics (doi: 10.1007/s10592-014-0670-4) - IF 1.846
Pavlova G.V., Vergun A.A., Rybalkina E.Yu., Butovskaya P.R. , Ryskov A.P. Identification of Structural DNA Variations in Human Cell Cultures after Long-Term Passage.// Cell Cycle. 2015, Vol.14, Issue 1, doi. org/10.4161/15384101.2014.974427. IF 5.0
Slavokhotova AA, Rogozhin EA, Musolyamov AK, Andreev YA, Oparin PB, Berkut AA, Vassilevski AA, Egorov TA, Grishin EV, Odintsova TI. Novel antifungal α-hairpinin peptide from Stellaria media seeds: structure, biosynthesis, gene structure and evolution. Plant Mol Biol. 2014. V. 84(1-2). P. 189-202. IF 4.072
Sachkova MY, Slavokhotova AA, Grishin EV, Vassilevski AA. Structure of the yellow sac spider Cheiracanthium punctorium genes provides clues to evolution of insecticidal two-domain knottin toxins. Insect Mol Biol. 2014. V. 23(4). P. 527-38. IF 2.976
Sachkova MY, Slavokhotova AA, Grishin EV, Vassilevski AA. Genes and evolution of two-domain toxins from lynx spider venom. FEBS Lett. 2014. V. 588(5). P. 740-5. IF 3.341
Berkut AA, Usmanova DR, Peigneur S, Oparin PB, Mineev KS, Odintsova TI, Tytgat J, Arseniev AS, Grishin EV, Vassilevski AA. Structural Similarity between Defense Peptide from Wheat and Scorpion Neurotoxin Permits Rational Functional Design. J Biol Chem. 2014. V. 289(20). P. 14331-40. IF 4.6
Slavokhotova AA, Naumann TA, Price NP, Rogozhin EA, Andreev YA, Vassilevski AA, Odintsova TI. Novel mode of action in plant defense peptides: hevein-like antimicrobial peptides from wheat inhibit fungal metalloproteases. FEBS J. 2014. V. 281(20). P. 4754-64. IF 3.986
Zvyagin I.V. , Pogorelyy M.V., Ivanova M. E. , Komech M. E. , Shugay M. , Bolotin D.A. , Shelenkov A.A., Kurnosov A.A. , Staroverov D.B. , Chudakov D.M. , Lebedev Y.B., Mamedov I.Z. Distinctive properties of identical twins' TCR repertoires revealed by high-throughput sequencing. PNAS, 2014, 111(16):5980-5, doi: 10.1073/pnas.1319389111 - IF 9.809 (лаб. функциональной геномики)
Ignatov KB, Barsova EV, Fradkov AF, Blagodatskikh KA, Kramarova TV, Kramarov VM. A strong strand displacement activity of thermostable DNA polymerase markedly improves the results of DNA amplification. Biotechniques. 2014 Aug 1;57(2):81-7. IF - 2.754 (лаб. анализа генома)
Статья поставлена журналом Biotechniques на первое место в обзоре достижений в области ПЦР за 2014 год BioTechniques - PCR: 2014 Year in Review Lazaridis I, Patterson N, Mittnik A, Renaud G, Mallick S, Kirsanow K, Sudmant PH, Schraiber JG, Castellano S, Lipson M, Berger B, Economou C, Bollongino R, Fu Q, Bos KI, Nordenfelt S, Li H, de Filippo C, Prüfer K, Sawyer S, Posth C, Haak W, Hallgren F, Fornander E, Rohland N, Delsate D, Francken M, Guinet JM, Wahl J, Ayodo G, Babiker HA, Bailliet G, Balanovska E, Balanovsky O, Barrantes R, Bedoya G, Ben-Ami H, Bene J, Berrada F, Bravi CM, Brisighelli F, Busby GB, Cali F, Churnosov M, Cole DE, Corach D, Damba L, van Driem G, Dryomov S, Dugoujon JM, Fedorova SA, Gallego Romero I, Gubina M, Hammer M, Henn BM, Hervig T, Hodoglugil U, Jha AR, Karachanak-Yankova S, Khusainova R, Khusnutdinova E, Kittles R, Kivisild T, Klitz W, Kučinskas V, Kushniarevich A, Laredj L, Litvinov S, Loukidis T, Mahley RW, Melegh B, Metspalu E, Molina J, Mountain J, Näkkäläjärvi K, Nesheva D, Nyambo T, Osipova L, Parik J, Platonov F, Posukh O, Romano V, Rothhammer F, Rudan I, Ruizbakiev R, Sahakyan H, Sajantila A, Salas A, Starikovskaya EB, Tarekegn A, Toncheva D, Turdikulova S, Uktveryte I, Utevska O, Vasquez R, Villena M, Voevoda M, Winkler CA, Yepiskoposyan L, Zalloua P, Zemunik T, Cooper A, Capelli C, Thomas MG, Ruiz-Linares A, Tishkoff SA, Singh L, Thangaraj K, Villems R, Comas D, Sukernik R, Metspalu M, Meyer M, Eichler EE, Burger J, Slatkin M, Pääbo S, Kelso J, Reich D, Krause J. Ancient human genomes suggest three ancestral populations for present-day Europeans. // Nature. 2014 Sep 18;513(7518):409-13. doi: 10.1038/nature13673. – IF F 42.351
Association between alcohol and cardiovascular disease: Mendelian randomisation analysis based on individual participant data. Holmes MV, Dale CE, Zuccolo L, Silverwood RJ, Guo Y, Ye Z, Prieto-Merino D, Dehghan A, Trompet S, Wong A, Cavadino A, Drogan D, Padmanabhan S, Li S, Yesupriya A, Leusink M, Sundstrom J, Hubacek JA, Pikhart H, Swerdlow DI, Panayiotou AG, Borinskaya SA, Finan C, Shah S, Kuchenbaecker KB, Shah T, Engmann J, Folkersen L, Eriksson P, Ricceri F, Melander O, Sacerdote C, Gamble DM, Rayaprolu S, Ross OA, McLachlan S, Vikhireva O, Sluijs I, Scott RA, Adamkova V, Flicker L, Bockxmeer FM, Power C, Marques-Vidal P, Meade T, Marmot MG, Ferro JM, Paulos-Pinheiro S, Humphries SE, Talmud PJ, Mateo Leach I, Verweij N, Linneberg A, Skaaby T, Doevendans PA, Cramer MJ, Harst Pv, Klungel OH, Dowling NF, Dominiczak AF, Kumari M, Nicolaides AN, Weikert C, Boeing H, Ebrahim S, Gaunt TR, Price JF, Lannfelt L, Peasey A, Kubinova R, Pajak A, Malyutina S, Voevoda MI, Tamosiunas A, Maitland-van der Zee AH, Norman PE, Hankey GJ, Bergmann MM, Hofman A, Franco OH, Cooper J, Palmen J, Spiering W, Jong PA, Kuh D, Hardy R, Uitterlinden AG, Ikram MA, Ford I, Hyppönen E, Almeida OP, Wareham NJ, Khaw KT, Hamsten A, Husemoen LL, Tjønneland A, Tolstrup JS, Rimm E, Beulens JW, Verschuren WM, Onland-Moret NC, Hofker MH, Wannamethee SG, Whincup PH, Morris R, Vicente AM, Watkins H, Farrall M, Jukema JW, Meschia J, Cupples LA, Sharp SJ, Fornage M, Kooperberg C, LaCroix AZ, Dai JY, Lanktree MB, Siscovick DS, Jorgenson E, Spring B, Coresh J, Li YR, Buxbaum SG, Schreiner PJ, Ellison RC, Tsai MY, Patel SR, Redline S, Johnson AD, Hoogeveen RC, Hakonarson H, Rotter JI, Boerwinkle E, Bakker PI, Kivimaki M, Asselbergs FW, Sattar N, Lawlor DA, Whittaker J, Davey Smith G, Mukamal K, Psaty BM, Wilson JG, Lange LA, Hamidovic A, Hingorani AD, Nordestgaard BG, Bobak M, Leon DA, Langenberg C, Palmer TM, Reiner AP, Keating BJ, Dudbridge F, Casas JP; InterAct Consortium. Association between alcohol and cardiovascular disease: Mendelian randomisation analysis based on individual participant data // BMJ. 2014 Jul 10;349:g4164. doi: 10.1136/bmj.g4164. Free Full Text – IF 16.378 Подробнее
Moroz LL, Kocot KM, Citarella MR, Dosung S, Norekian TP, Povolotskaya IS, Grigorenko AP, Dailey C, Berezikov E, Buckley KM, Ptitsyn A, Reshetov D, Mukherjee K, Moroz TP, Bobkova Y, Yu F, Kapitonov VV, Jurka J, Bobkov YV, Swore JJ, Girardo DO, Fodor A, Gusev F, Sanford R, Bruders R, Kittler E, Mills CE, Rast JP, Derelle R, Solovyev VV, Kondrashov FA, Swalla BJ, Sweedler JV, Rogaev EI, Halanych KM, Kohn AB. The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems. // Nature. 2014 Jun 5;510(7503):109-14. – IF 42.351 ПРЕСС-РЕЛИЗ
Geographic population structure analysis of worldwide human populations infers their biogeographical origins. Elhaik E, Tatarinova T, Chebotarev D, Piras IS, Maria Calò C, De Montis A, Atzori M, Marini M, Tofanelli S, Francalacci P, Pagani L, Tyler-Smith C, Xue Y, Cucca F, Schurr TG, Gaieski JB, Melendez C, Vilar MG, Owings AC, Gómez R, Fujita R, Santos FR, Comas D, Balanovsky O, Balanovska E, Zalloua P, Soodyall H, Pitchappan R, Ganeshprasad A, Hammer M, Matisoo-Smith L, Wells RS; Genographic Consortium. // Nat Commun. 2014 Apr 29;5:3513. doi: 10.1038/ncomms4513. - IF 10.742
FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT), Forrest AR, Kawaji H, Rehli M, Baillie JK, de Hoon MJ, Lassmann T, Itoh M, Summers KM, Suzuki H, Daub CO, Kawai J, Heutink P, Hide W, Freeman TC, Lenhard B, Bajic VB, Taylor MS, Makeev VJ, Sandelin A, Hume DA, Carninci P, Hayashizaki Y. A promoter-level mammalian expression atlas. // Nature. 2014 Mar 27;507(7493):462-70. doi: 10.1038/nature13182. – IF 42.351 ПРЕСС-РЕЛИЗ
Salnikova L.E. Clinicopathologic Characteristics of Brain Tumors Are Associated with the Presence and Patterns of TP53 Mutations: Evidence from the IARC TP53 Database. // Neuromolecular Med. 2014 Jan 31. [Epub ahead of print] DOI: 10.1007/s12017-014-8290-1 – IF 4.492
Salnikova LE, Smelaya TV, Vesnina IN, Golubev AM, Moroz VV. Genetic Susceptibility to Nosocomial Pneumonia, Acute Respiratory Distress Syndrome and Poor Outcome in Patients at Risk of Critical Illness. // Inflammation 2014; 37(2):295-305. DOI: 10.1007/s10753-013-9740-x – IF 2.457
Khadzhieva MB, Lutcenko NN, Volodin IV, Morozova KV, Salnikova LE. Association of Oxidative Stress Related Genes with Idiopathic Recurrent Miscarriage. // Free Radical Research. 2014;48(5):534-541. DOI:10.3109/10715762.2014.891735 – IF 3.279
Mezentsev A, Nikolaev A, Bruskin S. Matrix metalloproteinases and their role in psoriasis. // Gene. 2014 Apr 25;540(1):1-10. – IF 2.341
The FANTOM Consortium and the RIKEN PMI and CLST (DGT), в том числе сотрудники ИОГен Иван Кулаковский, Юлия Медведева, Александр Фаворов, Артем Касьянов, Илья Воронцов и Всеволод Макеев: A promoter-level mammalian expression atlas // Nature 507, 462–470 (27 March 2014) -- IF F 42.351
Lomakin YA, Zakharova MY, Stepanov AV, Dronina MA, Smirnov IV, Bobik TV, Pyrkov AY, Tikunova NV, Sharanova SN, Boitsov VM, Vyazmin SY, Kabilov MR, Tupikin AE, Krasnov AN, Bykova NA, Medvedeva YA, Fridman MV, Favorov AV, Ponomarenko NA, Dubina MV, Boyko AN, Vlassov VV, Belogurov Jr AA, Gabibov AG. Heavy-light chain interrelations of MS-associated immunoglobulins probed by deep sequencing and rational variation.// Mol Immunol. 2014 Feb 14. pii: S0161-5890(14)00023-6. doi: 10.1016/j.molimm.2014.01.013 -- IF 2.645
Medvedeva YA, Khamis AM, Kulakovskiy IV, Ba-Alawi W, Bhuyan MS, Kawaji H, Lassmann T, Harbers M, Forrest AR, Bajic VB; FANTOM consortium. Effects of cytosine methylation on transcription factor binding sites. // BMC Genomics. 2014 Mar 26;15(1):119. doi: 10.1186/1471-2164-15-119. -- IF 4.40
Levitsky VG, Kulakovskiy IV, Ershov NI, Oschepkov DY, Makeev VJ, Hodgman TC, Merkulova TI. Application of experimentally verified transcription factor binding sites models for computational analysis of ChIP-Seq data. BMC Genomics. 2014 Jan 29; 15(1):80. -- IF 4.40
Underhill PA, Poznik GD, Rootsi S, Järve M, Lin AA, Wang J, Passarelli B, Kanbar J, Myres NM, King RJ, Di Cristofaro J, Sahakyan H, Behar DM, Kushniarevich A, Sarac J, Saric T, Rudan P, Pathak AK, Chaubey G, Grugni V, Semino O, Yepiskoposyan L, Bahmanimehr A, Farjadian S, Balanovsky O, Khusnutdinova EK, Herrera RJ, Chiaroni J, Bustamante CD, Quake SR, Kivisild T, Villems R. The phylogenetic and geographic structure of Y-chromosome haplogroup R1a. // Eur J Hum Genet. 2014 Mar 26. doi: 10.1038/ejhg.2014.50 -- IF 4.319
Gogleva AA, Gelfand MS, Artamonova II. Comparative analysis of CRISPR cassettes from the human gut metagenomic contigs. // BMC Genomics. 2014 Mar 17;15:202. IF - 4.041
Mezentsev A, Nikolaev A, Bruskin S. Matrix metalloproteinases and their role in psoriasis. // Gene. 2014 ;540(1):1-10. doi: 10.1016/j.gene.2014.01.068 -- IF 2.341
Nezametdinova V.Z., Zakharevich N.V., Alekseeva M.G., Mavletova D.A., Averina O.A., Danilenko V.N. Identification and characterization of the eukaryote-like serine/threonine protein kinases in Bifidobacterium. Archives of Microbiology. 2014, V. 196, Issue 2, pp 125-136. -- IF 1.905
Thompson PM, Stein JL, Medland SE, Hibar DP, Vasquez AA, Renteria ME, Toro R, Jahanshad N, Schumann G, Franke B,Wright MJ, Martin NG, Agartz I, Alda M, Alhusaini S, Almasy L, Almeida J, Alpert K, Andreasen NC, Andreassen OA, Apostolova LG, Appel K, Armstrong NJ, Aribisala B, Bastin ME, Bauer M, Bearden CE, Bergmann O, Binder EB, Blangero J, Bockholt HJ,Bøen E, Bois C, Boomsma DI, Booth T, Bowman IJ, Bralten J, Brouwer RM, Brunner HG, Brohawn DG, Buckner RL, Buitelaar J,Bulayeva K. et al. (2014). The ENIGMA Consortium: large-scale collaborative analyses of neuroimaging and genetic data. Brain Imaging and Behavior, Online First : 1-30. -- IF 2.667
Sachkova MY, Slavokhotova AA, Grishin EV, Vassilevski AA. Genes and evolution of two-domain toxins from lynx spider venom. FEBS Lett. 2014 Jan 23. pii: S0014-5793(14)00044-1. doi: 10.1016/j.febslet.2014.01.018. -- 3.582
Slavokhotova AA, Rogozhin EA, Musolyamov AK, Andreev YA, Oparin PB, Berkut AA, Vassilevski AA, Egorov TA, Grishin EV, Odintsova TI. Novel antifungal α-hairpinin peptide from Stellaria media seeds: structure, biosynthesis, gene structure and evolution. Plant Mol Biol. 2014 Jan; 84(1-2):189-202. doi: 10.1007/s11103-013-0127-z. -- IF 3.518
Evsyukov A., Ivanov D. Seection variability for Arg48His in Alcohol Dehydrogenase ADH1B among Asian populations. Human Biology. 2013. Vol. 85. Issue 4. P. 569-578. -- IF 1.522
Der Sarkissian C, Brotherton P, Balanovsky O, Templeton JE, Llamas B, Soubrier J, Moiseyev V, Khartanovich V, Cooper A, Haak W; Genographic Consortium. Mitochondrial genome sequencing in Mesolithic North East Europe Unearths a new sub-clade within the broadly distributed human haplogroup C1. // PLoS One. 2014 Feb 4;9(2):e87612. -- IF 3.730
Clarke AC, Prost S, Stanton JA, White WT, Kaplan ME, Matisoo-Smith EA; Genographic Consortium (Balanovsky OP). From cheek swabs to consensus sequences: an A to Z protocol for high-throughput DNA sequencing of complete human mitochondrial genomes. // BMC Genomics. 2014 Jan 25;15:68 -- IF 4.40

2013

развернуть

Raghavan M., Skoglund P., Graf K., Metspalu M., Albrechtsen A., Moltke I., Rasmussen S., Stafford_Jr T., Orlando L., Metspalu E., Karmin M., Tambets K., Rootsi S., Mägi R., Campos P., Balanovska E., Balanovsky O., Khusnutdinova E., Litvinov S., Osipova L., Fedorova S., Voevoda M., DeGiorgio M., Sicheritz-Ponten T., Brunak S., Demeshchenko S., Kivisild T., Villems R., Nielsen R., Jakobsson M., Willerslev E.	Upper Palaeolithic Siberian genome reveals dual ancestry of Native Americans.	Nature 2014 Jan 2;505(7481):87-91. doi: 10.1038/nature12736. Epub 2013 Nov 20	Imact Factor 38.597
Brandt G., Haak W., Adler C.J., Roth C., Szécsényi-Nagy A., Karimnia S., Möller-Rieker S., Meller H., Ganslmeier R., Friederich S., Dresely V., Nicklisch N., Pickrell J.K., Sirocko F., Reich D., Cooper A., Alt K.W., The Genographic Consortium (...Balanovsky O. )	Ancient DNA reveals key stages in the formation of central European mitochondrial genetic diversity. The oldest known genome of a modern human solves long-standing puzzles about the New World's genetic heritage. Подробности здесь	Science. 2013. Oct 11. 342(6155). P. 257-261	31.027
Davydov II, Wohlgemuth I, Artamonova II, Urlaub H, Tonevitsky AG, Rodnina MV.	Evolution of the protein stoichiometry in the L12 stalk of bacterial and organellar ribosomes.	Nat Commun. 2013; 4:1387. doi: 10.1038/ncomms2373.	10.015
Brotherton P, Haak W, Templeton J, Brandt G, Soubrier J, Jane Adler C, Richards SM, Sarkissian CD, Ganslmeier R, Friederich S, Dresely V, van Oven M, Kenyon R, Van der Hoek MB, Korlach J, Luong K, Ho SY, Quintana-Murci L, Behar DM, Meller H, Alt KW, Cooper A; Genographic Consortium, Balanovska E, Balanovsky O. et al.,	Neolithic mitochondrial haplogroup H genomes and the genetic origins of Europeans.	Nat Commun. 2013; 4:1764.	10.015
Costa MD, Pereira JB, Pala M, Fernandes V, Olivieri A, Achilli A, Perego UA, Rychkov S, Naumova O, Hatina J, Woodward SR, Eng KK, Macaulay V, Carr M, Soares P, Pereira L, Richards MB.	A substantial prehistoric European ancestry amongst Ashkenazi maternal lineages.	Nat Commun. 2013 Oct 8;4:2543	10.015
Houston I, Peter CJ, Mitchell A, Straubhaar J, Rogaev E, Akbarian S.	Epigenetics in the human brain.	Neuropsychopharmacology. 2013 Jan; 38(1):183-9	8.678
Der Sarkissian C, Balanovsky et al., Genographic Consortium.	Ancient DNA reveals prehistoric gene-flow from siberia in the complex human population history of North East Europe.	PLoS Genet. 2013; 9(2):e1003296.	8.517 .
Kulakovskiy IV, Medvedeva YA, Schaefer U, Kasianov AS, Vorontsov IE, Bajic VB, Makeev VJ.	HOCOMOCO: a comprehensive collection of human transcription factor binding sites models.	Nucleic Acids Res. 2013 Jan; 41(Database issue):D195-202.	8.278
Leon DA, Shkolnikov VM, Borinskaya S, Casas JP, Evans A, Gil A, Kee F, Kiryanov N, McKee M, O'Doherty MG, Ploubidis GB, Polikina O, Vassiliev M, Blankenberg S, Watkins H.	Hazardous alcohol consumption is associated with increased levels of B-type natriuretic peptide: evidence from two population-based studies.	Eur J Epidemiol. 2013 May; 28(5):393-404.	5.118
Makeev VJ.	Predictive biology using systems and integrative analysis and methods.	J Biomol Struct Dyn. 2013; 31(1):1-3.	4.986
Permina EA, Medvedeva YA, Baeck PM, Hegde SR, Mande SC, Makeev VJ.	Identification of self-consistent modulons from bacterial microarray expression data with the help of structured regulon gene sets.	J Biomol Struct Dyn. 2013; 31(1):115-24.	4.986
Naumova OY, Lee M, Rychkov SY, Vlasova NV, Grigorenko EL.	Gene expression in the human brain: the current state of the study of specificity and spatiotemporal dynamics.	Child Dev. 2013 Jan-Feb; 84(1):76-88. Review.	4.915
Elhaik E, Greenspan E, Staats S, Krahn T, Tyler-Smith C, Xue Y, Tofanelli S, Francalacci P, Cucca F, Pagani L, Jin L, Li H, Schurr TG, Greenspan B, Spencer Wells R; Genographic Consortium (Balanovsky O)	The GenoChip: a new tool for genetic anthropology.	Genome Biol Evol. 2013; 5(5):1021-31.	4.759
McDonald H, Borinskaya S, Kiryanov N, Gil A, Helander A, Leon DA.	Comparative performance of biomarkers of alcohol consumption in a population sample of working-aged men in Russia: the Izhevsk Family Study.	Addiction. 2013 Sep; 108(9):1579-89.	4.746
Rębała K, Martínez-Cruz B, Tönjes A, Kovacs P, Stumvoll M, Lindner I, Büttner A, Wichmann HE, Siváková D, Soták M, Quintana-Murci L, Szczerkowska Z, Comas D; Genographic Consortium (Balanovsky O)	Contemporary paternal genetic landscape of Polish and German populations: from early medieval Slavic expansion to post-World War II resettlements.	Eur J Hum Genet. 2013;21(4):415-22	4.319
Utkina LL, Andreev YA, Rogozhin EA, Korostyleva TV, Slavokhotova AA, Oparin PB, Vassilevski AA, Grishin EV, Egorov TA, Odintsova TI.	Genes encoding 4-Cys antimicrobial peptides in wheat Triticum kiharae Dorof. et Migush.: multimodular structural organization, instraspecific variability, distribution and role in defence.	FEBS J. 2013 Aug; 280(15):3594-608.	4.25
Bykova NA, Favorov AV, Mironov AA.	Hidden Markov models for evolution and comparative genomics analysis.	PLoS One. 2013 Jun 7; 8(6):e65012.	3.730
Fantin YS, Neverov AD, Favorov AV, Alvarez-Figueroa MV, Braslavskaya SI, Gordukova MA, Karandashova IV, Kuleshov KV, Myznikova AI, Polishchuk MS, Reshetov DA, Voiciehovskaya YA, Mironov AA, Chulanov VP.	Base-calling algorithm with vocabulary (BCV) method for analyzing population sequencing chromatograms.	PLoS One. 2013; 8(1):e54835.	3.730
Boattini A, Martinez-Cruz B, Sarno S, Harmant C, Useli A, Sanz P, Yang-Yao D, Manry J, Ciani G, Luiselli D, Quintana-Murci L, Comas D, Pettener D; Genographic Consortium. (Balanovsky O)	Uniparental markers in Italy reveal a sex-biased genetic structure and different historical strata.	PLoS One. 2013 May 29; 8(5):e65441.	3.730
Badro DA, Douaihy B, Haber M, Youhanna SC, Salloum A, Ghassibe-Sabbagh M, Johnsrud B, Khazen G, Matisoo-Smith E, Soria-Hernanz DF, Wells RS, Tyler-Smith C, Platt DE, Zalloua PA; Genographic Consortium. (Balanovsky O)	Y-chromosome and mtDNA genetics reveal significant contrasts in affinities of modern Middle Eastern populations with European and African populations.	PLoS One. 2013; 8(1):e54616.	3.730
Bogomazova AN, Lagarkova MA, Panova AV, Nekrasov ED, Kiselev SL.	Reactivation of Х chromosome upon reprogramming leads to changes in the replication pattern and 5hmC accumulation.	Chromosoma. 2013 Aug 28.	3.340
Dumas E, Atyame CM, Milesi P, Fonseca DM, Shaikevich EV, Unal S, Makoundou P, Weill M, Duron O.	Population structure of Wolbachia and cytoplasmic introgression in a complex of mosquito species.	BMC Evol Biol. 2013 Sep 3;13:181	3.29
Gordienko EN, Kazanov MD, Gelfand MS.	Evolution of Pan-Genomes of Escherichia coli, Shigella spp., and Salmonella enterica.	J Bacteriol. 2013 Jun;195(12):2786-92	3.194
Lysenkova LN, Turchin KF, Korolev AM, Dezhenkova LG, Bekker OB, Shtil AA, Danilenko VN, Preobrazhenskaya MN.	Synthesis and cytotoxicity of oligomycin A derivatives modified in the side chain.	Bioorg Med Chem. 2013 Jun 1;21(11):2918-24.	2.903
Butovskaya PR, Butovskaya ML, Vasilyev VA, Lazebny OE, Shibalev DV, Veselovskaya EV, Udina IG, Ryskov A.P	Мolecular-Genetic Polymorphisms of Dopamine, Serotonin and Androgenic Systems as Molecular Markers of Success in Judo Wrestling Sportsmen.	J Bioanal Biomed (2013) .S3: 005. doi:10.4172/1948-593X.S3-005.	2.880
Astafieva AA, Rogozhin EA, Andreev YA, Odintsova TI, Kozlov SA, Grishin EV, Egorov TA.	A novel cysteine-rich antifungal peptide ToAMP4 from Taraxacum officinale Wigg. flowers.	Plant Physiol Biochem. 2013 Sep; 70:93-9	2.775
Minashkin MM, Salnikova LE, Lomonosov KM, Korobko IV, Tatarenko AO	Possible contribution of GSTP1 and other xenobiotic metabolizing genes to vitiligo susceptibility.	Arch Dermatol Res. 2013 Apr;305(3):233-9	2.708
Thompson TM, Sharfi D, Lee M, Yrigollen CM, Naumova OY, Grigorenko EL.	Comparison of whole-genome DNA methylation patterns in whole blood, saliva, and lymphoblastoid cell lines.	Behav Genet. 2013 Mar;43(2):168-76	2.606
Salnikova LE, Belopolskaya OB, Zelinskaya NI, Rubanovich AV.	The potential effect of gender in CYP1A1 and GSTM1 genotype-specific associations with pediatric brain tumor.	Tumour Biol. 2013 Oct 34(5):2709-19	2.518
Salnikova LE, Smelaya TV, Golubev AM, Rubanovich AV, Moroz VV.	CYP1A1, GCLC, AGT, AGTR1 gene-gene interactions in community-acquired pneumonia pulmonary complications.	Mol Biol Rep. 2013 Sep 26.	2.506
Salnikova LE, Smelaya TV, Moroz VV, Golubev AM, Rubanovich AV.	Functional polymorphisms in the CYP1A1, ACE, and IL-6 genes contribute to susceptibility to community-acquired and nosocomial pneumonia.	Int J Infect Dis. 2013 Jun; 17(6):e433-42.	2.498
Bourmenskaya O, Shubina E, Trofimov D, Rebrikov D, Sabdulaeva E, Nepsha O, Bozhenko V, Rogovskaya S, Sukhikh G.	Host gene expression profiling of cervical smear is eligible for cancer risk evaluation.	J Clin Pathol. 2013 Apr; 66(4):282-5	2.439
Chhatre, V., Byram, T. Neale D.B., Wegrzyn J.L., Krutovsky K.V.	Genetic structure and association mapping of adaptive and selective traits in the East Texas loblolly pine (Pinus taeda L.) breeding populations.	Tree Genetics and Genomes 2013 9(5): 1161-1178	2.397
Salnikova LE, Smelaya TV, Moroz VV, Golubev AM, Rubanovich AV.	Host genetic risk factors for community-acquired pneumonia.	Gene. 2013 Apr 15; 518(2):449-56.	2.196
Klimina KM, Kjasova DK, Poluektova EU, Krügel H, Leuschner Y, Saluz HP, Danilenko VN.	Identification and characterization of toxin-antitoxin systems in strains of Lactobacillus rhamnosus isolated from humans.	Anaerobe. 2013 Aug;22:82-9	2.022
Kulakovskiy IV, Makeev VJ.	DNA Sequence Motif: A Jack of All Trades for ChIP-Seq Data.	Adv Protein Chem Struct Biol. 2013; 91:135-71.	1.83
Tayeh A, Estoup A, Hufbauer RA, Ravigne V, Goryacheva I, Zakharov IA, Lombaert E, Facon B.	Investigating the genetic load of an emblematic invasive species: the case of the invasive harlequin ladybird Harmonia axyridis.	Ecol Evol. 2013 Apr; 3(4):864-71.	1.184
Vorontsov IE, Kulakovskiy IV, Makeev VJ.	Jaccard index based similarity measure to compare transcription factor binding site models.	Algorithms Mol Biol. 2013 Sep 30;8(1):23.	1.61
Fertig E, Favorov A, Ochs M.	Identifying Context-Specific Transcription Factor Targets from Prior Knowledge and Gene Expression Data.	IEEE Trans Nanobioscience. 2013 May 16.	1.286
Krutovsky, K.V., Tretyakova I.N., Oreshkova N.V., Pak M.E., Kvitko O.V., and Vaganov E.A.	Somaclonal variation of haploid in vitro tissue culture obtained from Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) megagametophytes for whole genome de novo sequencing.	In Vitro Cellular and Developmental Biology – Plant 2014 (in press)	1.139
Koralewski, T.E., Brooks, J.E. and Krutovsky K.V.	Molecular evolution of drought tolerance and wood strength related candidate genes in loblolly pine (Pinus taeda L.)	Silvae Genetica 2013 (in press)	0.44
Kulakovskiy I, Levitsky V, Oshchepkov D, Bryzgalov L, Vorontsov I, Makeev V.	From binding motifs in ChIP-Seq data to improved models of transcription factor binding sites.	J Bioinform Comput Biol. 2013 Feb; 11(1):1340004.	The first impact factor will be available in 2013
Mukha DV, Pasyukova EG, Kapelinskaya TV, Kagramanova AS.	Endonuclease domain of the Drosophila melanogaster R2 non-LTR retrotransposon and related retroelements: a new model for transposition.	Front Genet. 2013 Apr 26; 4:63.	The first impact factor will be available in 2013
Lukiw WJ, Andreeva TV, Grigorenko AP, Rogaev EI.	Studying micro RNA Function and Dysfunction in Alzheimer's Disease.	Front Genet. 2013 Feb 6; 3:327.	The first impact factor will be available in 2013

2012

развернуть

Монографии, главы в монографиях, учебные пособия.

Вавилов Н.И.. Этюды по истории генетики. (Отв. ред. И.А.Захаров-Гезехус). М. Новый Хронограф. 2012. 160 с.
Авруцкая Т.Б. Вавиловы. Семейный альбом. ООО «Акварель»
История Института общей генетики РАН глазами его сотрудников. Ижевск: НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», Институт компьютерных технологий. 2012.
Богданов Ю.Ф. Очерки о биологах второй половины ХХ века. М. 2012. КМК. 508 с.
Жученко А.А. Мобилизация генетических ресурсов цветковых растений на основе их идентификации и систематизации. М., «Типография» Россельхоз-академии, 2012.
Засухина Г.Д. Как придумываются слова. Встречи с С.М.Михалковым. В кн.: VIII Петряновские чтения. 2012, М.. С.31-36.
Зиничев В.В., В.Н. Леман, Л.А. Животовский, Г.А. Ставенко. Теория и практика сохранения биоразнообразия при разведении тихоокеанских лососей. М., Изд-во ВНИРО2012., 240 с.
Инге-Вечтомов С.Г., Галкин А.П., Сопова Ю.В., Рубель А.А. Прионы, "белковая наследственность" и эпигенетика. В кн: ред. Закиян С.М., Власов В.В., Дементьева Е.В. Эпигенетика. Новосибирск: Изд-во СО РАН. 2012. с. 481-496.
История Института общей генетики РАН глазами его сотрудников. М., Ижевск, 2012.
Salnikova L.E, Chumachenko A.G., Vesnina I,N., Lapteva N.Sh., Kuznetsova G.I., Abilev S.K., Rubanovich A.V. Analysis of Genotypic Dependence of Chromosome Aberration Frequency in Human Lymphocytes. // Chapter XII in «The Lessons of Chernobyl. 25 Years Later». E.B. Burlakova and V.I. Naydich editors. Nova Science Publishers, Inc, New York, p. 157-165.
Odintsova T.I, Egorov T.A. Plant anti-microbial peptides. In: Plant Signaling Peptides (Signaling and Communication in Plants) by Helen R. Irving and Chris Gehring. Springer; 2012: 107-134.
Абилев С.К., ГлазерВ.М., Асланян М.М. Основы мутагенеза и генотоксикологии. Лекции: учебное пособие. Москва-Санкт-Петербург. Изд-во «Нестор-история». 2012.

Статьи в отечественных журналах

Аверина О.В., Незаметдинова В.З., Алексеева М.Г., Даниленко В.Н. Генетическая нестабильность пробиотических признаков у штамма Bifidobacterium longum subsp. longum В379М в процессе культивирования и поддержания // Генетика. 2012. 48(11):. 1287-1296.
Андрианов Б.В. Сорокина С.Ю., Лазебный О.Е., Горячева И.И., Горелова Т.В., Каштанов С.Н. Изменчивость митохондриального генома доместицированного соболя (Martes zibellina) // Генетика. 2012. 48(4): 529-541.
Андрианов Б. В., Сорокина С. Ю., Лазебный О. Е., Горячева И. И., Горелова Т. В., Каштанов С. Н. Изменчивость митохондриального генома доместицированного соболя (Martes zibellina) // Генетика. 2012. 48 (4,): 529-541.
Беккер О.Б., Мавлетова Д.А., Любимова И.К., Мирончева Т.А., Штиль А.А., Даниленко В.Н. Индукция программированного лизиса культуры Streptomyces lividans ингибиторами серин-треониновых протеинкиназ эукариотического типа // Микробиология. 2012. .81 (2):177-184.
Богданов Ю.Ф., Спангенберг В.Е., Дадашев С.Я., Витязева И.И., Боголюбов С.В., Коломиец О.Л. Морфологическое проявление в профазе I мейоза человека уникального сегмента ДНК // Цитология. 2012. 54.(8): 603-607.
Боринская С. А., Сафонова А. В. , Петрин А. Н., Арутюнов С. Д., Ребриков Д. В., Хусаинова Р.В., Хуснутдинова Э.К, Ребриков Д.В., Янковский Н. К., Рубанович А. В. Ассоциация генотипа СС по полиморфизму LCT-13910C//T в регуляторном участке гена лактазы с возрастным снижением минеральной плотности кости // Мед генетика 2012, № 10:17-23.
Боринская С.А., Кожекбаева Ж.М., Залесов А.В. , Ользеева Е.В., Максимов А.Р., Куцев С. И., Гараев М.М., Рубанович А.В., Янковский Н.К. Снижение риска инфицирования ВИЧ и летальности у гетерозигот по делеционному аллелю гена хемокинового рецептора CCR5delta32: исследование случая фокусной нозокомиальной ВИЧ-инфекции и мета-анализ // Aсta Naturae. 2012. 4 (1,12): 36-46.
Егоров Ц.А, Одинцова Т.И «Защитные пептиды иммунитета растений». // Bioorg. Khim. 2012, 38 (1): 7-17.
Елизаров С.М., Алексеева M.Г., Новиков Ф.Н., Чилов Г.Г., Маслов Д.А., Штиль А.А., Даниленко В.Н. Идентификация сайтов фосфорилирования аминогликозидфосфотрансферазы VIII Streptomyces rimosus// Биохимия. 2012. т.77, вып.11, с.1504-1512
Засухина Г.Д., , Курбатова Л.А., Шагирова Ж.М. Михайлов В.Ф., Максимова Т.Н. Роль генетического полиморфизма в патологии внутренних органов у детей с синдромом Дауна. // Росс. Вестн.перинат. и педиатр.2012 .57 (3): 71-73.
Засухина Г.Д., Одинцова Т.И., Шуленина Л.В., Ушенкова Л.Н., Михайлов В.Ф., Шагирова Ж.М., ВедерниковА.Н., Громов С.П., Алфимов М.В. Антимутагены (b-пуротионин и краун-соединение) как модулятлры экспрессии генов, участвующих в процессах онкогенеза, в клетках человека. // Докл.РАН. 446 (5):.580-582.
Игонина Е. В., Федотов И. С., Короткевич А. Ю., Рубанович А. В. Морфологические аномалии у потомков облученных сосен (Pinus sylvestris L.) из чернобыльских популяций // Радиационная биология. Радиоэкология. 2012. 52 (1): 90-102.
Козлов А.И., Вершубская Г.Г., Санина Е.Д., Боринская С.А., Атеева Ю.А. Липидный профиль крови и состав тела юношей и девушек европейского севера РФ, различающихся по генотипу APOE //Вестн. археол., антропол. и этногр., 2012, 3 (18): 102-109.
Лазебная И.В., Лазебный О.Е., Максименко В.Ф., Сулимова Г.Е. Полиморфизм генов гормона роста и пролактина в связи с признаками качества молока у крупного рогатого скота ярославской породы // Сельскохозяйственная биология. 2012. №2. С. 39-44.
Моисеева И.Г., Романов М.Н., Авруцкая Т.Б., Никифоров А.А. Исследования по генетике кур. К 120-летию со дня рождения выдающегося советского генетика А..С. Серебровского (1892-1948) // Генетика. 2012. Том 48. № 9. С. 1021-1038.
Мороз В.В., Смелая Т.В., Голубев А.М., Сальникова Л.Е. Генетика и медицина критических состояний: от теории к практике. // Общая реаниматология. 2012. 8 ( 4): 5-12.
Nizhnikov A.A., Magomedova Z.M., Saifitdinova A.F., Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. Identification of Genes Encoding Potentially Amyloidogenic Proteins that Take Part in the Regulation of Nonsense Suppression in Yeast Saccharomyces cerevisiae // Экологическая генетика 2011 (Russian Journal of Genetics: Applied Research, 2012, V.2 P.399-405).
Нюхалов А.П., Свищева Г.Р., Чернова И.Е., Лазебный О.Е., Каштанов С.Н. Отбор на затемнение окраски соболей и связь с результатами воспроизводства. // Кролиководство и звероводство. №6. С.4-9.
Одинцова Т. И, Коростылева Т.В, Уткина Л.Л, Андреев Я.А, Славохотова А.А, Истомина Е.А, Пухальский В.А, Егоров Ц.А. Антимикробные пептиды пшеницы. // Вавиловский журнал генетики и селекции 2012, 16 (1): 585-594.
Перчун А.В., Лазебная И.В., Белокуров С.Г., Рузина М.Н., Сулимова Г.Е. Полиморфизм генов CSN3, bPRL и bGH у коров костромской породы в связи с показателями молочной продуктивности // Фундаментальные исследования. 2012. № 11 (часть 2). С. 304-308.
Поморцев А.А., Мартынов С.П., Лялина Е.В.. Полиморфизм по гордеин-кодирующим локусам популяций ячменя (Hordeum vulgare L.) стран Восточной Азии (Китай, Непал, Пакистан, Индия) // Генетика. 2012. т.48, №8, с. 934-950.
Прозоров А.А., Зайчикова М.В., Даниленко В.Н. Мутанты Mycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью: история появления, генетические и молекулярные механизмы устойчивости, возникающие проблемы // Генетика. 2012. Т.48. N1. С. 5-20.
Романов М.Н., Авруцкая Т.Б., Моисеева И.Г. Жизнь, отданная науке. К 120-летию со дня рождения выдающегося советского генетика А.С. Серебровского // Природа. 2012. № 2. С. 63-70.
Рубель А.А., Коржова В.В., Сайфитдинова А.Ф., Антонец К.С., Инге-Вечтомов С.Г., Галкин А.П. Белок PrP и пептид амилоид бета взаимодействуют в дрожжах Saccharomyces cerevisiae // Экологическая генетика. 2012. Т. 10. №1 С. 74-80.
Рузина М. Н., Андрианов Б. В., Шайхаев Г. О., Сулимова Г. Е. Идентификация и классификация изолятов вируса лейкоза крупного рогатого скота России и Украины на основе анализа изменчивости вирусного гена pol // Генетика. 2012. 48 (7):855-62.
Селезнева Н. Д., Рощина И. Ф., Гаврилова С. И., Федорова Я. Б. , Гантман М. В., Коровайцева Г. И., Кунижева С. С., Рогаев Е. И. Психические нарушения когнитивного и некогнитивного спектра у родственников первой степени родства пациентов с болезнью Альцгеймера..//Ж.Неврол. Психиатр. Им. С.С.Корсакова. 2012. 112 (10):8-13.
Семенова А.В., А.П. Андреева, А.Н. Строганов, Г.А.Рубцова, К.И.Афанасьев, Г.Н. Маркевич, А.А. Смирнов. Предварительные данные по изменчивости четырех микросателлитных локусов у тихоокеанских сельдей Clupea pallasii. // Генетика 2012. 48: 97-103.
Упелниек В.П., Белов В.И., Иванова Л.П., Долгова С.П., Демидов А.С. Наследие академика Н.В.Цицина- современное состояние и перспективы использования коллекции промежуточных пшенично-пырейных гибридов. //Вавиловский журнал генетики и селекции. 2012.16.(3): 667 – 674.
Хадеева Н.В, Яковлева Е.Ю., Дунаевский. Я.Е.,. Белозерский М.А.Сравнительный анализ инсерционных мутантов табака и арабидопсиса, трансформированных одинаковыми векторными конструкциями // Генетика. 2012. т. 48. № 2. с.194 - 203.
Шайкевич Е.В., Ившина Е.В., Захаров И.А. Полиморфизм митохондриальной днк и распространение цитоплазматических симбионтов в популяциях двуточечной божьей коровки Adalia bipunctata // Генетика. 2012 Т. 48. № 5. С. 666-671.
Шитова М.В., А.А. Юрченко, Е.Г.Шайхаев, Л.А.Животовский. Панель микросателлитных локусов для популяционных исследований сахалинского тайменя Parahucho perryi (Brevoort). Генетика 2012. 48: 976-982.

Статьи в зарубежных журналах

Abilev S., Malyarchuk B., Derenko M., Wozniak M., Grzybowski T., Zakharov I. The Y-chromosome C3* star-cluster attributed to Genghis Khan's descendants is present at high frequency in the Kerey clan from Kazakhstan // Hum Biol. 2012;84(1):79-89
Andreev Y.A, Korostyleva T.V, Slavokhotova A.A, Rogozhin E.A, Utkina L.L, Vassilevski A.A, Grishin E.V, Egorov T.A, Odintsova T.I Genes encoding hevein-like defense peptides in wheat: Distribution, evolution, and role in stress response. // Biochimie, 2012, 94, 1009-1016.
Astafieva A.A., Rogozhin E.A., Odintsova T.I., Khadeeva N.V., Grishin E.V., Egorov Ts.A. Discovery of novel antimicrobial peptides with unusual cysteine motifs in dandelion Taraxacum officinale Wigg. flowers // Peptides, 2012, 36 (2): 266-271.
Averina O.V., Zakharevich N.V., Danilenko V.N. Identification and Characterization of WhiB-Like Family Proteins of the Bifidobacterium Genus // Anaerobe. 2012. V.18. Р.421-429
Averina O.V., Zakharevich N.V., Danilenko V.N. Identification and characterization of WhiB-like family proteins of the Bifidobacterium genus. // Anaerobe. 2012 Aug;18(4):421-9.
BakloushinskayaI.Yu., Matveevsky S.N., Romanenko S.A., Serdukova N.A., KolomietsO.L., Spangenberg V.E., Lyapunova E.A., Graphodatsky A.S. A comparative analysis of the mole vole sibling species Ellobius tancrei and E. talpinus (Cricetidae, Rodentia) through chromosome painting and examination of synaptonemal complex structures in hybrids // Cytogenet Genome Res. 2012. V.136. P. 199-207.
Bogdanov Yu. F., Spangenberg V. E., Dadashev S. Ya., Vityazeva I. I. Bogoliubov S. V. Kolomiets O. L. Morphological Manifestation of Unique DNA Segments in Human Meiotic Prophase I // Cell and Tissue Biology, 2012, Vol. 6, No 5-6. P. 407–411.
Bower M.A., McGivney B.A., Campana M.G., Gu J., Andersson L.S., Barrett E., Davis C.R., Mikko S., Stock F., Voronkova V., Bradley D.G., Fahey A.G., Lindgren G., Machugh D.E., Sulimova G., Hill E.W. The genetic origin and history of speed in the Thoroughbred racehorse // Nature Communications. 2012. №3. P. 643-647.
Chubykin V.L. The Nature of Mildly Deleterious Mutations Eliminated upon Sexual Reproduction in Meiosis // Advances in Life Sciences. 2012. V.2. No 6. P.
Derenko M., Malyarchuk B., Denisova G., Perkova M., Rogalla U., Grzybowski T., Khusnutdinova E., Dambueva I., Zakharov I.Complete mitochondrial DNA analysis of eastern Eurasian haplogroups rarely found in populations of northern Asia and eastern Europe // PLoS One. 2012. 7(2): e32179
Donnelly M.P., Paschou P., Grigorenko E., Gurwitz D., Barta C., Lu R.B., Zhukova O.V., Kim J.J., Siniscalco M., New M., Li H., Kajuna SL., Manolopoulos VG., Speed WC., Pakstis AJ., Kidd JR., Kidd KK. A global view of the OCA2-HERC2 region and pigmentation.// Hum Genet. 2012. 131(5):683-96.
DulikM.C., Owings A.C., Gaieski J.B., Vilar M.G., Andre A., Lennie C., Mackenzie M.A., Kritsch I., Snowshoe S., Wright R., Martin J., Gibson N., Andrews T.D., Schurr T.G., Genographic Consortium (Balanovsky O.). Y-chromosome analysis reveals genetic divergence and new founding native lineages in Athapaskan- and Eskimoan-speaking populations.// Proc Natl Acad Sci U S A. 2012; 109(22):8471-6.
Favorov A., Mularoni L., Cope L.M., Medvedeva Y., Mironov A.A., Makeev V.J., Wheelan J.Exploring massive, genome scale datasets with the GenometriCorr package.// PLoS Comput Biol. 2012; 8(5):e1002529.
Gordeeva N.V., Karmanova O.G., Shitova M.V. 2012. Biological and genetic diversity in peled (Coregonus peled) populations, introduced beyond south edge of the range, into Tuvinian lakes. // Advances in Limnology 63: 187–196.
Grishaeva T.M.,. Zakharov I.A. Comparison of eukaryotic nuclear proteins with prokaryotic proteins: implications for eukaryogenesis // Current Topics in Genetics. 2012. 5:. 31 – 36
Lapa G.B., Bekker O.B., Mirchink E.P., Danilenko V.N., Preobrazhenskaya M.N. Regioselective acylation of congeners of 3-amino-1Hpyrazolo[3,4-b]quinolines, their activity on bacterial serine//threonine protein kinases and in vitro antibacterial (including antimycobacterial) activity // Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. 2012; 1-6
Lukiw W.J., Andreeva T.V., Grigorenko A.P., Rogaev E.I.Studying micro RNA Function and Dysfunction in Alzheimer's Disease. // Front Genet. 2012;3:327.
Lysenkova L., Turchin K., Korolev A., Bykov E., Danilenko V., Bekker O., Trenin A., Elizarov S., Dezhenkova L., Shtil A., Preobrazhenskaya M., A novel acyclic oligomycin А derivative formed via retro-aldol rearrangement of oligomycin A // Journal of Antibiotics. 2012. V.65. P.405–411
Lysenkova L., Turchin K., Korolev A., Danilenko V., Bekker O.B., Trenin A.S., ShtilA.A., Preobrazhenskaya M. Synthesis and properties of a novel brominated oligomycin A derivative // Journal of Antibiotics. 2012. P.1-3
Matveevsky S.N., Pavlova S.V., Acaeva M.M., Kolomiets O.L. Synaptonemal complex analysis of interracial hybrids between the Moscow and Neroosa chromosomal races of the common shrew Sorex araneus showing regular formation of a complex meiotic configuration (ring-of-four) // Comparative Cytogenetics. 2012. V. 6. P. 301–314.
Melnikova NV, Kudryavtseva AV, Kudryavtsev AM. Catalogue of alleles of gliadin-coding loci in durum wheat (Triticum durum Desf.). // Biochimie. 2012 Feb;94(2):551-7.
Morozova I., Evsyukov A., Kon'kov A., Grosheva A., Zhukova O., Rychkov S.Russian ethnic history inferred from mitochondrial DNA diversity. // Am J Phys Anthropol. 2012. 147(3):341-51.
Mosafer J., Heydarpour M., Manshad E., Russell G., Sulimova G.E. Distribution of BoLA-DRB3 allelic frequencies and identification of two new alleles in Iranian buffalo breed // Scientific World Journal. 2012:863024
Mughal S.K, Myazin A.E, Zhavoronkov L.P., Rubanovich A.V, Dubrova Y.E The dose and dose-rate effects of paternal irradiation on transgenerational instability in mice: a radiotherapy connection..//PLoS One. 2012;7(7):e41300.
Naumova O.Y., Palejev D., Vlasova N.V., Lee M., Rychkov S.Y., Babich O.N., M Vaccarino F., Grigorenko E.L. Age-related changes of gene expression in the neocortex: preliminary data on RNA-Seq of the transcriptome in three functionally distinct cortical areas. // Dev Psychopathol. 2012. 24(4):1427-42.
Nizhnikov A.A., MagomedovaZ.M., RubelA.A., KondrashkinaA.M., Inge-VechtomovS.G., Galkin A.P. [NSI⁺] determinant has a pleiotropic phenotypic manifestation that is modulated by SUP35, SUP45, and VTS1 genes // Current Genetics, 2012, V.58 P.35-47.
Pala M., Olivieri A., Achilli A., Accetturo M., Metspalu E., Reidla M., Tamm E., Karmin M., Reisberg T., Hooshiar Kashani B., Perego UA., Carossa V., Gandini F., Pereira JB., Soares P., Angerhofer N., Rychkov S., Al-Zahery N., Carelli V., Sanati M.H., Houshmand M., Hatina J., Macaulay V., Pereira L., Woodward S.R., Davies W., Gamble C., Baird D., Semino O., Villems R., Torroni A., Richards M.B. Mitochondrial DNA signals of late glacial recolonization of Europe from near eastern refugia.Am J Hum Genet. 2012 . 90(5):915-24.
Ponomareva N.V., Goltsov A.Y., Kunijeva S.S., Scheglova N.S., Malina D.D., Mitrofanov A.A., Boikova T.I., Rogaev E.I. Age- and genotype-related neurophysiologic reactivity to oxidative stress in healthy adults.// Neurobiol Aging. 2012; 33(4):839.e11-21.
Rand P.S., Berejikian B.A., Bidlack A., Bottom D., Gardner J., Kaeriyama M., Lincoln R., Nagata M., Pearsons T.N.,. Schmidt M, Smoker W.W., Weitkamp L.A., Zhivotovsky L.A.. Ecological interactions between wild and hatchery salmonids and key recommendations for research and management actions in selected regions of the North Pacific.// Env. Biol. Fish. (Springer Netherl.) 2012. 94: 343-358.
Rogaev E.I. Genomics of behavioral diseases.// Front Genet. 2012.3:45.
Rootsi S., Myres N.M., Lin A.A., Järve M., King R.J., Kutuev I., Cabrera V.M., Khusnutdinova E.K., Varendi K., Sahakyan H., Behar D.M., Khusainova R., Balanovsky O., Balanovska E., Rudan P., Yepiskoposyan L., Bahmanimehr A., Farjadian S., Kushniarevich A., Herrera R.J., Grugni V., Battaglia V., Nici C., Crobu F., Karachanak S., Kashani B.H., Houshmand M., Sanati M.H., Toncheva D., Lisa A., Semino O., Chiaroni J., Cristofaro JD., Villems R., Kivisild T., Underhill PA. Distinguishing the co-ancestries of haplogroup G Y-chromosomes in the populations of Europe and the Caucasus. // Eur J Hum Genet. 2012; 20(12):1275-82.
Salnikova L., Chumachenko A., Belopolskaya O., Rubanovich A. Correlations between DNA polymorphism and frequencies of gamma-radiation induced and spontaneous cytogenetic damage // Health Phys. 2012. 103(1):37-41.
Schurr T.G., Dulik M.C., Owings A.C., Zhadanov S.I., Gaieski J.B., Vilar M.G., Ramos J., Moss M.B., Natkong F.; Genographic Consortium (Balanovsky O).Clan, language, and migration history has shaped genetic diversity in Haida and Tlingit populations from Southeast Alaska.// Am J Phys Anthropol. 2012. 148(3):422-35.
Sharovskaya YY, Philonenko ES, Kiselev SL, Lagarkova MA. De novo reestablishment of gap junctional intercellular communications during reprogramming to pluripotency and differentiation.// Stem Cells Dev. 2012; 21(14):2623-9
Shulha H.P., Crisci J.L., Reshetov D., Tushir J.S., Cheung I., Bharadwaj R., Chou H.J., Houston I.B., Peter C.J., Mitchell A.C., Yao W.D., Myers R.H., Chen J.F., Preuss T.M., Rogaev E.I., Jensen J.D., Weng Z., Akbarian S. Human-specific histone methylation signatures at transcription start sites in prefrontal neurons.//PLoS Biol. 2012.10(11):e1001427.
Waisertreiger I. S.-R., Liston V. G., Menezes M. R., Kim H.-M., Lobachev K. S., Stepchenkova E. I., Tahirov T. H., Rogozin I. B., Pavlov Y. I. Modulation of mutagenesis in eukaryotes by DNA replication fork dynamics and quality of nucleotide pools // Environmental and Molecular Mutagenesis, 2012. 53(9):. 699-724.
Zakharevich N.V., Osolodkin D.I., Artamonova I.I., Palyulin V.A., Zefirov N.S., Danilenko V.N. Signatures of the ATP binding pocket as a basis for structural classification of the serine//threonine protein kinases of gram-positive bacteria.// Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 2012. 80 (5):1363 – 1376.
Zakharevich N.V., Osolodkin D.I., Artamonova I.I., Palyulin V.A., Zefirov N.S., Danilenko V.N.Signatures of the ATP-binding pocket as a basis for structural classification of the serine//threonine protein kinases of gram-positive bacteria.// Proteins. 2012. 80(5):1363-76.
Zhivotovsky L.A., Fedorova L.K., Rubtsova G.A., Shitova M.V., Rakitskaya T.A., Prokhorovskaya V.D., Smirnov B.P., Kaev A.M., Chupakhin V.M., Samarsky V.G., Pogodin V.P., Borzov S.I., Afanasiev K.I.. Rapid expansion of an enhanced stock of chum salmon and its impacts on wild population components.// Env. Biol. Fish. (Springer Netherl.) 2012. 94: 249-258.

Сборники тезисов и научных трудов конференций

Антонец К.С., Нижников А.А. Композиционные детерминанты межмолекулярных взаимодействий инфекционных амилоидов Saccharomyces cerevisiae // Труды конференции. Биосистема: от теории к практике, сборник тезисов, 2012, Т.1 С. 31-32.
Антонец К.С., Нижников А.А. Функциональная характеристика потенциально амилоидогенных белков Saccharomyces cerevisiae // "Биоинформатика и моделирование", сборник тезисов, 2012, Т.1 С. 4-5.
Ацаева М.М. Повреждающее действие антибиотиков и бактериофага на структуру синаптонемных комплексов мейотических хромосом мыши. Международная молодежная конференция «Популяционная генетика: современное состояние и перспективы» посвященная 75-летию со дня рождения академика Ю.П. Алтухова. 14-16 ноября 2011. «Цифровичок», М. С. 194.
Ацаева М.М., Дадашев С.Я., Корноухова А.Г., Коломиец О.Л. Особенности селекции сперматоцитов I порядка мыши в ответ на введение антимикробных препаратов // Материалы международной конференции "Хромосома 2012" (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 36-37.
Баклушинская И.Ю., Коломиец О.Л., Романенко С.А., Матвеевский С.Н., Графодатский А.С., Ляпунова Е.А., Джаст В. Загадочная система детерминации пола у слепушонок Ellobius, или возможна ли жизнь без Y-хромосомы // Материалы международной конференции "Хромосома 2012" (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 38-39.
Белопольская О.Б. Вклад генов репарации в предрасположенность к развитию рака мозга у детей // V Всероссийский с международным участием медико-биологический конгресс молодых ученых «Симбиоз-Россия 2012».
Богданов Ю.Ф. Особенности молекулярной и ультраструктурной организации мейотических хромосом // Материалы международной конференции "Хромосома 2012" (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 52-53.
Богданов Ю.Ф., Спангенберг В.Е., Витязева И.И,. Боголюбов С.В, Дадашев С.Я., Коломиец О.Л.. Организация латеральных петель хроматина в мейотической хромосоме человека. Съезд общества клеточных биологов. Тезисы докладов // Цитология. 2012. Т. 54. № 9. С. 000-000
Боринская С.А., Гуреев А.С., Жикривецкая С.О., Орлова А.А., Ким А.А., Янковский Н.К. Гены и среда в формировании популяционно-генетических адаптаций у человека// Конф. «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» Минск, Беларусь, ГНУ Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, 8-11 октября 2012.
Горлов И.О., Косарькова М.В., Андрианов Б.В., Горячева И.И., Арутюнова М.В., Арутюнова К.В., Власов С.В. Исследование личинок 4 видов рода Wilhelmia (Diptera, Simuliidae) из Армении методом геометрической морфометрии // XIV Съезд русского энтомологического общества. Санкт-Петербург, 26 августа – 1 сентября 2012 с. 113.
Гришаева Т.М. К вопросу об эволюции мейоза: как возникли белки синаптонемного комплекса эукариот? // Актуальные проблемы современной науки 2012. Межвузовский сборник научных трудов с материалами 7-ой телеконференции. Томск: ООО «Крокус», 2012. С. 55-57.
Гришаева Т.М. О происхождении белков синаптонемного комплекса: некоторые результаты анализа in silico // Материалы международной конференции «Хромосома 2012» (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 82-83.
Гришаева Т.М. Сравнение in silico соматической и мейотической форм когезинового белка SMC1 позвоночных животных // Сборник трудов Международной научной on-line конференции «Математическое и компьютерное моделирование в биологии и химии. Перспективы развития» (Казань, 28-30 мая 2012 г.). Казань: Казанский университет, 2012. С. 51-53.
Гришаева Т.М.,. Захаров И.А. Структурные белки хромосом эукариот: ближе к белкам архей или бактерий // Сборник научных трудов международной конференции «Популяционная генетика: современное состояние и перспективы», посвященной 75-летию со дня рождения Ю.П. Алтухова (в печати)
Коломиец О.Л., Ацаева М.М., Корноухова А.Г., Спангенберг В.Е. Иммунофлуоресцентный анализ сперматоцитов пациентов с нарушением фертильности // 10-ый Российский научный форум на 10-ой Межд. выставке «Мужское здоровье и долголетие». М.. 2012 15-17 февраля. 2012..ВК «Римиэкспо», М. С. 149.
Коломиец О.Л., Корноухова А. Г. Спангенберг В.Е., Боголюбов С.В., Витязева И.И. Диагностика причин мужского бесплодия на основе анализа синаптонемных комплексов мейотических хромосом // Тез. Первого Национального Форума «Репродуктивное здоровье как фактор демографической стабилизации». Ростов на Дону. 2012.
Кондрашкина А.М., Галкин А.П., Нижников А.А. Нонсенс-супрессия в штаммах дрожжей Saccharomyces cerevisiae, несущих детерминант [NSI+], опосредована снижением количества мРНК гена SUP45. // Биология – наука ХХI века: 16-я Пущинская международная школа-конференция молодых ученых, (Пущино, 16 - 21 апреля 2012 года), сборник тезисов, 2012, Т.1 С. 116.
Косарькова М.В., Андрианов Б.В., Горячева И.И., Арутюнова М.В., Арутюнова К.В., Власов С.В. Цитогенетическая характеристика армянской популяции Boophthora erythrocephalum (De Geer, 1776) (Diptera, Simuliidae) // XIV Съезд русского энтомологического общества. Санкт-Петербург, 26 августа – 1 сентября 2012 с. 213.
Кравцова Т.Р., Лазебная И.В., Пацко ЕВ., Кокшарова О.А. Симбиотическая цианобактерия, повышающая эффективность азотфиксации в ассоциациях с сельскохозяйственными растениями // Тезисы IV Международной конференции «Актуальные проблемы современной альгологии», Киев, 23-25 мая 2012, С. 154-155
Кудрявцев А.М., Драгович А.Ю., Упелниек В.П. Лабораторная диагностика сортовой чистоты и сортового соответствия семян пшеницы//Тезисы докладов Международной научно-практической конференции «Инновационные биотехнологии в странах ЕВРАЗЭС» 11-13 октября 2012 г., СПб: Биоиндустрия, 2012. С. 66-67
Кудрявцев А.М., Новосельская-Драгович А.Ю. Гены запасных белков пшеницы как популяционные и сортовые молекулярно-генетические маркеры.// Тезисы докладов Международной научной конференции «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы ( К 100-летию со дня рождения академика Н.В. Турбина) 8-11 октября 2012, г. Минск, ГНУ «Институт генетики и цитологии НАН Беларуси», 2012. С. 79
Кудрявцев А.М., Новосельская-Драгович А.Ю. Запасные белки пшеницы, как популяционные и сортовые молекулярно-генетические маркеры// В сб. «Современное состояние и перспективы развития генетики и селекции зерновых культур в Казахстане»/ред. Абугалиева С.И., Туруспеков Е.К. – Алматы, 2012. С. 31-34
Лазебная И.В., Лазебный О.Е., Сулимова Г.Е. Изменчивость гена пролактина (bPRL) у пород крупного рогатого скота вида Bos taurus L. на основе Rsa1 полиморфизма в третьем экзоне // Сборник трудов "Динамика научных исследований" /Materialy VIII mledzynarodowej naukowi-praktycznej konferencjl "Dynamika naukowych badan – 2012" 07 - 15 lipca 2012 roku. Przemysl Nauka i studia Adrcs nydawcy i redacji. 37-700 PrzemysI, Dnik i oprawa; Sp. zo.o. "Nauka i studia". - V. 19. - С. 43-47. (ISBN 978-966-8736-05-6).
Лутова Л.А., Андреева Е.А., Метаболизм стеринов и неспецифическая устойчивость к вредителям в популяциях растений)// Тезисы 6-й школы молодых ученых по Экологической генетике,
Лялина Е.В., Болдырев С.В., Поморцев А.А. Идентификация и паспортизация современных сортов ярового ячменя с использованием белковых генетических маркеров // Материалы международной научной конференции « Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» (к 100-летию со дня рождения академика Н.В.Турбина), Минск, 8-11 октября 2012 г., С.85
Лялина Е.В., Болдырев С.В., Поморцев А.А. Проблемы использования генетических маркеров для паспортизации идентификации сортов ячменя.// Материалы III Вавиловской международной научной конференции « Идеи Н.И.Вавилова в современном мире» ( к 125-летию со дня рождения академика Н.И.Вавилова). С.-Петербург, 6-9 ноября 2012 г.
Лялина Е.В., Поморцев А.А. Формирование полиморфизма гордеин-кодирующих локусов у культурного ячменя // Материалы V международной школы молодых ученых по молекулярной генетике «Непостоянство генома» Звенигород, 3 – 7 декабря 2012 г.
Матвеевский С.Н., Баклушинская И.Ю., Ляпунова Е.А., Коломиец О.Л. Cинапсис и мейотическая инактивация хромосом в сперматоцитах межвидовых гибридов слепушонок рода Ellobius // Сборник научных трудов международной конференции «Популяционная генетика: современное состояние и перспективы», посвященной 75-летию со дня рождения Ю.П. Алтухова. (в печати)
Матвеевский С.Н., Коломиец О.Л. Половой диморфизм в профазе I мейоза у видов с разными типами определения пола // «Достижения и проблемы генетики, селекции и биотехнологии: сборник научных трудов УКОГиС им. Н.И.Вавилова». Т.4. К: Логос, 2012. С. 155-159.
Матвеевский С.Н., Коломиец О.Л., Лебедев В.С., Малыгин В.М., Поплавская Н.С., Суров А.В. Исследование синаптонемных комплексов у кариоморф и гибридов группы барабинских хомячков рода Сricetulus // Материалы международной конференции "Хромосома 2012" (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 137-138.
Михайлова Е. И. , Толкачева А. В., Соснихина С. П. Элементы консервативности и специфичности в реализации мейоза у ржи Secale cereale L., выявленные методами молекулярной цитогенетики // Тезисы докладов III Вавиловской международной конференции «Идеи Н.И. Вавилова в современном мире» 6-9 ноября 2012г. Санкт-Петербург. С. 183. Доклад.
Михайлова Е.И. Молекулярно-цитогенетический анализ предпосылок правильного расхождения хромосом в мейозе у ржи Secale cereale L. // Материалы Международной конференция «Хромосома 2012». 2-7 сентября 2009, Новосибирск. Abstracts of the International Conference “Chromosome 2012”. September 2-7, 2012, Novosibirsk, Russia. P. 143-144 (устный доклад).
Моисеева И.Г., Авруцкая Т.Б., Романов М.Н. А.С. Серебровский – основоположник исследований по генетике кур // Материалы Международной конференции. Инновационные разработки и их освоение в промышленном птицеводстве / Под ред. В.И.Фисинина. Сергиев Посад. 2012. С. 85-88.
Нижников А.А., Кондрашкина А.М., Инге-Вечтомов С.Г., Галкин А.П. Прионоподобный детерминант [NSI+] вызывает снижение эффективности терминации трансляции у дрожжей Saccharomyces cerevisiae. // Биология – наука ХХI века: 16-я Пущинская международная школа-конференция молодых ученых, (Пущино, 16 - 21 апреля 2012 года), сборник тезисов, 2012, Т.1 С. 86-87.
Орджоникидзе К.Г., Егорова Е.М. Определение константы диссоциации поношенной группы стабилизатора наночастиц серебра. Конференция «Фармацевтические и биомедицинские нанотехнологии», 20-22 марта 2012.
Павлова C.В., Матвеевский С.Н., Ацаева М.М., Коломиец О.Л., Булатова Н.Ш. Cпособствуют ли хромосомные гибридные зоны видообразованию у обыкновенной бурозубки Sorex araneus: о чем свидетельствуют данные изучения мейоза? // Материалы международной конференции (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 157-158.
Поморцев А.А., Мартынов С.П., Лялина Е.В. Гордеин-кодирующие локусы как генетические маркеры в изучении центров разнообразия культурного ячменя // Материалы III Вавиловской международной научной конференции « Идеи Н.И.Вавилова в современном мире» ( к 125-летию со дня рождения академика Н.И.Вавилова). С.-Петербург, 6-9 ноября 2012 г. Санкт-Петербург, 16-19 октября 2012 г., стр. 21-22. Доклад.
Сизова Т.В. Петельная организация хроматина в профазе I деления мейоза и модель образования геномов теплокровных позвоночных // Материалы Международной конференции «Хромосома 2012» (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 177.
Сизова Т.В., Карпова О.И. Эволюционные преобразования первичной структуры ДНК в процессе становления теплокровных позвоночных // Биология – наука XXI века: 16-ая международная Пущинская школа-конференция молодых ученых (16-21 апреля 2012 г.). Сборник тезисов. Пущино. 2012. С. 145-146.
Симановский С.А. Мейотический мутант sy9 ржи Secale cereale L.: короткие фрагменты синаптонемных комплексов обеспечивают образование единичных хиазм // Ломоносов-2012: XIX Международная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных. Секция «Биология», 9-13 апреля 2012 г., Москва, МГУ имени М.В. Ломоносова, биологический факультет. Тезисы докладов. – М.: МАКС Пресс, 2012. – 304 с.
Смелая Т.В., Мороз В.В., Голубев А.М., Сальникова Л.Е. « Генетика и медицина критических состояний: от теории к практике» Доклад на 14-ой Всероссийской конференции с международным участием «Жизнеобеспечение при критических состояниях», посвященная итогам 75-летней научно-клинической деятельности НИИ общей реаниматологии им. В.А. Неговского РАМН, 17-18 октября 2012 г., Москва
Спангенберг В.Е., Коломиец О.Л., Дадашев С.Я., Богданов Ю.Ф. Динамика упаковки протяженных участков хроматина в ядрах сперматоцитов человека в профазе I мейоза // Материалы Международной конференции «Хромосома 2012» (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ, 2012. С. 181.
Столповский Ю.А., Баранов А.С. Приоритеты развития животноводства: сохранение генетических ресурсов // На пути к устойчивому развитию России. Итоги конференции «РИО+20»: новые возможности. N61. 2012. C. 55-58.
Тихенко Н.Д. Сравнительный анализ систем постзиготической изоляции у растений в свете закона гомологических рядов наследственной изменчивости Н.И. Вавилова // Тезисы докладов III Вавиловской международной конференции «Идеи Н.И. Вавилова в современном мире» 6-9 ноября 2012г. Санкт-Петербург. С. 37. Доклад.
Толкачева А.В., Михайлова Е.И., Соснихина С.П. Нарушения конденсации хроматина ржи Secale cereale L. у мутантов с дефектами синапсиса и рекомбинации // Материалы международной конференция «Хромосома 2012». 2-7 сентября, 2012, Новосибирск. Abstracts of the International Conference “Chromosome 2012”. September 2-7, 2012, Novosibirsk, Russia. P. 189-190 (постерный доклад).
Хромов-Борисов Н.Н., Рубанович А.В. Генетика предрасположенностей – разбитые мечты и утраченные грезы. 3-я Московская Международная Конференция "Иммунофизиология. Аутоиммунитет в норме и патологии и вопросы предиктивно-превентивной медицины". Сколково, 1-3 октября 2012 г.
Хромов-Борисов Н.Н., Рубанович А.В. Основные причины неизбежной неопределенности и низкой прогностичности в генетике предрасположенностей // Международный Конгресс «Молекулярные основы клинической медицины – возможное и реальное» 18 – 20 июня 2012 г. Санкт-Петербург.
Чубыкин В.Л., Коломиец О.Л. Паранемическая спирализация хроматид в мейозе. Спирализация без закручивания // Материалы международной конференции «Хромосома 2012» (Новосибирск, 2-7 сентября 2012 г.). Новосибирск: РИЦ НГУ. 2012. С. 206-207.
Шагирова Ж.М., Ушенкова Л.Н., Шуленина Л.В., Раева Н.Ф., Курбатова Л.А., Михайлов В.Ф., Засухина Г.Д. Особенности экспрессии генов человека, контролирующих стабильность генома, в радиочувствительных клетках человека. В сб. тез. докл: Медико-биологические проблемы действия радиации. М.ФГУ ФМБЦ им. А.И. Бурназяна ФМБА РФ, 2012, 2012, С.23.
Ширяева А.А., Степченкова Е.И., Инге-Вечтомов С.Г. Использование метода «альфа-тест» у дрожжей saccharomyces cerevisiae для изучения роли системы гомологичной рекомбинации в процессе репарации днк, несущей повреждения различной природы // Международная научная конференция «Генетика и биотехнология XXI века: проблемы, достижения, перспективы» (к 100-летию со дня рождения академика Н.В. Турбина) X съезд белорусского общества генетиков и селекционеров, 8-11 октября 2012 г. Минск, Республика Беларусь.
Шуленина Л.В., Ушенкова Л.Н., Ледин Е.В. Раева Н.Ф.,Шагирова Ж.М.,Михайлов В.Ф., Засухина Г.Д. Экспрессия комплекса генов, контролирующих стабильность генома в нормальных тканях онкобольных до и после лучевой терапии. Проблема идентификации больных, восприимчивых к появлению вторичного рака. В кн.: Медико-биологические проблемы действия радиации. М.,2012, С.101.
Antonetc K.S., Rubel A.A., Galkin A.P. Analysis of interaction between PrP aggregates and Abetapeptide in yeast-based system // The 4th EMBO meeting, 2012, Nice, 22-25 September, abstracts, 2012, V.1, P.102.
Kravzova T.R., I.V. Lazebnaya, E.V.Patsko, and O.A. Koksharova New symbiotic cyanobacteria that increased nitrogen fixing activity in agriculturally useful plant-microbial associations: Phylogenetic study // Molecular Phylogtnetics: Contributions to the 3rd Moscow International Conference “Molecular Phylogenetics (Moscow, Russia, July 31-August 4, 2012) / [Compiled by A. Troitsky, L. Rusin, and V.Aleoshin]. — Moscow: TORUS PRESS, 2012. — 172 p.: ill. P.143. (ISBN 978-5-94588-118-1).
Kravzova T.R., I.V. Lazebnaya, T.A. Fedorenko, O.A. Gorelova, E.S. Lobakova, and O.A. Koksharova Phylogenetic of new cyanobacteria associated with the White Sea invertebrates // Molecular Phylogtnetics: Contributions to the 3rd Moscow International Conference “Molecular Phylogenetics (Moscow, Russia, July 31-August 4, 2012) / [Compiled by A. Troitsky, L. Rusin, and V.Aleoshin]. — Moscow: TORUS PRESS, 2012. — 172 p.: ill. P.144 (ISBN 978-5-94588-118-1).
Moore E. A., Stepchenkova E. I., Wendt K. L., Northam M. R., Shcherbakova P. V. Multiple roles of yeast Rev1 in the mutagenic response to replisome defects // Keystone Symposium on DNA Replication and Recombination, February 27 - March 4, 2011, Keystone, CO, USA, (poster; abstract is published in the symposium abstracts, p. 115)
Moskalenko S., Lomert E., Zhouravleva G. Searching for a new factors which influence to SUP35 and SUP45 gene transcription of yeast Saccharomyces cerevisiae. EMBO conference Gene Transcription in yeast: from Mechanisms to Gene Regulatory Networks. 16-21 June, 2012, Girona, Spain. P.158.
Nina S. Kuz’mina, Victoriya S. Suskova, Anna V. Aghajanyan, Igor I. Suskov. The problem of induced genomic instability in children born from irradiated parents: individual peculiarities of expression, significance of genotype, role in biological resistance of an organism // Seminar of Ecology. April 26-28. 2012, Sofia.
Nizhnikov A.A., Magomedova Z.M., Kondrashkina A.M., Galkin A.P. [NSI+] determinant affects readthrough of termination codons by reducing the SUP45 mRNA amounts // The 4th EMBO meeting, 2012, Nice, 22-25 September, abstracts, 2012, V.1, P.97.
Northam M. R., Moore E. A., Mertz T. M., Stepchenkova E. I., Wendt K. L., Burgers P. M. J., Shcherbakova P. V. The role of Rev1 in copying structurally ambivalent genomic sequences // Gordon Research Conference on DNA Damage, Mutation and Cancer, March 25-30, 2012, Ventura, CA, USA. (poster; no publication)
Northam M. R., Moore E. A., Mertz T. M., Stepchenkova E. I., Wendt K. L., Burgers P. M. J. and Polina V. Shcherbakova Yeast DNA polymerases zeta and Rev1 aid in the bypass of non-canonical secondary structures in DNA // 14th Annual Midwest DNA Repair Symposium, May 19-20 , Cincinnati, OH, USA. (talk, abstract is published in the symposium abstracts, p. 25)
Northam M. R., Moore E. A., Mertz T. M., Binz S. K., Stith C. M., Stepchenkova E. I., Kathern L. Wendt, Peter M. J. Burgers and Polina V. Shcherbakova Yeast DNA polymerases zeta and Rev1 aid in the bypass of non-canonical secondary structures in DNA // Gordon Research Conference on Mutagenesis, August 19-24, 2012, Newport, RI, USA.
Rogoza T., P. Drozdova, E. Radchenko, M. Khokhrina, L. Mironova. The Sfp1p, a positive regulator of SUP35 transcription, retains this effect after prion conversion. EMBO Conference Gene Transcription in Yeast. 16-21 June, Girona, Spain.
Salnikova L.E., T.V. Smelaya, V.V. Moroz, A.M. Golubev. “Genetic variants associated with community-acquired pneumonia” Доклад на 10-м международном симпозиуме «Critical Conditions: Pathogenesis, diagnosis, treatment» within the bounds of Slovak Society of Anesthesiology and Intensive Medicine Congress, May 12-19, 2012, Moscow-Vien-Piestany.
Spangenberg V. E., Dadashev S.I., Kolomiets O.L., Bogdanov Yu. F. Transposable Elements as the structural component of meiotic chromosomes in human and mouse // Proceedings of the 2nd International Congress on Transposable genetic elements. Saint Malo. France. 2012. P. 110.
Svetlana Y. Sorokina, Boris V. Andrianov, Denis A. Romanov, Prohor A. Proshakov, Vladimir G. Mitrofanov Intraspecific structure of D. littoralis Meigen (Diptera: Drosophilidae) // 53rd Annual Drosophila Research Conference. Chicago, IL. March 7 – March 11. 2012. P. 270. 518B.
Tikhenko N., Tsvetkova N., Houben A., Rutten T., Senula A., Keller J., Voylokov A., Börner A. Embryo lethality in wheat-rye hybrids – a confirmation of the Dobzhansky-Müller model // Pross. of the 11th Gatersleben Research Conference , 23-25 April 2012, Gatersleben, Germany, p. 35. Международная конференция, доклад

2011

развернуть

В 2011 г. сотрудниками ИОГен РАН опубликовано 105 научных статей, в том числе 42 - в международных журналах.

Zakharevich N.V., Osolodkin D.I., Artamonova I.I., Palyulin V.A., Zefirov N.S., Danilenko V.N. Signatures of the ATP binding pocket as a basis for structural classification of the serine/threonine protein kinases of gram-positive bacteria. // Proteins. 2012.
Kapelinskaya T., Martynova E., Schal C., Mukha D. Expression strategy of densonucleosis virus from the German cockroach, Blattella germanica // Journal of Virology. 2011. 85(22): 11855-11870.
Balanovsky O., Dibirova Kh., Dybo A., Mudrak O., Frolova S., E. Pocheshkhova, Haber M., Platt D., Schurr T., Haak W., Kuznetsova M., Radzhabov M., Balaganskaya O., Romanov A., Zakharova T., Baranova E., Hernanz D. F. S., Zalloua P., Koshel S., Ruhlen M., Renfrew C., Wells R.S., Tyler-Smith Ch., Balanovska E. The Genographic Consortium. Parallel Evolution of Genes and Languages in the Caucasus Region // Molecular biology and evolution. 2011. 28(10): P 2905-2920.
Philonenko E.S., Shutova M.V., Chestkov I.V., Lagarkova M.A., Kiselev S.L. Current progress and potential practical application for human pluripotent stem cells. // Int Rev Cell Mol Biol. 2011. 292:153-96.
Sobolev VV, Starodubtseva NL, Piruzyan AL, Minnibaev MT, Sautin ME, Tumanov VP, Bruskin SA. Comparative study of the expression of ATF-3 and ATF-4 genes in vessels involved into atherosclerosis process and in psoriatic skin. // Bull Exp Biol Med. 2011; 151(6):713-6.
Прозоров А.А., Зайчикова М.В., Даниленко В.Н. Мутанты Mycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью: история появления, генетические и молекулярные механизмы устойчивости, возникающие проблемы // Генетика. 2011. 47(12):1-16.
Сальникова Л.Е., Чумаченко А.Г., Лаптева Н.Ш., Веснина И.Н., Кузнецова Г.И., Рубанович А.В. Аллельные варианты полиморфных генов, сопряженные с повышенной частотой хромосомных аберраций // Генетика. 2011. 47(10): 117-125.
Евсюков А.Н., Морозова И.Ю. Расчет генетических расстояний между популяциями при разном объеме выборок // Генетика. 2011. 47(7): 986-990.
Стародубцева Н.Л., Соболев В.В., Соболева А.Г., Николаев А.А., Брускин С.А.. Экспрессия генов металлопротеаз (ММР-1, ММР-2, ММР-9, ММР-12) при псориазе // Генетика. 2011. 47(9): 1254–1261.
Одинцова Т.И., Васильева И.М., Коростылева Т.В., Уткина Л.Л., Славохотова А.А., Рогожин Е.А., Шиян А.Н., Пухальский В.А., Засухина Г.Д. Антимутагенная активность бета-пуротионина пшеницы ТК-АМР-ВР // Генетика. 2011. 47:1267-70.
Степанов В.А., Балановский О. П., Мельников А.В., Лаш-Завада А.Ю., Харьков В.Н., Тяжелова Т.В., Ахметова В. Л., Жукова О. В., Шнейдер Ю. В., Шильникова И. Н., Боринская С. А., Марусин А. В., Спиридонова М. Г., Симонова К. В., Хитринская И. Ю., Раджабов М. О., Романов А. Г., Штыгашева О. В., Кошель С. М., Балановская Е. В., Рыбакова А. В., Хуснутдинова Э. К., Пузырев В. П., Янковский Н. К. Характеристика популяций Российской Федерации по панели пятнадцати локусов, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе // Acta Naturаe. 2011. 3. № 2 (9): 59-71.

2006-2010

развернуть

В 2006-2010 годах сотрудниками ИОГен РАН было опубликовано 486 статей в отечественных и зарубежных рецензируемых научных журналах.

Монографии
1. Altukhov Y. P. Intraspecific Genetic Diversity: Monitoring, Conservation and Management. Heidelberg: Springer-Verlag, 2006. 440 p.
2. И.Г.Моисеева, С.В. Уханов, Ю.А. Столповский, Г.Е.Сулимова, С.В. Каштанов. Генофонды сельскохозяйственных животных: генетические ресурсы животноводства России (отв. редактор - член-корр. РАН, проф. И.А. Захаров). Изд-во «Наука», Москва. 2006. 478 с.
3 .Ю.Ф.Богданов, О.Л.Коломиец. Синаптонемный комплекс – индикатор динамики мейоза и хромосомной изменчивости. М. КМК. 2006. 328 с.
4. Столповский Ю.А., Захаров И.А. Генофонды отечественных пород – национальное богатство России. М.: 2007. 48 с.
5. Захаров-Гезехус И.А. Проблема гомологии в эволюционной биологии. М.: 2008. РИИС ФИАН. 128 с.
6. Г.Д. Рябова, В.О. Климонов, Е.И. Шишанова. Генетическая изменчивость в природных популяциях и доместицированных стадах осетровых рыб России. Атлас аллозимов. М.: 2009. 92 с.
7. А.А. Жученко. Экологическая генетика культурных растений как самостоятельная научная дисциплина. Теория и практика. Краснодар.: 2010. Просвещение-Юг. 485 с.

Учебные пособия
1. Г.Е. Сулимова, И.Г. Удина, В.В. Зинченко. Анализ полиморфизма ДНК с использованием метода полимеразной цепной реакции. Методическое пособие к практикуму по молекулярной генетике на кафедре генетики Биологического факультета МГУ. Изд-во ООО «МАКС Пресс», Москва. 2006. 77 с.
2. В.А.Пухальский. Введение в генетику. М. Изд-во КолосС. 2007. 224 с.
3. В.А.Пухальский, А.А. Соловьев, Е.Д. Бадаева, В.Н.Юрцев Практикум по цитологии и цитогенетике растений. М. Изд-во КолосС. 2007. 198 с.
4. С.Г. Инге-Вечтомов (ред). Общая генетика. Методическое пособие. 2008. II- е издание. // СПб, Изд. Н-Л. 123 с.
5. А.Ф. Сайфитдинова. Двумерная флуоросцентная микроскопия для анализа биологических образцов. Учебно-методическое пособие. // - СПб.: «СОЛО», 2008. – 72с. ISBN 978-5-983-207-2.
6. В.А. Тарасов, Т.А. Ежова, О.А.Огаркова, А.В. Усатов Принципы и методы определения функции генов высших растений. Ростов-на-Дону.: 2009. СКНЦ ВШ ЮФУ. 100 с.
6. С.Г. Инге-Вечтомов. Генетика с основами селекции. Учебник для ВУЗов. Изд. Н-Л. 2010. 171 с.
7. Гераськин С.А., Сарапульцева Е.И., Цаценко Л.В., Глазер В.М., Абилев С.К., Смирнова С.Г., Замулаева И.А., Комарова Л.Н., Степченкова Е.И., Инге-Вечтомов С.Г., Ким А.И., Крутенко Д.В., Евсеева Т.И., Михайлова Г.Ф., Амосова Н.В. Биологический контроль окружающей среды: генетический мониторинг. Учебное пособие для студентов высшего профессионального образования. Под ред. С.А. Гераськина и Е.И. Сарапульцевой. – М.: Издательский центр «Академия». 2010. 208 с.
8. Поморцев А.А., Лялина Е.В., Арямкина В.Н. Лабораторная оценка сортовых качеств семян// Учебное пособие «Основы сертификации семян сельскохозяйственных растений и ее структурные элементы»/ под ред. А.Н. Березкина, А.М. Малько, В.В. Пыльнева. М.: Изд-во РГАУ-МСХА им. К.А. Тимирязева. 2010. Гл. 4.3.3, с. 138-148.

Научно-популярные издания
С.А. Боринская, Н.К. Янковский. Люди и их гены: нити судьбы. Фрязино, "Век-2", 2006, 2009. 64 с.

Сборники
1. Материалы Международной Конференции «Генетика в России и мире», посвященной 40-летию Института общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН. М .2006
2. Динамика генофондов (материалы отчетной конференции 2006 г.). М.: 2007. 233 с.
3. Динамика генофондов (материалы отчетной конференции, посвященной памяти академика Ю.П.Алтухова ). М.: 2007. 223 с.
4. Генетика и селекция растений, основанная на современных генетических знаниях и технологиях». Тезисы Международной научной школы-конференции молодых ученых. Звенигород.: 2008. 80 с.
5. «Всероссийский съезд генетиков и селекционеров, посвященный 200-летию со дня рождения Ч. Дарвина»» Сборник докладов участников и Научная Программа. М.: 2009 г. РГФУ-МСХФ.
5. «К столетию академика Н.П. Дубинина» по материалам научной конференции «Генетика на рубеже веков». М.: 2009. Наука. 254 с. Составители: Л.Г. Дубинина, И.Н. Овчинникова. Ответственные редакторы: акад. А.А.Жученко, член-корр. Н.К. Янковский.

2002-2005

развернуть

1997-2001

развернуть

В 1997-2001 годах сотрудниками ИОГен РАН было опубликовано 418 статей в отечественных и зарубежных рецензируемых научных журналах.

Монографии
1. Алтухов Ю.П., Салменкова Е.А., Омельченко В.Т. Популяционная генетика лососевых рыб // Наука. М. 1997. 288 с.
2. Столповский Ю.А. Консервация генетических ресурсов сельскохозяйственных животных: проблемы и принципы их решения // М. Эребус. 1977. 112 с.
3. Восточные славяне. Антропология и этническая история. (Отв. Ред. член-корр.РАН Т.И.Алексеева). М. Научный мир. 1999. 336 с.
4. Захаров И.А. Краткие очерки по истории генетики // Биоинформсервис. М.1999. 72 с.
5. Померанцева М.Д., Рамайя Л.К. Генетические эффекты повышенного фона радиации у мышей в Чернобыльской зоне радиоактивного загрязнения // Наука. М. 1999.112 с.
6. Дубинин Н.П. Избранные труды. Т.1. Проблемы гена и эволюции // Наука. М. 2000. 546 с.
7. Дубинин Н.П. Избранные труды. Т.2. Радиационный и химический мутагенез // Наука. М. 2000. 406 с.
8. Захаров И.А. Николай Иванович Вавилов и страницы истории советской генетики // М. 2000. 128 с.
9. Генофонд и геногеография народонаселения. Т.1. Генофонд населения России и сопредельных стран. (под ред. Рычкова Ю.Г.) // Наука. СПб. 2000. 611 с.
10. Altukhov Yu.P., Salmenkova E.A., Omelchenko V.T. Salmonid Fishes: Population biology, Genetiks and Management // Oxford. Blackwell Science. 2000. 375 p.
11. Shevchenko V.A., Kalchenko V.A., Abramov V.I., Shevchenko V.V., Grinikh L.I. Genetic effects in plant populations in the zones of the Kyshtym and Chernoibyl accidents. Low Doses of Radiation: Are they Dangerous? // Nova Science Publishers, Inc. Huntington. New York. 2000. 378 p.
12. Акифьев А.П. Генетика и судьбы // Центрополиграф. Москва. 2001. 353 с.
13. Избранные труды академика Н.П. Дубинина. Экологическая и космическая генетика. Т. 3. Селекция // Наука. Москва. 2001. 527 с.
14. Николай Иванович Вавилов. Научное наследие в письмах. Т. 4. Международная переписка. // Наука. М. 2001. 324 с.

Сборники
1. Жукова Л.А., Глотов Н.В., Животовский Л.А. Экология и генетика популяций // МарГУ. Йошкар Ола. 1998. 332 с.
2. Сборник тезисов докладов и стендовых сообщений Международной конференции «Проблемы радиационной генетики на рубеже веков» // М. 2000. Изд-во Университета дружбы народов. 368 с.
3. Сборник тезисов докладов и стендовых сообщений научной конференции, посвященной памяти Грегора Менделя // М. 2001. Изд-во МСХА. 182 с.
4. Сборник тезисов докладов и стендовых сообщений Международного симпозиума «Молекулярные механизмы генетических процессов и биотехнология» и Сателлитного мини-симпозиума молодых ученых «Молекулярная генетика и биотехнология» // Москва. 2001. 448 с.
5. Abstr. of International Symposium “Molecular mechanisms of genetic processes and biotechnology”// M. 2001. 400 p.
6. Сб. Эволюция, экология, биоразнообразие. Материалы конференции, посвященной памяти Н.Н.Воронцова // М. 2001. Изд-во Учебно-научного центра довузовского образования. 298 с.

Учебные пособия
1. Методическое пособие к практикуму по генетике растений на Кафедре генетики и селекции Биологического факультета МГУ: Т.А.Ежова, О.А.Огаркова, О.П.Солдатова. «Инсерционный мутагенез» // Диалог МГУ. 1997. С.44.
2. Эрнст Л.К., Шишков В.П., Орлова А.Р., Павленко С.П., Сулимова Г.Е., Удина И.Г. «Методические рекомендации «Молекулярно-генетические и статистические методы изучения главного комплекса гистосовместимости крупного рогатого скота в связи с устойчивостью и восприимчивостью к лейкозам» // М. 1998. С. 30.
3. Методическое пособие к Большому практикуму по генетике на Кафедре генетики и селекции Биологического факультета МГУ: Д.В.Политов, Е.А.Салменкова, В.М.Глазер. «Метод электрофоретического анализа изоферментных систем: изучение генетического полиморфизма белков в популяциях» // Диалог МГУ.1999. 22 c.
4. Методическое пособие к Большому практикуму по генетике на Кафедре генетики и селекции Биологического факультета МГУ: Г.Е.Сулимова, В.В.Зинченко «Анализ полиморфизма ДНК с использованием метода полимеразной цепной реакции» // Диалог МГУ.1999. 43 c.
5. Орлова Н.Н., Глазер А.И., Ким А.И., Кокшарева Т.А., Алтухов Ю.П. Сборник задач по общей генетике // МГУ. М. 2001 г. 142 с.